Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQR3

Kcnn1, Small conductance calcium-activated potassium channel protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 537 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnn1Q9EQR3 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Kcnn1Q9EQR3 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Kcnn1Q9EQR3 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Kcnn1Q9EQR3 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Kcnn1Q9EQR3 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Kcnn1Q9EQR3 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Kcnn1Q9EQR3 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Kcnn1Q9EQR3 Gm45719-201ENSMUST00000207954 1662 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Kcnn1Q9EQR3 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Kcnn1Q9EQR3 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Kcnn1Q9EQR3 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Kcnn1Q9EQR3 Gm11413-201ENSMUST00000155822 1461 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Kcnn1Q9EQR3 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Kcnn1Q9EQR3 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Kcnn1Q9EQR3 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Kcnn1Q9EQR3 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Kcnn1Q9EQR3 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Kcnn1Q9EQR3 Gm20426-201ENSMUST00000173657 440 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Kcnn1Q9EQR3 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Kcnn1Q9EQR3 Krtap22-2-201ENSMUST00000178913 380 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Kcnn1Q9EQR3 1110002L01Rik-203ENSMUST00000179637 586 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Kcnn1Q9EQR3 B230110C06Rik-201ENSMUST00000181388 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Kcnn1Q9EQR3 Hpf1-201ENSMUST00000037190 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Kcnn1Q9EQR3 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Kcnn1Q9EQR3 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Kcnn1Q9EQR3 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Kcnn1Q9EQR3 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Kcnn1Q9EQR3 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Kcnn1Q9EQR3 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Kcnn1Q9EQR3 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Kcnn1Q9EQR3 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Kcnn1Q9EQR3 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Kcnn1Q9EQR3 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Kcnn1Q9EQR3 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Kcnn1Q9EQR3 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Kcnn1Q9EQR3 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Kcnn1Q9EQR3 Gm45885-202ENSMUST00000211520 1383 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Kcnn1Q9EQR3 Batf2-201ENSMUST00000045042 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Kcnn1Q9EQR3 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Kcnn1Q9EQR3 Gm10787-201ENSMUST00000099552 1548 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Kcnn1Q9EQR3 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Kcnn1Q9EQR3 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Kcnn1Q9EQR3 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Kcnn1Q9EQR3 Arsa-202ENSMUST00000165199 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Kcnn1Q9EQR3 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Kcnn1Q9EQR3 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Kcnn1Q9EQR3 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Kcnn1Q9EQR3 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Kcnn1Q9EQR3 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Kcnn1Q9EQR3 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Kcnn1Q9EQR3 Taf6l-202ENSMUST00000010249 848 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Kcnn1Q9EQR3 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Kcnn1Q9EQR3 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Kcnn1Q9EQR3 Gm16099-202ENSMUST00000151873 660 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Kcnn1Q9EQR3 Tmem116-209ENSMUST00000156080 1184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Kcnn1Q9EQR3 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Kcnn1Q9EQR3 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Kcnn1Q9EQR3 C730036E19Rik-201ENSMUST00000188305 1102 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Kcnn1Q9EQR3 Gm28701-201ENSMUST00000189778 1010 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Kcnn1Q9EQR3 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Kcnn1Q9EQR3 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Kcnn1Q9EQR3 Gm44889-201ENSMUST00000207674 1019 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Kcnn1Q9EQR3 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Kcnn1Q9EQR3 Olfr858-ps1-201ENSMUST00000212591 930 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Kcnn1Q9EQR3 AC129323.1-201ENSMUST00000216733 470 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Kcnn1Q9EQR3 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Kcnn1Q9EQR3 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Kcnn1Q9EQR3 AC154594.1-201ENSMUST00000225171 1273 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Kcnn1Q9EQR3 AC154738.2-201ENSMUST00000227403 1110 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Kcnn1Q9EQR3 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Kcnn1Q9EQR3 Vmn1r74-201ENSMUST00000050416 915 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Kcnn1Q9EQR3 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Kcnn1Q9EQR3 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Kcnn1Q9EQR3 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Kcnn1Q9EQR3 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Kcnn1Q9EQR3 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Kcnn1Q9EQR3 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Kcnn1Q9EQR3 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Kcnn1Q9EQR3 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Kcnn1Q9EQR3 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Kcnn1Q9EQR3 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Kcnn1Q9EQR3 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Kcnn1Q9EQR3 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Kcnn1Q9EQR3 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Kcnn1Q9EQR3 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Kcnn1Q9EQR3 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Kcnn1Q9EQR3 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Kcnn1Q9EQR3 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Kcnn1Q9EQR3 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Kcnn1Q9EQR3 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Kcnn1Q9EQR3 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Kcnn1Q9EQR3 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Kcnn1Q9EQR3 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Kcnn1Q9EQR3 Med21-203ENSMUST00000111650 572 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Kcnn1Q9EQR3 Gm14358-201ENSMUST00000118458 403 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Kcnn1Q9EQR3 Anp32a-205ENSMUST00000135395 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Kcnn1Q9EQR3 Gm16036-201ENSMUST00000150385 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Kcnn1Q9EQR3 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Kcnn1Q9EQR3 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Kcnn1Q9EQR3 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58 ms