Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSB4

Pard3b, Partitioning defective 3 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 1,203 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pard3bQ9CSB4 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pard3bQ9CSB4 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pard3bQ9CSB4 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pard3bQ9CSB4 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pard3bQ9CSB4 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pard3bQ9CSB4 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pard3bQ9CSB4 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pard3bQ9CSB4 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pard3bQ9CSB4 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pard3bQ9CSB4 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pard3bQ9CSB4 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pard3bQ9CSB4 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pard3bQ9CSB4 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pard3bQ9CSB4 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pard3bQ9CSB4 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pard3bQ9CSB4 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Pard3bQ9CSB4 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pard3bQ9CSB4 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Pard3bQ9CSB4 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pard3bQ9CSB4 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pard3bQ9CSB4 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pard3bQ9CSB4 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pard3bQ9CSB4 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pard3bQ9CSB4 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pard3bQ9CSB4 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pard3bQ9CSB4 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pard3bQ9CSB4 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pard3bQ9CSB4 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pard3bQ9CSB4 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pard3bQ9CSB4 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pard3bQ9CSB4 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pard3bQ9CSB4 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pard3bQ9CSB4 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pard3bQ9CSB4 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pard3bQ9CSB4 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pard3bQ9CSB4 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pard3bQ9CSB4 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pard3bQ9CSB4 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pard3bQ9CSB4 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pard3bQ9CSB4 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Pard3bQ9CSB4 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pard3bQ9CSB4 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pard3bQ9CSB4 Apbb2-216ENSMUST00000162366 6540 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pard3bQ9CSB4 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pard3bQ9CSB4 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pard3bQ9CSB4 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pard3bQ9CSB4 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pard3bQ9CSB4 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Pard3bQ9CSB4 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pard3bQ9CSB4 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Pard3bQ9CSB4 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Pard3bQ9CSB4 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pard3bQ9CSB4 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pard3bQ9CSB4 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pard3bQ9CSB4 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pard3bQ9CSB4 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pard3bQ9CSB4 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pard3bQ9CSB4 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pard3bQ9CSB4 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pard3bQ9CSB4 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pard3bQ9CSB4 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pard3bQ9CSB4 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pard3bQ9CSB4 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pard3bQ9CSB4 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pard3bQ9CSB4 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pard3bQ9CSB4 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pard3bQ9CSB4 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Pard3bQ9CSB4 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pard3bQ9CSB4 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pard3bQ9CSB4 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pard3bQ9CSB4 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pard3bQ9CSB4 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pard3bQ9CSB4 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pard3bQ9CSB4 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pard3bQ9CSB4 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Pard3bQ9CSB4 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pard3bQ9CSB4 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pard3bQ9CSB4 AF529169-201ENSMUST00000044491 7202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pard3bQ9CSB4 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pard3bQ9CSB4 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pard3bQ9CSB4 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pard3bQ9CSB4 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pard3bQ9CSB4 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pard3bQ9CSB4 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Pard3bQ9CSB4 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pard3bQ9CSB4 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pard3bQ9CSB4 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pard3bQ9CSB4 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pard3bQ9CSB4 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pard3bQ9CSB4 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pard3bQ9CSB4 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pard3bQ9CSB4 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pard3bQ9CSB4 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Pard3bQ9CSB4 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pard3bQ9CSB4 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Pard3bQ9CSB4 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Pard3bQ9CSB4 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pard3bQ9CSB4 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pard3bQ9CSB4 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pard3bQ9CSB4 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms