Protein–RNA interactions for Protein: Q9D024

Ccdc47, Coiled-coil domain-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc47Q9D024 Adprhl1-205ENSMUST00000204916 5228 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc47Q9D024 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc47Q9D024 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc47Q9D024 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc47Q9D024 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc47Q9D024 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc47Q9D024 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc47Q9D024 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc47Q9D024 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc47Q9D024 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc47Q9D024 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc47Q9D024 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc47Q9D024 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc47Q9D024 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc47Q9D024 Zbtb6-202ENSMUST00000112932 5077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc47Q9D024 Mtr-201ENSMUST00000099856 8294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc47Q9D024 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc47Q9D024 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc47Q9D024 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc47Q9D024 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc47Q9D024 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc47Q9D024 Zbtb40-201ENSMUST00000049583 7192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc47Q9D024 Fn1-214ENSMUST00000188894 8043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc47Q9D024 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc47Q9D024 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc47Q9D024 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc47Q9D024 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc47Q9D024 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc47Q9D024 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc47Q9D024 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc47Q9D024 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc47Q9D024 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc47Q9D024 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc47Q9D024 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc47Q9D024 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc47Q9D024 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc47Q9D024 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc47Q9D024 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc47Q9D024 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc47Q9D024 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc47Q9D024 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc47Q9D024 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc47Q9D024 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc47Q9D024 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc47Q9D024 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc47Q9D024 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc47Q9D024 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc47Q9D024 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc47Q9D024 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc47Q9D024 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc47Q9D024 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc47Q9D024 Rims1-206ENSMUST00000115273 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc47Q9D024 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc47Q9D024 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc47Q9D024 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc47Q9D024 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc47Q9D024 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc47Q9D024 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc47Q9D024 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc47Q9D024 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc47Q9D024 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc47Q9D024 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc47Q9D024 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc47Q9D024 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc47Q9D024 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc47Q9D024 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc47Q9D024 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc47Q9D024 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc47Q9D024 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc47Q9D024 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc47Q9D024 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc47Q9D024 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc47Q9D024 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc47Q9D024 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc47Q9D024 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc47Q9D024 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc47Q9D024 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc47Q9D024 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc47Q9D024 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc47Q9D024 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc47Q9D024 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc47Q9D024 Abca7-201ENSMUST00000043866 6590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc47Q9D024 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc47Q9D024 Iqsec2-201ENSMUST00000096275 5252 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc47Q9D024 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc47Q9D024 5830417I10Rik-201ENSMUST00000135913 6190 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc47Q9D024 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc47Q9D024 Strc-201ENSMUST00000038389 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc47Q9D024 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc47Q9D024 Apbb2-216ENSMUST00000162366 6540 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc47Q9D024 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc47Q9D024 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc47Q9D024 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc47Q9D024 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc47Q9D024 Adamts1-201ENSMUST00000023610 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc47Q9D024 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc47Q9D024 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc47Q9D024 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc47Q9D024 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc47Q9D024 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
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