Protein–RNA interactions for Protein: Q99PV5

Bhlhe41, Class E basic helix-loop-helix protein 41, mousemouse

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhe41Q99PV5 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Bhlhe41Q99PV5 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Bhlhe41Q99PV5 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Bhlhe41Q99PV5 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Bhlhe41Q99PV5 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Bhlhe41Q99PV5 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Bhlhe41Q99PV5 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Bhlhe41Q99PV5 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Bhlhe41Q99PV5 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Bhlhe41Q99PV5 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Bhlhe41Q99PV5 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Bhlhe41Q99PV5 Phf24-202ENSMUST00000107975 6494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Bhlhe41Q99PV5 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Bhlhe41Q99PV5 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Bhlhe41Q99PV5 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Bhlhe41Q99PV5 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Bhlhe41Q99PV5 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Bhlhe41Q99PV5 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Bhlhe41Q99PV5 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Bhlhe41Q99PV5 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Bhlhe41Q99PV5 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Bhlhe41Q99PV5 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Bhlhe41Q99PV5 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Bhlhe41Q99PV5 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Bhlhe41Q99PV5 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Bhlhe41Q99PV5 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Bhlhe41Q99PV5 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Bhlhe41Q99PV5 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Bhlhe41Q99PV5 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Bhlhe41Q99PV5 Nfe2l1-211ENSMUST00000167149 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Bhlhe41Q99PV5 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Bhlhe41Q99PV5 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Bhlhe41Q99PV5 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Bhlhe41Q99PV5 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Bhlhe41Q99PV5 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Bhlhe41Q99PV5 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Bhlhe41Q99PV5 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Bhlhe41Q99PV5 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Bhlhe41Q99PV5 Pspc1-201ENSMUST00000022507 4114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Bhlhe41Q99PV5 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Bhlhe41Q99PV5 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Bhlhe41Q99PV5 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Bhlhe41Q99PV5 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Bhlhe41Q99PV5 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Bhlhe41Q99PV5 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Bhlhe41Q99PV5 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Bhlhe41Q99PV5 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Bhlhe41Q99PV5 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Bhlhe41Q99PV5 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Bhlhe41Q99PV5 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Bhlhe41Q99PV5 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Bhlhe41Q99PV5 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Bhlhe41Q99PV5 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Bhlhe41Q99PV5 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Bhlhe41Q99PV5 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Bhlhe41Q99PV5 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Bhlhe41Q99PV5 Epb41l1-206ENSMUST00000109577 6251 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Bhlhe41Q99PV5 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Bhlhe41Q99PV5 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Bhlhe41Q99PV5 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Bhlhe41Q99PV5 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Bhlhe41Q99PV5 Cacna1c-227ENSMUST00000220022 7765 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Bhlhe41Q99PV5 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Bhlhe41Q99PV5 Kank4-201ENSMUST00000102790 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Bhlhe41Q99PV5 Nars2-201ENSMUST00000044466 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Bhlhe41Q99PV5 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Bhlhe41Q99PV5 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Bhlhe41Q99PV5 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Bhlhe41Q99PV5 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Bhlhe41Q99PV5 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Bhlhe41Q99PV5 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Bhlhe41Q99PV5 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Bhlhe41Q99PV5 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Bhlhe41Q99PV5 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Bhlhe41Q99PV5 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Bhlhe41Q99PV5 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Bhlhe41Q99PV5 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Bhlhe41Q99PV5 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Bhlhe41Q99PV5 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Bhlhe41Q99PV5 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Bhlhe41Q99PV5 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Bhlhe41Q99PV5 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Bhlhe41Q99PV5 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Bhlhe41Q99PV5 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Bhlhe41Q99PV5 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Bhlhe41Q99PV5 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Bhlhe41Q99PV5 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Bhlhe41Q99PV5 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Bhlhe41Q99PV5 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Bhlhe41Q99PV5 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Bhlhe41Q99PV5 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Bhlhe41Q99PV5 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Bhlhe41Q99PV5 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Bhlhe41Q99PV5 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Bhlhe41Q99PV5 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Bhlhe41Q99PV5 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Bhlhe41Q99PV5 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Bhlhe41Q99PV5 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Bhlhe41Q99PV5 Plet1-201ENSMUST00000114474 1689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Bhlhe41Q99PV5 Wbp1l-201ENSMUST00000099376 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.8 ms