Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPZ6

Tbx18, T-box transcription factor TBX18, mousemouse

Predictions only

Length 613 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tbx18Q9EPZ6 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tbx18Q9EPZ6 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tbx18Q9EPZ6 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tbx18Q9EPZ6 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tbx18Q9EPZ6 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Tbx18Q9EPZ6 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tbx18Q9EPZ6 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tbx18Q9EPZ6 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tbx18Q9EPZ6 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tbx18Q9EPZ6 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Tbx18Q9EPZ6 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tbx18Q9EPZ6 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tbx18Q9EPZ6 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tbx18Q9EPZ6 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tbx18Q9EPZ6 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Tbx18Q9EPZ6 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tbx18Q9EPZ6 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tbx18Q9EPZ6 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tbx18Q9EPZ6 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Tbx18Q9EPZ6 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Tbx18Q9EPZ6 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tbx18Q9EPZ6 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tbx18Q9EPZ6 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tbx18Q9EPZ6 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tbx18Q9EPZ6 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tbx18Q9EPZ6 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tbx18Q9EPZ6 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Tbx18Q9EPZ6 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tbx18Q9EPZ6 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tbx18Q9EPZ6 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tbx18Q9EPZ6 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tbx18Q9EPZ6 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tbx18Q9EPZ6 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tbx18Q9EPZ6 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tbx18Q9EPZ6 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tbx18Q9EPZ6 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tbx18Q9EPZ6 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tbx18Q9EPZ6 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tbx18Q9EPZ6 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tbx18Q9EPZ6 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tbx18Q9EPZ6 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tbx18Q9EPZ6 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tbx18Q9EPZ6 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tbx18Q9EPZ6 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tbx18Q9EPZ6 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tbx18Q9EPZ6 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tbx18Q9EPZ6 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tbx18Q9EPZ6 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tbx18Q9EPZ6 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tbx18Q9EPZ6 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tbx18Q9EPZ6 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tbx18Q9EPZ6 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tbx18Q9EPZ6 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tbx18Q9EPZ6 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tbx18Q9EPZ6 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tbx18Q9EPZ6 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tbx18Q9EPZ6 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Tbx18Q9EPZ6 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Tbx18Q9EPZ6 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tbx18Q9EPZ6 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tbx18Q9EPZ6 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tbx18Q9EPZ6 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tbx18Q9EPZ6 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tbx18Q9EPZ6 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tbx18Q9EPZ6 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Tbx18Q9EPZ6 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tbx18Q9EPZ6 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Tbx18Q9EPZ6 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Tbx18Q9EPZ6 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Tbx18Q9EPZ6 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Tbx18Q9EPZ6 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tbx18Q9EPZ6 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tbx18Q9EPZ6 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tbx18Q9EPZ6 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tbx18Q9EPZ6 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tbx18Q9EPZ6 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tbx18Q9EPZ6 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tbx18Q9EPZ6 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Tbx18Q9EPZ6 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tbx18Q9EPZ6 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tbx18Q9EPZ6 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tbx18Q9EPZ6 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tbx18Q9EPZ6 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tbx18Q9EPZ6 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tbx18Q9EPZ6 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tbx18Q9EPZ6 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tbx18Q9EPZ6 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tbx18Q9EPZ6 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tbx18Q9EPZ6 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tbx18Q9EPZ6 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tbx18Q9EPZ6 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tbx18Q9EPZ6 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tbx18Q9EPZ6 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tbx18Q9EPZ6 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tbx18Q9EPZ6 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tbx18Q9EPZ6 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tbx18Q9EPZ6 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tbx18Q9EPZ6 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tbx18Q9EPZ6 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Tbx18Q9EPZ6 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.2 ms