Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ56

Use1, Vesicle transport protein USE1, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Use1Q9CQ56 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
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Use1Q9CQ56 Mki67-201ENSMUST00000033310 10061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
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Use1Q9CQ56 Gm15987-201ENSMUST00000141700 2231 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
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Use1Q9CQ56 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
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Use1Q9CQ56 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Use1Q9CQ56 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Use1Q9CQ56 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Use1Q9CQ56 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Use1Q9CQ56 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Use1Q9CQ56 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Use1Q9CQ56 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
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Use1Q9CQ56 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Use1Q9CQ56 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Use1Q9CQ56 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Use1Q9CQ56 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Use1Q9CQ56 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Use1Q9CQ56 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
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