Protein–RNA interactions for Protein: Q8K377

Lrrtm1, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 1, mousemouse

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Length 522 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrtm1Q8K377 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Lrrtm1Q8K377 Mylip-202ENSMUST00000222178 1954 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Lrrtm1Q8K377 Sstr3-201ENSMUST00000053239 3928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Lrrtm1Q8K377 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Lrrtm1Q8K377 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Lrrtm1Q8K377 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Lrrtm1Q8K377 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Lrrtm1Q8K377 Stat5a-203ENSMUST00000107357 3605 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Lrrtm1Q8K377 Cntnap1-201ENSMUST00000103109 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Lrrtm1Q8K377 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Lrrtm1Q8K377 Cd163l1-201ENSMUST00000084460 3454 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Lrrtm1Q8K377 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Lrrtm1Q8K377 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Lrrtm1Q8K377 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Lrrtm1Q8K377 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Lrrtm1Q8K377 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Lrrtm1Q8K377 Prune1-201ENSMUST00000015855 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Lrrtm1Q8K377 Gm34425-201ENSMUST00000216269 3079 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Lrrtm1Q8K377 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Lrrtm1Q8K377 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Lrrtm1Q8K377 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Lrrtm1Q8K377 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Lrrtm1Q8K377 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Lrrtm1Q8K377 Rbm6-201ENSMUST00000035201 3999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Lrrtm1Q8K377 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Lrrtm1Q8K377 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Lrrtm1Q8K377 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Lrrtm1Q8K377 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Lrrtm1Q8K377 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Lrrtm1Q8K377 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Lrrtm1Q8K377 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Lrrtm1Q8K377 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Lrrtm1Q8K377 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Lrrtm1Q8K377 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Lrrtm1Q8K377 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Lrrtm1Q8K377 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Lrrtm1Q8K377 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Lrrtm1Q8K377 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Lrrtm1Q8K377 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Lrrtm1Q8K377 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Lrrtm1Q8K377 Slc4a3-202ENSMUST00000124341 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Lrrtm1Q8K377 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Lrrtm1Q8K377 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Lrrtm1Q8K377 Sptbn2-201ENSMUST00000008991 8251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Lrrtm1Q8K377 C530043K16Rik-201ENSMUST00000201865 3109 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Lrrtm1Q8K377 Entpd8-203ENSMUST00000114380 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Lrrtm1Q8K377 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Lrrtm1Q8K377 Fut2-201ENSMUST00000069800 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Lrrtm1Q8K377 Gsdme-205ENSMUST00000170142 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Lrrtm1Q8K377 Gnas-209ENSMUST00000109088 3519 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Lrrtm1Q8K377 Gnas-201ENSMUST00000080493 3519 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Lrrtm1Q8K377 Palld-202ENSMUST00000121200 4193 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Lrrtm1Q8K377 Gja8-201ENSMUST00000062944 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Lrrtm1Q8K377 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Lrrtm1Q8K377 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Lrrtm1Q8K377 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Lrrtm1Q8K377 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Lrrtm1Q8K377 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Lrrtm1Q8K377 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Lrrtm1Q8K377 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Lrrtm1Q8K377 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Lrrtm1Q8K377 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Lrrtm1Q8K377 Gm38114-201ENSMUST00000191877 1232 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Lrrtm1Q8K377 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Lrrtm1Q8K377 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Lrrtm1Q8K377 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Lrrtm1Q8K377 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Lrrtm1Q8K377 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Lrrtm1Q8K377 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Lrrtm1Q8K377 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Lrrtm1Q8K377 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Lrrtm1Q8K377 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Lrrtm1Q8K377 Kifc2-201ENSMUST00000004294 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Lrrtm1Q8K377 Pabpc4-203ENSMUST00000106241 3050 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Lrrtm1Q8K377 Lamb3-209ENSMUST00000194677 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Lrrtm1Q8K377 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Lrrtm1Q8K377 4933431E20Rik-201ENSMUST00000131345 5407 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Lrrtm1Q8K377 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Lrrtm1Q8K377 Cabp5-201ENSMUST00000005791 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Lrrtm1Q8K377 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Lrrtm1Q8K377 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Lrrtm1Q8K377 Scn8a-208ENSMUST00000200963 5814 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Lrrtm1Q8K377 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Lrrtm1Q8K377 Lox-201ENSMUST00000025409 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Lrrtm1Q8K377 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Lrrtm1Q8K377 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Lrrtm1Q8K377 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Lrrtm1Q8K377 Ambra1-203ENSMUST00000099712 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Lrrtm1Q8K377 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Lrrtm1Q8K377 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Lrrtm1Q8K377 AC122811.1-201ENSMUST00000222257 2921 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Lrrtm1Q8K377 Anks1b-224ENSMUST00000182960 3397 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Lrrtm1Q8K377 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Lrrtm1Q8K377 Car10-206ENSMUST00000107863 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Lrrtm1Q8K377 Ptgir-202ENSMUST00000144408 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Lrrtm1Q8K377 Hdac6-201ENSMUST00000033501 4142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Lrrtm1Q8K377 Stx5a-213ENSMUST00000176381 2251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Lrrtm1Q8K377 Pcdh12-203ENSMUST00000194012 2702 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Lrrtm1Q8K377 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Lrrtm1Q8K377 Hs6st2-202ENSMUST00000114871 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
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