Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXE6

Xrcc3, DNA repair protein XRCC3, mousemouse

Predictions only

Length 349 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xrcc3Q9CXE6 Slurp1-202ENSMUST00000190433 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Xrcc3Q9CXE6 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Xrcc3Q9CXE6 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Xrcc3Q9CXE6 Rgs3-205ENSMUST00000107424 4084 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Xrcc3Q9CXE6 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Xrcc3Q9CXE6 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Xrcc3Q9CXE6 Ambra1-203ENSMUST00000099712 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Xrcc3Q9CXE6 Otud7b-202ENSMUST00000090785 8101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Xrcc3Q9CXE6 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Xrcc3Q9CXE6 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Xrcc3Q9CXE6 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Xrcc3Q9CXE6 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Xrcc3Q9CXE6 Mrgprd-201ENSMUST00000062163 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Xrcc3Q9CXE6 2410002F23Rik-204ENSMUST00000107948 2908 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Xrcc3Q9CXE6 Sowahc-201ENSMUST00000182161 4482 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Xrcc3Q9CXE6 Stab1-201ENSMUST00000036618 7999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Xrcc3Q9CXE6 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Xrcc3Q9CXE6 Hk3-202ENSMUST00000123097 2896 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
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Xrcc3Q9CXE6 Dsc2-202ENSMUST00000075214 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Xrcc3Q9CXE6 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Xrcc3Q9CXE6 Gm32036-201ENSMUST00000221484 2638 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Xrcc3Q9CXE6 Med12l-203ENSMUST00000040846 3747 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Xrcc3Q9CXE6 Tubgcp2-201ENSMUST00000026547 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
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Xrcc3Q9CXE6 Sel1l-204ENSMUST00000167466 5544 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Xrcc3Q9CXE6 Gm43622-201ENSMUST00000200140 2019 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Xrcc3Q9CXE6 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Xrcc3Q9CXE6 Lypd6-202ENSMUST00000112712 3495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Xrcc3Q9CXE6 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Xrcc3Q9CXE6 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Xrcc3Q9CXE6 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Xrcc3Q9CXE6 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Xrcc3Q9CXE6 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Xrcc3Q9CXE6 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
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Xrcc3Q9CXE6 Cacna1c-212ENSMUST00000187940 7507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Xrcc3Q9CXE6 Entpd8-203ENSMUST00000114380 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Xrcc3Q9CXE6 Drd1-202ENSMUST00000221470 3576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Xrcc3Q9CXE6 Ttc7-202ENSMUST00000125875 3917 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Xrcc3Q9CXE6 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Xrcc3Q9CXE6 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
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Xrcc3Q9CXE6 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
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Xrcc3Q9CXE6 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Xrcc3Q9CXE6 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
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Xrcc3Q9CXE6 D130043K22Rik-201ENSMUST00000006893 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
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Xrcc3Q9CXE6 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Xrcc3Q9CXE6 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Xrcc3Q9CXE6 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
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Xrcc3Q9CXE6 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Xrcc3Q9CXE6 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Xrcc3Q9CXE6 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Xrcc3Q9CXE6 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Xrcc3Q9CXE6 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Xrcc3Q9CXE6 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Xrcc3Q9CXE6 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Xrcc3Q9CXE6 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Xrcc3Q9CXE6 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
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Xrcc3Q9CXE6 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
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Xrcc3Q9CXE6 Pcdhga3-201ENSMUST00000073447 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
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