Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWL2

Casz1, Zinc finger protein castor homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,761 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casz1Q9CWL2 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Casz1Q9CWL2 Mrnip-201ENSMUST00000020647 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Casz1Q9CWL2 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Casz1Q9CWL2 Tbca-201ENSMUST00000046644 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Casz1Q9CWL2 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Casz1Q9CWL2 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Casz1Q9CWL2 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Casz1Q9CWL2 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Casz1Q9CWL2 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Casz1Q9CWL2 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Casz1Q9CWL2 Efcab14-203ENSMUST00000106524 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Casz1Q9CWL2 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Casz1Q9CWL2 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Casz1Q9CWL2 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Casz1Q9CWL2 Gm11509-201ENSMUST00000117358 325 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Casz1Q9CWL2 Gm11980-201ENSMUST00000121445 986 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Casz1Q9CWL2 Gm12164-201ENSMUST00000121695 551 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Casz1Q9CWL2 1810021B22Rik-201ENSMUST00000150364 652 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Casz1Q9CWL2 Ighv2-1-201ENSMUST00000170946 353 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Casz1Q9CWL2 Gm21859-201ENSMUST00000178424 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Casz1Q9CWL2 Rpain-201ENSMUST00000018593 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Casz1Q9CWL2 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Casz1Q9CWL2 Rpl15-201ENSMUST00000079419 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Casz1Q9CWL2 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Casz1Q9CWL2 Ube2q2-203ENSMUST00000122441 2081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Casz1Q9CWL2 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Casz1Q9CWL2 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Casz1Q9CWL2 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Casz1Q9CWL2 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Casz1Q9CWL2 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Casz1Q9CWL2 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Casz1Q9CWL2 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Casz1Q9CWL2 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Casz1Q9CWL2 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Casz1Q9CWL2 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Casz1Q9CWL2 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Casz1Q9CWL2 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Casz1Q9CWL2 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Casz1Q9CWL2 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Casz1Q9CWL2 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Casz1Q9CWL2 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Casz1Q9CWL2 Krtap4-16-201ENSMUST00000107437 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Casz1Q9CWL2 Gm11511-201ENSMUST00000118146 540 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Casz1Q9CWL2 Gm14314-201ENSMUST00000118225 1015 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Casz1Q9CWL2 Gm12948-201ENSMUST00000119406 682 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Casz1Q9CWL2 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Casz1Q9CWL2 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Casz1Q9CWL2 Gm7568-202ENSMUST00000160446 709 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Casz1Q9CWL2 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Casz1Q9CWL2 Gadd45a-206ENSMUST00000204282 460 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Casz1Q9CWL2 Gsto1-201ENSMUST00000026050 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Casz1Q9CWL2 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Casz1Q9CWL2 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Casz1Q9CWL2 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Casz1Q9CWL2 Eno3-202ENSMUST00000108548 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Casz1Q9CWL2 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Casz1Q9CWL2 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Casz1Q9CWL2 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Casz1Q9CWL2 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Casz1Q9CWL2 AC163354.1-205ENSMUST00000223262 1511 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Casz1Q9CWL2 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Casz1Q9CWL2 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Casz1Q9CWL2 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Casz1Q9CWL2 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Casz1Q9CWL2 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Casz1Q9CWL2 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Casz1Q9CWL2 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Casz1Q9CWL2 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Casz1Q9CWL2 Capzb-201ENSMUST00000030518 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Casz1Q9CWL2 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Casz1Q9CWL2 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Casz1Q9CWL2 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Casz1Q9CWL2 Gm22133-201ENSMUST00000102082 109 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Casz1Q9CWL2 Ifitm10-203ENSMUST00000105988 824 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Casz1Q9CWL2 Gm15856-201ENSMUST00000124853 1162 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Casz1Q9CWL2 Gm4862-201ENSMUST00000170405 438 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Casz1Q9CWL2 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Casz1Q9CWL2 Gm45799-208ENSMUST00000211054 490 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Casz1Q9CWL2 Scg5-201ENSMUST00000024005 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Casz1Q9CWL2 Cmbl-201ENSMUST00000070918 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Casz1Q9CWL2 Tmem39a-204ENSMUST00000163884 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Casz1Q9CWL2 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Casz1Q9CWL2 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Casz1Q9CWL2 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Casz1Q9CWL2 Drg1-201ENSMUST00000020741 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Casz1Q9CWL2 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Casz1Q9CWL2 Gm11470-201ENSMUST00000118868 1475 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Casz1Q9CWL2 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Casz1Q9CWL2 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Casz1Q9CWL2 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Casz1Q9CWL2 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Casz1Q9CWL2 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Casz1Q9CWL2 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Casz1Q9CWL2 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Casz1Q9CWL2 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Casz1Q9CWL2 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Casz1Q9CWL2 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Casz1Q9CWL2 Gm26286-201ENSMUST00000104166 134 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Casz1Q9CWL2 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Casz1Q9CWL2 Gm17231-203ENSMUST00000170133 637 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.9 ms