Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Z1

Nop56, Nucleolar protein 56, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 580 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop56Q9D6Z1 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Nop56Q9D6Z1 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Nop56Q9D6Z1 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Nop56Q9D6Z1 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Nop56Q9D6Z1 Stat5a-203ENSMUST00000107357 3605 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Nop56Q9D6Z1 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Nop56Q9D6Z1 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Nop56Q9D6Z1 AC154404.1-201ENSMUST00000223601 2077 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Nop56Q9D6Z1 Pofut1-201ENSMUST00000049863 5600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Nop56Q9D6Z1 Dcaf8-202ENSMUST00000191689 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Nop56Q9D6Z1 Fn3krp-201ENSMUST00000038096 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Nop56Q9D6Z1 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Nop56Q9D6Z1 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Nop56Q9D6Z1 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Nop56Q9D6Z1 Als2cl-203ENSMUST00000130386 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Nop56Q9D6Z1 Gm4316-201ENSMUST00000212411 2617 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.35
Nop56Q9D6Z1 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Nop56Q9D6Z1 AC164441.2-201ENSMUST00000220818 2746 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Nop56Q9D6Z1 Trpm7-202ENSMUST00000103224 7107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Nop56Q9D6Z1 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Nop56Q9D6Z1 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Nop56Q9D6Z1 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Nop56Q9D6Z1 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Nop56Q9D6Z1 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Nop56Q9D6Z1 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Nop56Q9D6Z1 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Nop56Q9D6Z1 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Nop56Q9D6Z1 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Nop56Q9D6Z1 Amotl2-211ENSMUST00000153965 4222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Nop56Q9D6Z1 Rangap1-201ENSMUST00000052374 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Nop56Q9D6Z1 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Nop56Q9D6Z1 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Nop56Q9D6Z1 Tiparp-201ENSMUST00000047906 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Nop56Q9D6Z1 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Nop56Q9D6Z1 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Nop56Q9D6Z1 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Nop56Q9D6Z1 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Nop56Q9D6Z1 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Nop56Q9D6Z1 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Nop56Q9D6Z1 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Nop56Q9D6Z1 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Nop56Q9D6Z1 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Nop56Q9D6Z1 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Nop56Q9D6Z1 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Nop56Q9D6Z1 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Nop56Q9D6Z1 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Nop56Q9D6Z1 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Nop56Q9D6Z1 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Nop56Q9D6Z1 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Nop56Q9D6Z1 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Nop56Q9D6Z1 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Nop56Q9D6Z1 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Nop56Q9D6Z1 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Nop56Q9D6Z1 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Nop56Q9D6Z1 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Nop56Q9D6Z1 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Nop56Q9D6Z1 Zfp597-201ENSMUST00000090522 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Nop56Q9D6Z1 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Nop56Q9D6Z1 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Nop56Q9D6Z1 Sema3g-201ENSMUST00000090180 4540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Nop56Q9D6Z1 Nynrin-201ENSMUST00000100529 6990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Nop56Q9D6Z1 Gm5475-202ENSMUST00000148928 2320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Nop56Q9D6Z1 Preb-201ENSMUST00000074840 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Nop56Q9D6Z1 Stat5b-202ENSMUST00000107358 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Nop56Q9D6Z1 BC003331-203ENSMUST00000097546 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Nop56Q9D6Z1 Gm16083-201ENSMUST00000125681 2547 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Nop56Q9D6Z1 Apbb1-201ENSMUST00000081165 2530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Nop56Q9D6Z1 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Nop56Q9D6Z1 Pbrm1-208ENSMUST00000112098 6566 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Nop56Q9D6Z1 Tfr2-204ENSMUST00000196471 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Nop56Q9D6Z1 Abat-201ENSMUST00000065987 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Nop56Q9D6Z1 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Nop56Q9D6Z1 Zfand2a-202ENSMUST00000110851 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Nop56Q9D6Z1 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Nop56Q9D6Z1 Rps6ka6-202ENSMUST00000082034 4170 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Nop56Q9D6Z1 AC160411.1-201ENSMUST00000218544 4560 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Nop56Q9D6Z1 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Nop56Q9D6Z1 Evi5l-208ENSMUST00000176825 3728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Nop56Q9D6Z1 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Nop56Q9D6Z1 Wbp1l-201ENSMUST00000099376 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Nop56Q9D6Z1 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Nop56Q9D6Z1 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Nop56Q9D6Z1 Apobec1-201ENSMUST00000112585 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Nop56Q9D6Z1 Mtmr4-201ENSMUST00000092802 5525 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Nop56Q9D6Z1 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Nop56Q9D6Z1 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Nop56Q9D6Z1 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Nop56Q9D6Z1 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Nop56Q9D6Z1 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Nop56Q9D6Z1 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Nop56Q9D6Z1 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Nop56Q9D6Z1 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Nop56Q9D6Z1 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Nop56Q9D6Z1 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Nop56Q9D6Z1 Fbxl22-201ENSMUST00000056890 3935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Nop56Q9D6Z1 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Nop56Q9D6Z1 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Nop56Q9D6Z1 Gm10851-201ENSMUST00000192087 1685 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Nop56Q9D6Z1 AC154849.3-201ENSMUST00000223733 1660 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Nop56Q9D6Z1 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms