Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC33

Hmg20a, High mobility group protein 20A, mousemouse

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Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmg20aQ9DC33 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hmg20aQ9DC33 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hmg20aQ9DC33 Sgk1-203ENSMUST00000100036 2476 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hmg20aQ9DC33 Sgk1-201ENSMUST00000020145 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hmg20aQ9DC33 Ttll10-202ENSMUST00000051509 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hmg20aQ9DC33 Nono-201ENSMUST00000033673 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hmg20aQ9DC33 Madd-208ENSMUST00000111370 5879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hmg20aQ9DC33 Madd-214ENSMUST00000111381 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hmg20aQ9DC33 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hmg20aQ9DC33 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hmg20aQ9DC33 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hmg20aQ9DC33 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hmg20aQ9DC33 Spr-ps1-203ENSMUST00000187705 2892 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Hmg20aQ9DC33 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hmg20aQ9DC33 Gm13093-201ENSMUST00000126212 2485 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hmg20aQ9DC33 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hmg20aQ9DC33 Arhgef16-207ENSMUST00000169623 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hmg20aQ9DC33 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hmg20aQ9DC33 Gm15941-205ENSMUST00000140044 1825 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hmg20aQ9DC33 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hmg20aQ9DC33 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hmg20aQ9DC33 Prkag3-201ENSMUST00000081636 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hmg20aQ9DC33 Abcb8-201ENSMUST00000073076 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hmg20aQ9DC33 Zfp398-201ENSMUST00000079881 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hmg20aQ9DC33 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hmg20aQ9DC33 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hmg20aQ9DC33 Tnc-201ENSMUST00000030056 6833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hmg20aQ9DC33 Ikzf2-202ENSMUST00000187184 2013 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hmg20aQ9DC33 Gm40377-201ENSMUST00000204604 2015 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Hmg20aQ9DC33 Zfp568-201ENSMUST00000074322 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hmg20aQ9DC33 Myh1-201ENSMUST00000018637 5938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hmg20aQ9DC33 Tiam1-203ENSMUST00000114122 4596 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hmg20aQ9DC33 Zbtb21-201ENSMUST00000052089 5410 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hmg20aQ9DC33 Megf8-201ENSMUST00000128119 10040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hmg20aQ9DC33 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hmg20aQ9DC33 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hmg20aQ9DC33 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hmg20aQ9DC33 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Hmg20aQ9DC33 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hmg20aQ9DC33 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hmg20aQ9DC33 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hmg20aQ9DC33 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hmg20aQ9DC33 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hmg20aQ9DC33 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hmg20aQ9DC33 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Hmg20aQ9DC33 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hmg20aQ9DC33 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hmg20aQ9DC33 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Hmg20aQ9DC33 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Hmg20aQ9DC33 Gm43172-201ENSMUST00000202139 2137 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Hmg20aQ9DC33 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hmg20aQ9DC33 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hmg20aQ9DC33 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hmg20aQ9DC33 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hmg20aQ9DC33 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hmg20aQ9DC33 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hmg20aQ9DC33 Tut1-201ENSMUST00000096239 2747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hmg20aQ9DC33 Gm42913-201ENSMUST00000197936 1853 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Hmg20aQ9DC33 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hmg20aQ9DC33 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hmg20aQ9DC33 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hmg20aQ9DC33 Fubp1-209ENSMUST00000198227 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hmg20aQ9DC33 Galnt10-201ENSMUST00000066987 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hmg20aQ9DC33 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hmg20aQ9DC33 Egfr-202ENSMUST00000102884 2943 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hmg20aQ9DC33 Togaram1-207ENSMUST00000223166 6386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hmg20aQ9DC33 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hmg20aQ9DC33 Ptprh-202ENSMUST00000166650 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hmg20aQ9DC33 Epha5-205ENSMUST00000113403 4675 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hmg20aQ9DC33 Lnx1-202ENSMUST00000087161 2753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hmg20aQ9DC33 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hmg20aQ9DC33 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hmg20aQ9DC33 Gtf2ird2-201ENSMUST00000016086 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hmg20aQ9DC33 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hmg20aQ9DC33 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hmg20aQ9DC33 Ift46-201ENSMUST00000002099 4169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hmg20aQ9DC33 Gm4869-201ENSMUST00000197549 2955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hmg20aQ9DC33 A130071D04Rik-201ENSMUST00000194467 5864 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Hmg20aQ9DC33 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hmg20aQ9DC33 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hmg20aQ9DC33 Mroh7-201ENSMUST00000106770 4346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hmg20aQ9DC33 Srp54b-202ENSMUST00000218879 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hmg20aQ9DC33 Tnfaip8l3-201ENSMUST00000098760 4403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hmg20aQ9DC33 Gm20427-201ENSMUST00000168978 3703 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hmg20aQ9DC33 Stx1b-201ENSMUST00000106267 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hmg20aQ9DC33 Reps1-201ENSMUST00000126390 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hmg20aQ9DC33 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hmg20aQ9DC33 Abcg4-201ENSMUST00000034648 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hmg20aQ9DC33 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hmg20aQ9DC33 C530043K16Rik-201ENSMUST00000201865 3109 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Hmg20aQ9DC33 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hmg20aQ9DC33 Zfp866-202ENSMUST00000137573 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hmg20aQ9DC33 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Hmg20aQ9DC33 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hmg20aQ9DC33 Gm4755-201ENSMUST00000181803 2647 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hmg20aQ9DC33 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hmg20aQ9DC33 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hmg20aQ9DC33 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hmg20aQ9DC33 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Hmg20aQ9DC33 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56 ms