Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC28

Csnk1d, Casein kinase I isoform delta, mousemouse

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk1dQ9DC28 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Csnk1dQ9DC28 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Csnk1dQ9DC28 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Csnk1dQ9DC28 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Csnk1dQ9DC28 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Csnk1dQ9DC28 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Csnk1dQ9DC28 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Csnk1dQ9DC28 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Csnk1dQ9DC28 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Csnk1dQ9DC28 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Csnk1dQ9DC28 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Csnk1dQ9DC28 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Csnk1dQ9DC28 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Csnk1dQ9DC28 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Csnk1dQ9DC28 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Csnk1dQ9DC28 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Csnk1dQ9DC28 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Csnk1dQ9DC28 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Csnk1dQ9DC28 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Csnk1dQ9DC28 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Csnk1dQ9DC28 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Csnk1dQ9DC28 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Csnk1dQ9DC28 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Csnk1dQ9DC28 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Csnk1dQ9DC28 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Csnk1dQ9DC28 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Csnk1dQ9DC28 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Csnk1dQ9DC28 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Csnk1dQ9DC28 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Csnk1dQ9DC28 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Csnk1dQ9DC28 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Csnk1dQ9DC28 Gm12715-201ENSMUST00000121430 1128 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Csnk1dQ9DC28 Gm12749-201ENSMUST00000122138 1159 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Csnk1dQ9DC28 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Csnk1dQ9DC28 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Csnk1dQ9DC28 Rprl1-202ENSMUST00000198476 238 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Csnk1dQ9DC28 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Csnk1dQ9DC28 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Csnk1dQ9DC28 Gm45881-201ENSMUST00000210659 517 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Csnk1dQ9DC28 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Csnk1dQ9DC28 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Csnk1dQ9DC28 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Csnk1dQ9DC28 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Csnk1dQ9DC28 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Csnk1dQ9DC28 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Csnk1dQ9DC28 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Csnk1dQ9DC28 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Csnk1dQ9DC28 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Csnk1dQ9DC28 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Csnk1dQ9DC28 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Csnk1dQ9DC28 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Csnk1dQ9DC28 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Csnk1dQ9DC28 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Csnk1dQ9DC28 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Csnk1dQ9DC28 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Csnk1dQ9DC28 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Csnk1dQ9DC28 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Csnk1dQ9DC28 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Csnk1dQ9DC28 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Csnk1dQ9DC28 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Csnk1dQ9DC28 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Csnk1dQ9DC28 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Csnk1dQ9DC28 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Csnk1dQ9DC28 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Csnk1dQ9DC28 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Csnk1dQ9DC28 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Csnk1dQ9DC28 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Csnk1dQ9DC28 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Csnk1dQ9DC28 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Csnk1dQ9DC28 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Csnk1dQ9DC28 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Csnk1dQ9DC28 Gm12012-201ENSMUST00000118857 1066 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Csnk1dQ9DC28 H2-M6-ps-201ENSMUST00000119193 1034 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Csnk1dQ9DC28 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Csnk1dQ9DC28 Gm18711-201ENSMUST00000199341 750 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Csnk1dQ9DC28 Gm44651-201ENSMUST00000207343 372 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Csnk1dQ9DC28 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Csnk1dQ9DC28 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Csnk1dQ9DC28 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Csnk1dQ9DC28 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Csnk1dQ9DC28 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Csnk1dQ9DC28 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Csnk1dQ9DC28 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Csnk1dQ9DC28 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Csnk1dQ9DC28 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Csnk1dQ9DC28 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Csnk1dQ9DC28 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Csnk1dQ9DC28 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Csnk1dQ9DC28 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Csnk1dQ9DC28 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Csnk1dQ9DC28 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Csnk1dQ9DC28 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Csnk1dQ9DC28 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Csnk1dQ9DC28 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Csnk1dQ9DC28 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Csnk1dQ9DC28 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Csnk1dQ9DC28 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Csnk1dQ9DC28 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC12.33□□□□□ -0.43
Csnk1dQ9DC28 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Csnk1dQ9DC28 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
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