Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWU0

Tdrd12, Putative ATP-dependent RNA helicase TDRD12, mousemouse

Predictions only

Length 1,215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd12Q9CWU0 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tdrd12Q9CWU0 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tdrd12Q9CWU0 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tdrd12Q9CWU0 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tdrd12Q9CWU0 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tdrd12Q9CWU0 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tdrd12Q9CWU0 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tdrd12Q9CWU0 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tdrd12Q9CWU0 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tdrd12Q9CWU0 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tdrd12Q9CWU0 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tdrd12Q9CWU0 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tdrd12Q9CWU0 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tdrd12Q9CWU0 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tdrd12Q9CWU0 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Tdrd12Q9CWU0 Irak2-201ENSMUST00000059286 3196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tdrd12Q9CWU0 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tdrd12Q9CWU0 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tdrd12Q9CWU0 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tdrd12Q9CWU0 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Tdrd12Q9CWU0 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tdrd12Q9CWU0 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tdrd12Q9CWU0 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tdrd12Q9CWU0 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Tdrd12Q9CWU0 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tdrd12Q9CWU0 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tdrd12Q9CWU0 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tdrd12Q9CWU0 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tdrd12Q9CWU0 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tdrd12Q9CWU0 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tdrd12Q9CWU0 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tdrd12Q9CWU0 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tdrd12Q9CWU0 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tdrd12Q9CWU0 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tdrd12Q9CWU0 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tdrd12Q9CWU0 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tdrd12Q9CWU0 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tdrd12Q9CWU0 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tdrd12Q9CWU0 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tdrd12Q9CWU0 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tdrd12Q9CWU0 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tdrd12Q9CWU0 Fam234b-202ENSMUST00000111916 2927 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tdrd12Q9CWU0 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tdrd12Q9CWU0 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tdrd12Q9CWU0 Mgat1-203ENSMUST00000109194 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tdrd12Q9CWU0 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tdrd12Q9CWU0 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tdrd12Q9CWU0 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tdrd12Q9CWU0 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tdrd12Q9CWU0 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Tdrd12Q9CWU0 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tdrd12Q9CWU0 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tdrd12Q9CWU0 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tdrd12Q9CWU0 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tdrd12Q9CWU0 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tdrd12Q9CWU0 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tdrd12Q9CWU0 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tdrd12Q9CWU0 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tdrd12Q9CWU0 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tdrd12Q9CWU0 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tdrd12Q9CWU0 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Tdrd12Q9CWU0 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tdrd12Q9CWU0 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tdrd12Q9CWU0 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tdrd12Q9CWU0 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tdrd12Q9CWU0 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tdrd12Q9CWU0 Gm42943-201ENSMUST00000199676 3242 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Tdrd12Q9CWU0 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tdrd12Q9CWU0 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tdrd12Q9CWU0 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tdrd12Q9CWU0 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tdrd12Q9CWU0 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tdrd12Q9CWU0 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tdrd12Q9CWU0 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Tdrd12Q9CWU0 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tdrd12Q9CWU0 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tdrd12Q9CWU0 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tdrd12Q9CWU0 5930412G12Rik-201ENSMUST00000091324 2403 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tdrd12Q9CWU0 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tdrd12Q9CWU0 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tdrd12Q9CWU0 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tdrd12Q9CWU0 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tdrd12Q9CWU0 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tdrd12Q9CWU0 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tdrd12Q9CWU0 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tdrd12Q9CWU0 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Tdrd12Q9CWU0 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tdrd12Q9CWU0 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tdrd12Q9CWU0 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tdrd12Q9CWU0 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tdrd12Q9CWU0 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tdrd12Q9CWU0 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tdrd12Q9CWU0 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tdrd12Q9CWU0 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tdrd12Q9CWU0 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tdrd12Q9CWU0 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tdrd12Q9CWU0 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tdrd12Q9CWU0 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Tdrd12Q9CWU0 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tdrd12Q9CWU0 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms