Protein–RNA interactions for Protein: Q925F3

Rnf144a, E3 ubiquitin-protein ligase RNF144A, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf144aQ925F3 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rnf144aQ925F3 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rnf144aQ925F3 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rnf144aQ925F3 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rnf144aQ925F3 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rnf144aQ925F3 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rnf144aQ925F3 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rnf144aQ925F3 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rnf144aQ925F3 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rnf144aQ925F3 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rnf144aQ925F3 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Rnf144aQ925F3 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rnf144aQ925F3 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Rnf144aQ925F3 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Rnf144aQ925F3 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Rnf144aQ925F3 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Rnf144aQ925F3 4931428L18Rik-202ENSMUST00000135245 889 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rnf144aQ925F3 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
Rnf144aQ925F3 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Rnf144aQ925F3 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rnf144aQ925F3 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rnf144aQ925F3 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rnf144aQ925F3 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Rnf144aQ925F3 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rnf144aQ925F3 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Rnf144aQ925F3 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rnf144aQ925F3 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Rnf144aQ925F3 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Rnf144aQ925F3 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC12□□□□□ -0.49
Rnf144aQ925F3 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rnf144aQ925F3 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Rnf144aQ925F3 Mtmr12-202ENSMUST00000071993 3351 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rnf144aQ925F3 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Rnf144aQ925F3 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Rnf144aQ925F3 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rnf144aQ925F3 Htr2c-207ENSMUST00000156697 4654 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Rnf144aQ925F3 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rnf144aQ925F3 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rnf144aQ925F3 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Rnf144aQ925F3 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rnf144aQ925F3 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rnf144aQ925F3 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rnf144aQ925F3 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rnf144aQ925F3 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rnf144aQ925F3 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rnf144aQ925F3 Gm43868-201ENSMUST00000205187 2114 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Rnf144aQ925F3 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rnf144aQ925F3 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rnf144aQ925F3 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rnf144aQ925F3 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rnf144aQ925F3 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Rnf144aQ925F3 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rnf144aQ925F3 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Rnf144aQ925F3 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rnf144aQ925F3 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rnf144aQ925F3 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rnf144aQ925F3 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rnf144aQ925F3 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rnf144aQ925F3 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rnf144aQ925F3 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rnf144aQ925F3 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rnf144aQ925F3 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rnf144aQ925F3 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Rnf144aQ925F3 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Rnf144aQ925F3 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rnf144aQ925F3 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rnf144aQ925F3 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Rnf144aQ925F3 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Rnf144aQ925F3 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Rnf144aQ925F3 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rnf144aQ925F3 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Rnf144aQ925F3 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Rnf144aQ925F3 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Rnf144aQ925F3 Gm45865-201ENSMUST00000211815 945 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Rnf144aQ925F3 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rnf144aQ925F3 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Rnf144aQ925F3 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Rnf144aQ925F3 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rnf144aQ925F3 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rnf144aQ925F3 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rnf144aQ925F3 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rnf144aQ925F3 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rnf144aQ925F3 Tnn-202ENSMUST00000131919 3987 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rnf144aQ925F3 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rnf144aQ925F3 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rnf144aQ925F3 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rnf144aQ925F3 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rnf144aQ925F3 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rnf144aQ925F3 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rnf144aQ925F3 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rnf144aQ925F3 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rnf144aQ925F3 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Rnf144aQ925F3 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rnf144aQ925F3 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rnf144aQ925F3 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rnf144aQ925F3 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rnf144aQ925F3 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rnf144aQ925F3 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rnf144aQ925F3 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rnf144aQ925F3 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.9 ms