Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCS3

Fam20b, Glycosaminoglycan xylosylkinase, mousemouse

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Length 409 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam20bQ8VCS3 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Fam20bQ8VCS3 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Fam20bQ8VCS3 Gm44086-201ENSMUST00000203251 2349 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Fam20bQ8VCS3 Gm43984-201ENSMUST00000204572 2864 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Fam20bQ8VCS3 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Fam20bQ8VCS3 Ccdc151-202ENSMUST00000115336 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Fam20bQ8VCS3 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Fam20bQ8VCS3 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Fam20bQ8VCS3 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Fam20bQ8VCS3 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Fam20bQ8VCS3 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Fam20bQ8VCS3 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Fam20bQ8VCS3 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Fam20bQ8VCS3 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Fam20bQ8VCS3 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Fam20bQ8VCS3 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Fam20bQ8VCS3 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Fam20bQ8VCS3 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Fam20bQ8VCS3 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Fam20bQ8VCS3 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Fam20bQ8VCS3 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Fam20bQ8VCS3 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Fam20bQ8VCS3 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Fam20bQ8VCS3 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Fam20bQ8VCS3 Gucy2e-203ENSMUST00000108665 3645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Fam20bQ8VCS3 Ppp1r16b-202ENSMUST00000052927 6685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Fam20bQ8VCS3 Tubgcp2-201ENSMUST00000026547 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Fam20bQ8VCS3 Hcn1-201ENSMUST00000006991 14141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Fam20bQ8VCS3 Ciz1-204ENSMUST00000113334 2871 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Fam20bQ8VCS3 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Fam20bQ8VCS3 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Fam20bQ8VCS3 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Fam20bQ8VCS3 Pabpc4-204ENSMUST00000106243 3111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Fam20bQ8VCS3 Pitpnc1-202ENSMUST00000103064 6329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Fam20bQ8VCS3 Palld-202ENSMUST00000121200 4193 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Fam20bQ8VCS3 Med12l-203ENSMUST00000040846 3747 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Fam20bQ8VCS3 Ubl5-201ENSMUST00000129414 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Fam20bQ8VCS3 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Fam20bQ8VCS3 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Fam20bQ8VCS3 Eif5-213ENSMUST00000222388 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Fam20bQ8VCS3 Mob1a-201ENSMUST00000038658 4119 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Fam20bQ8VCS3 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Fam20bQ8VCS3 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Fam20bQ8VCS3 Umod-201ENSMUST00000033263 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Fam20bQ8VCS3 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Fam20bQ8VCS3 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Fam20bQ8VCS3 Mgmt-201ENSMUST00000081510 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Fam20bQ8VCS3 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Fam20bQ8VCS3 Gm29050-201ENSMUST00000190732 2528 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Fam20bQ8VCS3 Dlec1-206ENSMUST00000140326 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Fam20bQ8VCS3 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Fam20bQ8VCS3 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Fam20bQ8VCS3 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Fam20bQ8VCS3 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Fam20bQ8VCS3 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Fam20bQ8VCS3 Cobl-202ENSMUST00000109650 5271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Fam20bQ8VCS3 Arnt2-213ENSMUST00000209133 6228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Fam20bQ8VCS3 Erbin-201ENSMUST00000022222 6369 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Fam20bQ8VCS3 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Fam20bQ8VCS3 Itga4-201ENSMUST00000099972 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Fam20bQ8VCS3 AC164426.2-201ENSMUST00000225993 2492 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Fam20bQ8VCS3 Tmeff2-202ENSMUST00000114565 2718 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Fam20bQ8VCS3 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Fam20bQ8VCS3 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Fam20bQ8VCS3 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Fam20bQ8VCS3 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Fam20bQ8VCS3 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Fam20bQ8VCS3 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
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Fam20bQ8VCS3 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Fam20bQ8VCS3 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Fam20bQ8VCS3 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Fam20bQ8VCS3 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Fam20bQ8VCS3 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Fam20bQ8VCS3 Gm35960-201ENSMUST00000202712 767 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Fam20bQ8VCS3 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Fam20bQ8VCS3 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Fam20bQ8VCS3 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Fam20bQ8VCS3 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Fam20bQ8VCS3 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Fam20bQ8VCS3 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Fam20bQ8VCS3 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Fam20bQ8VCS3 Sypl2-201ENSMUST00000141387 4090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Fam20bQ8VCS3 Gfm1-201ENSMUST00000077271 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Fam20bQ8VCS3 Slc6a16-201ENSMUST00000179310 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Fam20bQ8VCS3 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Fam20bQ8VCS3 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Fam20bQ8VCS3 Tcf4-234ENSMUST00000201410 1915 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Fam20bQ8VCS3 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Fam20bQ8VCS3 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Fam20bQ8VCS3 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Fam20bQ8VCS3 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Fam20bQ8VCS3 Gm15587-201ENSMUST00000146326 3493 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Fam20bQ8VCS3 Gm26584-201ENSMUST00000180551 3216 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Fam20bQ8VCS3 Socs6-201ENSMUST00000070116 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Fam20bQ8VCS3 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Fam20bQ8VCS3 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Fam20bQ8VCS3 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
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