Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIL2

Ccl28, C-C motif chemokine 28, mousemouse

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Length 130 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl28Q9JIL2 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Ccl28Q9JIL2 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ccl28Q9JIL2 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ccl28Q9JIL2 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ccl28Q9JIL2 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ccl28Q9JIL2 Kifap3-202ENSMUST00000077642 4012 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ccl28Q9JIL2 Wwtr1-201ENSMUST00000029380 4697 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ccl28Q9JIL2 Vsig10l-201ENSMUST00000107977 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ccl28Q9JIL2 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ccl28Q9JIL2 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ccl28Q9JIL2 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ccl28Q9JIL2 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ccl28Q9JIL2 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ccl28Q9JIL2 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ccl28Q9JIL2 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ccl28Q9JIL2 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ccl28Q9JIL2 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Ccl28Q9JIL2 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ccl28Q9JIL2 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ccl28Q9JIL2 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ccl28Q9JIL2 Rab10os-203ENSMUST00000178074 4006 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ccl28Q9JIL2 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Ccl28Q9JIL2 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ccl28Q9JIL2 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ccl28Q9JIL2 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Ccl28Q9JIL2 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ccl28Q9JIL2 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ccl28Q9JIL2 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ccl28Q9JIL2 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Ccl28Q9JIL2 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ccl28Q9JIL2 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ccl28Q9JIL2 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ccl28Q9JIL2 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Ccl28Q9JIL2 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ccl28Q9JIL2 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ccl28Q9JIL2 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ccl28Q9JIL2 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ccl28Q9JIL2 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ccl28Q9JIL2 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ccl28Q9JIL2 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ccl28Q9JIL2 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ccl28Q9JIL2 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ccl28Q9JIL2 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Ccl28Q9JIL2 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ccl28Q9JIL2 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ccl28Q9JIL2 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ccl28Q9JIL2 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ccl28Q9JIL2 Tsga10-202ENSMUST00000088072 3837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ccl28Q9JIL2 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ccl28Q9JIL2 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ccl28Q9JIL2 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ccl28Q9JIL2 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ccl28Q9JIL2 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ccl28Q9JIL2 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ccl28Q9JIL2 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ccl28Q9JIL2 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ccl28Q9JIL2 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ccl28Q9JIL2 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ccl28Q9JIL2 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ccl28Q9JIL2 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ccl28Q9JIL2 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ccl28Q9JIL2 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ccl28Q9JIL2 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ccl28Q9JIL2 Arap1-202ENSMUST00000084896 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ccl28Q9JIL2 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
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Ccl28Q9JIL2 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Ccl28Q9JIL2 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ccl28Q9JIL2 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Ccl28Q9JIL2 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ccl28Q9JIL2 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
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Ccl28Q9JIL2 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Ccl28Q9JIL2 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ccl28Q9JIL2 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ccl28Q9JIL2 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ccl28Q9JIL2 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ccl28Q9JIL2 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ccl28Q9JIL2 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ccl28Q9JIL2 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ccl28Q9JIL2 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Ccl28Q9JIL2 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ccl28Q9JIL2 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Ccl28Q9JIL2 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Ccl28Q9JIL2 Mtr-201ENSMUST00000099856 8294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ccl28Q9JIL2 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ccl28Q9JIL2 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ccl28Q9JIL2 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ccl28Q9JIL2 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ccl28Q9JIL2 Shank2-202ENSMUST00000105900 8169 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ccl28Q9JIL2 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ccl28Q9JIL2 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ccl28Q9JIL2 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ccl28Q9JIL2 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ccl28Q9JIL2 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ccl28Q9JIL2 Epm2aip1-202ENSMUST00000135807 4245 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ccl28Q9JIL2 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
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