Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2Q3

Uncharacterized protein C10orf88 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 444 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D2Q3 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q9D2Q3 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q9D2Q3 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q9D2Q3 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q9D2Q3 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Q9D2Q3 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q9D2Q3 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q9D2Q3 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q9D2Q3 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q9D2Q3 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q9D2Q3 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Q9D2Q3 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Q9D2Q3 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Q9D2Q3 AA914427-201ENSMUST00000193194 1166 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Q9D2Q3 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q9D2Q3 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q9D2Q3 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q9D2Q3 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q9D2Q3 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q9D2Q3 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q9D2Q3 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q9D2Q3 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q9D2Q3 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q9D2Q3 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q9D2Q3 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q9D2Q3 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q9D2Q3 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q9D2Q3 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q9D2Q3 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q9D2Q3 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q9D2Q3 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Q9D2Q3 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q9D2Q3 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q9D2Q3 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q9D2Q3 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q9D2Q3 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q9D2Q3 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q9D2Q3 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q9D2Q3 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q9D2Q3 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q9D2Q3 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q9D2Q3 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q9D2Q3 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q9D2Q3 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Q9D2Q3 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q9D2Q3 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q9D2Q3 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q9D2Q3 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Q9D2Q3 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Q9D2Q3 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q9D2Q3 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q9D2Q3 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q9D2Q3 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q9D2Q3 Gm25890-201ENSMUST00000177643 165 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Q9D2Q3 Rnu1b2-201ENSMUST00000178073 165 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Q9D2Q3 Rnu1b1-201ENSMUST00000178250 165 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Q9D2Q3 Gm22614-201ENSMUST00000178300 165 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Q9D2Q3 Bloc1s2-ps-201ENSMUST00000183232 432 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Q9D2Q3 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q9D2Q3 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Q9D2Q3 AC093022.1-201ENSMUST00000226949 1072 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Q9D2Q3 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Q9D2Q3 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q9D2Q3 Gm22042-201ENSMUST00000082989 165 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Q9D2Q3 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Q9D2Q3 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Q9D2Q3 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Q9D2Q3 Gm26110-201ENSMUST00000083971 165 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Q9D2Q3 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q9D2Q3 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q9D2Q3 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q9D2Q3 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Q9D2Q3 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q9D2Q3 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q9D2Q3 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Q9D2Q3 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q9D2Q3 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q9D2Q3 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q9D2Q3 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q9D2Q3 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q9D2Q3 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q9D2Q3 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q9D2Q3 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q9D2Q3 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q9D2Q3 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Q9D2Q3 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Q9D2Q3 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Q9D2Q3 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Q9D2Q3 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Q9D2Q3 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Q9D2Q3 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Q9D2Q3 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Q9D2Q3 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Q9D2Q3 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Q9D2Q3 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Q9D2Q3 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Q9D2Q3 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Q9D2Q3 Gm15738-202ENSMUST00000140892 427 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Q9D2Q3 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Q9D2Q3 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms