Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4F8

Tubgcp4, Gamma-tubulin complex component 4, mousemouse

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Length 667 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubgcp4Q9D4F8 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tubgcp4Q9D4F8 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tubgcp4Q9D4F8 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tubgcp4Q9D4F8 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tubgcp4Q9D4F8 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tubgcp4Q9D4F8 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tubgcp4Q9D4F8 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tubgcp4Q9D4F8 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tubgcp4Q9D4F8 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tubgcp4Q9D4F8 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tubgcp4Q9D4F8 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tubgcp4Q9D4F8 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tubgcp4Q9D4F8 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tubgcp4Q9D4F8 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tubgcp4Q9D4F8 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tubgcp4Q9D4F8 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tubgcp4Q9D4F8 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Tubgcp4Q9D4F8 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Tubgcp4Q9D4F8 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tubgcp4Q9D4F8 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tubgcp4Q9D4F8 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tubgcp4Q9D4F8 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tubgcp4Q9D4F8 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tubgcp4Q9D4F8 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tubgcp4Q9D4F8 1700011D18Rik-201ENSMUST00000205762 277 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Tubgcp4Q9D4F8 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
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Tubgcp4Q9D4F8 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tubgcp4Q9D4F8 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tubgcp4Q9D4F8 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tubgcp4Q9D4F8 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tubgcp4Q9D4F8 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tubgcp4Q9D4F8 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tubgcp4Q9D4F8 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tubgcp4Q9D4F8 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tubgcp4Q9D4F8 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tubgcp4Q9D4F8 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tubgcp4Q9D4F8 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
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Tubgcp4Q9D4F8 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tubgcp4Q9D4F8 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tubgcp4Q9D4F8 Plet1-201ENSMUST00000114474 1689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tubgcp4Q9D4F8 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tubgcp4Q9D4F8 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
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Tubgcp4Q9D4F8 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Tubgcp4Q9D4F8 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
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Tubgcp4Q9D4F8 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tubgcp4Q9D4F8 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tubgcp4Q9D4F8 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tubgcp4Q9D4F8 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
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Tubgcp4Q9D4F8 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
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Tubgcp4Q9D4F8 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tubgcp4Q9D4F8 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tubgcp4Q9D4F8 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
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Tubgcp4Q9D4F8 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tubgcp4Q9D4F8 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tubgcp4Q9D4F8 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tubgcp4Q9D4F8 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tubgcp4Q9D4F8 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tubgcp4Q9D4F8 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tubgcp4Q9D4F8 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Tubgcp4Q9D4F8 Utp23-203ENSMUST00000137116 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tubgcp4Q9D4F8 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tubgcp4Q9D4F8 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tubgcp4Q9D4F8 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tubgcp4Q9D4F8 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tubgcp4Q9D4F8 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tubgcp4Q9D4F8 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tubgcp4Q9D4F8 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tubgcp4Q9D4F8 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tubgcp4Q9D4F8 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tubgcp4Q9D4F8 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tubgcp4Q9D4F8 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tubgcp4Q9D4F8 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tubgcp4Q9D4F8 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tubgcp4Q9D4F8 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tubgcp4Q9D4F8 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tubgcp4Q9D4F8 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tubgcp4Q9D4F8 Gm4760-201ENSMUST00000119663 1030 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Tubgcp4Q9D4F8 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
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