Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY57

Chtop, Chromatin target of PRMT1 protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 249 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChtopQ9CY57 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
ChtopQ9CY57 Plekhm1-201ENSMUST00000041272 5968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
ChtopQ9CY57 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
ChtopQ9CY57 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
ChtopQ9CY57 AC156031.2-201ENSMUST00000213107 3310 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
ChtopQ9CY57 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
ChtopQ9CY57 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
ChtopQ9CY57 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC9.64□□□□□ -0.87
ChtopQ9CY57 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
ChtopQ9CY57 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC9.64□□□□□ -0.87
ChtopQ9CY57 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
ChtopQ9CY57 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
ChtopQ9CY57 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
ChtopQ9CY57 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
ChtopQ9CY57 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
ChtopQ9CY57 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
ChtopQ9CY57 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
ChtopQ9CY57 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
ChtopQ9CY57 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
ChtopQ9CY57 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
ChtopQ9CY57 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
ChtopQ9CY57 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
ChtopQ9CY57 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.64□□□□□ -0.87
ChtopQ9CY57 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
ChtopQ9CY57 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
ChtopQ9CY57 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
ChtopQ9CY57 Rnf123-218ENSMUST00000178267 4309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
ChtopQ9CY57 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
ChtopQ9CY57 Gm21039-201ENSMUST00000223359 2012 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
ChtopQ9CY57 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
ChtopQ9CY57 Myo16-201ENSMUST00000042103 6725 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
ChtopQ9CY57 Gucy1a3-204ENSMUST00000193924 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
ChtopQ9CY57 Zbtb24-205ENSMUST00000216656 2476 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
ChtopQ9CY57 AC115891.3-201ENSMUST00000219161 2472 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
ChtopQ9CY57 Phf21a-209ENSMUST00000111297 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
ChtopQ9CY57 Phf21a-201ENSMUST00000044036 6187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
ChtopQ9CY57 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
ChtopQ9CY57 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
ChtopQ9CY57 Plekhg4-206ENSMUST00000214056 3654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
ChtopQ9CY57 Lsamp-206ENSMUST00000187695 3411 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
ChtopQ9CY57 Pofut1-201ENSMUST00000049863 5600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
ChtopQ9CY57 Plcd4-205ENSMUST00000113749 4648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
ChtopQ9CY57 Ascc2-202ENSMUST00000109930 4844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
ChtopQ9CY57 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC9.64□□□□□ -0.87
ChtopQ9CY57 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
ChtopQ9CY57 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
ChtopQ9CY57 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
ChtopQ9CY57 Olfr1344-202ENSMUST00000218906 2590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
ChtopQ9CY57 Setd5-201ENSMUST00000042889 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
ChtopQ9CY57 Gnas-203ENSMUST00000087876 3719 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
ChtopQ9CY57 Blk-201ENSMUST00000014597 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
ChtopQ9CY57 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
ChtopQ9CY57 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
ChtopQ9CY57 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
ChtopQ9CY57 Acsm1-201ENSMUST00000047929 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
ChtopQ9CY57 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
ChtopQ9CY57 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
ChtopQ9CY57 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC9.63□□□□□ -0.87
ChtopQ9CY57 Gm26872-201ENSMUST00000180862 2261 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
ChtopQ9CY57 Slc38a3-202ENSMUST00000167868 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
ChtopQ9CY57 Bbs1-201ENSMUST00000053506 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
ChtopQ9CY57 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
ChtopQ9CY57 Atp13a4-201ENSMUST00000039090 2878 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
ChtopQ9CY57 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
ChtopQ9CY57 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
ChtopQ9CY57 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
ChtopQ9CY57 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
ChtopQ9CY57 Epb41l3-202ENSMUST00000112680 4073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
ChtopQ9CY57 Tex2-201ENSMUST00000042780 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
ChtopQ9CY57 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC9.63□□□□□ -0.87
ChtopQ9CY57 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
ChtopQ9CY57 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
ChtopQ9CY57 Nexmif-203ENSMUST00000118314 11476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
ChtopQ9CY57 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.63□□□□□ -0.87
ChtopQ9CY57 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
ChtopQ9CY57 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC9.63□□□□□ -0.87
ChtopQ9CY57 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
ChtopQ9CY57 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
ChtopQ9CY57 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
ChtopQ9CY57 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC9.63□□□□□ -0.87
ChtopQ9CY57 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
ChtopQ9CY57 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
ChtopQ9CY57 Gm35960-201ENSMUST00000202712 767 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
ChtopQ9CY57 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
ChtopQ9CY57 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
ChtopQ9CY57 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
ChtopQ9CY57 4921522P10Rik-201ENSMUST00000048606 2101 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
ChtopQ9CY57 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
ChtopQ9CY57 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
ChtopQ9CY57 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
ChtopQ9CY57 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
ChtopQ9CY57 Fndc9-201ENSMUST00000060185 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
ChtopQ9CY57 Hnrnpm-206ENSMUST00000148178 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
ChtopQ9CY57 Sel1l-210ENSMUST00000178462 6150 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
ChtopQ9CY57 Asap1-203ENSMUST00000110115 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
ChtopQ9CY57 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
ChtopQ9CY57 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC9.63□□□□□ -0.87
ChtopQ9CY57 Carhsp1-201ENSMUST00000008537 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
ChtopQ9CY57 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
ChtopQ9CY57 Ints6l-207ENSMUST00000186445 3608 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
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