Protein–RNA interactions for Protein: Q924T3

Xrcc4, DNA repair protein XRCC4, mousemouse

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xrcc4Q924T3 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Xrcc4Q924T3 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Xrcc4Q924T3 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Xrcc4Q924T3 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Xrcc4Q924T3 Styxl1-205ENSMUST00000111164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Xrcc4Q924T3 Cep97-206ENSMUST00000122280 1057 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Xrcc4Q924T3 Mcpt8-201ENSMUST00000015594 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Xrcc4Q924T3 Lsm2-207ENSMUST00000173004 870 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Xrcc4Q924T3 Pmvk-203ENSMUST00000184515 1156 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Xrcc4Q924T3 2010010A06Rik-201ENSMUST00000185628 258 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Xrcc4Q924T3 Gm28287-201ENSMUST00000186612 546 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Xrcc4Q924T3 4930539M17Rik-201ENSMUST00000194792 846 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Xrcc4Q924T3 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Xrcc4Q924T3 CT025694.1-201ENSMUST00000226188 934 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Xrcc4Q924T3 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Xrcc4Q924T3 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Xrcc4Q924T3 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Xrcc4Q924T3 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Xrcc4Q924T3 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Xrcc4Q924T3 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Xrcc4Q924T3 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Xrcc4Q924T3 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Xrcc4Q924T3 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Xrcc4Q924T3 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Xrcc4Q924T3 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Xrcc4Q924T3 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Xrcc4Q924T3 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Xrcc4Q924T3 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Xrcc4Q924T3 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Xrcc4Q924T3 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Xrcc4Q924T3 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Xrcc4Q924T3 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Xrcc4Q924T3 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Xrcc4Q924T3 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Xrcc4Q924T3 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Xrcc4Q924T3 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Xrcc4Q924T3 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Xrcc4Q924T3 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Xrcc4Q924T3 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Xrcc4Q924T3 Spint5-201ENSMUST00000103097 443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Xrcc4Q924T3 Gngt2-207ENSMUST00000107714 558 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Xrcc4Q924T3 Cyb5d1-202ENSMUST00000108660 1034 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Xrcc4Q924T3 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Xrcc4Q924T3 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
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Xrcc4Q924T3 B9d1os-201ENSMUST00000137010 674 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Xrcc4Q924T3 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Xrcc4Q924T3 Tmem255b-202ENSMUST00000167505 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Xrcc4Q924T3 Gm3625-201ENSMUST00000170816 102 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Xrcc4Q924T3 Spint5-202ENSMUST00000180193 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Xrcc4Q924T3 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Xrcc4Q924T3 Psma7-201ENSMUST00000029082 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Xrcc4Q924T3 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Xrcc4Q924T3 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Xrcc4Q924T3 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Xrcc4Q924T3 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Xrcc4Q924T3 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Xrcc4Q924T3 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Xrcc4Q924T3 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC14.65□□□□□ -0.07
Xrcc4Q924T3 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Xrcc4Q924T3 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Xrcc4Q924T3 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Xrcc4Q924T3 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Xrcc4Q924T3 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Xrcc4Q924T3 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Xrcc4Q924T3 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Xrcc4Q924T3 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Xrcc4Q924T3 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Xrcc4Q924T3 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Xrcc4Q924T3 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Xrcc4Q924T3 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Xrcc4Q924T3 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Xrcc4Q924T3 Gm5580-201ENSMUST00000122096 1362 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Xrcc4Q924T3 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Xrcc4Q924T3 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Xrcc4Q924T3 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Xrcc4Q924T3 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Xrcc4Q924T3 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Xrcc4Q924T3 Gm12566-201ENSMUST00000121479 359 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Xrcc4Q924T3 Dnajb6-202ENSMUST00000012734 1024 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Xrcc4Q924T3 Gm13115-201ENSMUST00000156438 620 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Xrcc4Q924T3 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Xrcc4Q924T3 Abhd14a-203ENSMUST00000171925 1122 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Xrcc4Q924T3 Gm27627-201ENSMUST00000183644 150 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Xrcc4Q924T3 Nr1h2-ps-201ENSMUST00000183844 478 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.8 ms