Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCN7

Rnft1, E3 ubiquitin-protein ligase RNFT1, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnft1Q9DCN7 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Rnft1Q9DCN7 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Rnft1Q9DCN7 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Rnft1Q9DCN7 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Rnft1Q9DCN7 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Rnft1Q9DCN7 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Rnft1Q9DCN7 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Rnft1Q9DCN7 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Rnft1Q9DCN7 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Rnft1Q9DCN7 Traf7-201ENSMUST00000070777 2384 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Rnft1Q9DCN7 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Rnft1Q9DCN7 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Rnft1Q9DCN7 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Rnft1Q9DCN7 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Rnft1Q9DCN7 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Rnft1Q9DCN7 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Rnft1Q9DCN7 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Rnft1Q9DCN7 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Rnft1Q9DCN7 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Rnft1Q9DCN7 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Rnft1Q9DCN7 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Rnft1Q9DCN7 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Rnft1Q9DCN7 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Rnft1Q9DCN7 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Rnft1Q9DCN7 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Rnft1Q9DCN7 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Rnft1Q9DCN7 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Rnft1Q9DCN7 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Rnft1Q9DCN7 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Rnft1Q9DCN7 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Rnft1Q9DCN7 Gm26703-201ENSMUST00000181370 2864 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Rnft1Q9DCN7 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Rnft1Q9DCN7 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Rnft1Q9DCN7 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Rnft1Q9DCN7 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Rnft1Q9DCN7 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Rnft1Q9DCN7 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Rnft1Q9DCN7 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Rnft1Q9DCN7 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Rnft1Q9DCN7 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Rnft1Q9DCN7 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Rnft1Q9DCN7 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Rnft1Q9DCN7 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Rnft1Q9DCN7 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Rnft1Q9DCN7 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Rnft1Q9DCN7 Zfyve1-203ENSMUST00000221919 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Rnft1Q9DCN7 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Rnft1Q9DCN7 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Rnft1Q9DCN7 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Rnft1Q9DCN7 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Rnft1Q9DCN7 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Rnft1Q9DCN7 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Rnft1Q9DCN7 Mtmr10-201ENSMUST00000032736 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Rnft1Q9DCN7 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Rnft1Q9DCN7 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Rnft1Q9DCN7 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Rnft1Q9DCN7 Nol4l-202ENSMUST00000109784 5610 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Rnft1Q9DCN7 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Rnft1Q9DCN7 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Rnft1Q9DCN7 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Rnft1Q9DCN7 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Rnft1Q9DCN7 Gm42943-201ENSMUST00000199676 3242 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Rnft1Q9DCN7 Galnt11-202ENSMUST00000114950 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Rnft1Q9DCN7 Dysf-212ENSMUST00000203695 6504 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Rnft1Q9DCN7 2900026A02Rik-203ENSMUST00000212276 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Rnft1Q9DCN7 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Rnft1Q9DCN7 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Rnft1Q9DCN7 Fmo2-202ENSMUST00000111510 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Rnft1Q9DCN7 Eps15l1-201ENSMUST00000163643 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Rnft1Q9DCN7 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Rnft1Q9DCN7 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Rnft1Q9DCN7 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Rnft1Q9DCN7 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Rnft1Q9DCN7 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Rnft1Q9DCN7 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Rnft1Q9DCN7 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Rnft1Q9DCN7 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Rnft1Q9DCN7 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Rnft1Q9DCN7 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Rnft1Q9DCN7 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Rnft1Q9DCN7 Gm44487-201ENSMUST00000205145 325 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Rnft1Q9DCN7 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Rnft1Q9DCN7 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Rnft1Q9DCN7 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Rnft1Q9DCN7 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Rnft1Q9DCN7 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Rnft1Q9DCN7 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Rnft1Q9DCN7 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Rnft1Q9DCN7 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Rnft1Q9DCN7 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Rnft1Q9DCN7 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Rnft1Q9DCN7 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Rnft1Q9DCN7 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Rnft1Q9DCN7 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Rnft1Q9DCN7 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Rnft1Q9DCN7 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Rnft1Q9DCN7 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Rnft1Q9DCN7 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Rnft1Q9DCN7 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.47
Rnft1Q9DCN7 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79 ms