Protein–RNA interactions for Protein: Q8K284

Gtf3c1, General transcription factor 3C polypeptide 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,101 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c1Q8K284 Prss46-201ENSMUST00000119427 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gtf3c1Q8K284 Eef1akmt2-202ENSMUST00000120425 573 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gtf3c1Q8K284 Cldn16-202ENSMUST00000161053 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gtf3c1Q8K284 Prss46-202ENSMUST00000176403 1257 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gtf3c1Q8K284 Rhox3a2-204ENSMUST00000184565 823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gtf3c1Q8K284 Gm29088-201ENSMUST00000189363 581 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gtf3c1Q8K284 Rhox3e-201ENSMUST00000081327 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gtf3c1Q8K284 Gm4950-201ENSMUST00000091905 618 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gtf3c1Q8K284 Rhox3a2-201ENSMUST00000096459 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gtf3c1Q8K284 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gtf3c1Q8K284 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Gtf3c1Q8K284 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gtf3c1Q8K284 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gtf3c1Q8K284 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gtf3c1Q8K284 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gtf3c1Q8K284 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gtf3c1Q8K284 Ormdl2-201ENSMUST00000026409 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gtf3c1Q8K284 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gtf3c1Q8K284 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gtf3c1Q8K284 Sln-201ENSMUST00000048485 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gtf3c1Q8K284 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gtf3c1Q8K284 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gtf3c1Q8K284 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gtf3c1Q8K284 Gm16323-201ENSMUST00000134920 556 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gtf3c1Q8K284 Itpr3os-201ENSMUST00000143605 794 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gtf3c1Q8K284 Gm11683-201ENSMUST00000147006 918 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gtf3c1Q8K284 Gm13703-201ENSMUST00000150705 449 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gtf3c1Q8K284 Gm43520-201ENSMUST00000197996 164 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Gtf3c1Q8K284 Gm31479-201ENSMUST00000209936 522 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gtf3c1Q8K284 Nudt2-201ENSMUST00000030154 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gtf3c1Q8K284 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gtf3c1Q8K284 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gtf3c1Q8K284 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gtf3c1Q8K284 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gtf3c1Q8K284 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Gtf3c1Q8K284 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gtf3c1Q8K284 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gtf3c1Q8K284 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gtf3c1Q8K284 Gnrhr-202ENSMUST00000094654 1475 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gtf3c1Q8K284 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gtf3c1Q8K284 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gtf3c1Q8K284 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gtf3c1Q8K284 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gtf3c1Q8K284 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gtf3c1Q8K284 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gtf3c1Q8K284 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gtf3c1Q8K284 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gtf3c1Q8K284 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gtf3c1Q8K284 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gtf3c1Q8K284 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gtf3c1Q8K284 Ywhaq-ps2-201ENSMUST00000117738 643 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Gtf3c1Q8K284 Asb8-202ENSMUST00000123626 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gtf3c1Q8K284 Asb8-203ENSMUST00000123922 1162 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gtf3c1Q8K284 Gm13830-203ENSMUST00000148916 247 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gtf3c1Q8K284 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gtf3c1Q8K284 Gm3671-201ENSMUST00000182463 1007 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Gtf3c1Q8K284 Gm38228-201ENSMUST00000193169 1293 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Gtf3c1Q8K284 Gm43184-201ENSMUST00000197247 542 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Gtf3c1Q8K284 Dnajb6-212ENSMUST00000198694 505 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gtf3c1Q8K284 Lgals4-207ENSMUST00000208971 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gtf3c1Q8K284 AC151275.1-201ENSMUST00000224870 585 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Gtf3c1Q8K284 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gtf3c1Q8K284 Mcpt1-201ENSMUST00000022836 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gtf3c1Q8K284 Hist1h1b-201ENSMUST00000080511 743 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gtf3c1Q8K284 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gtf3c1Q8K284 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gtf3c1Q8K284 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gtf3c1Q8K284 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gtf3c1Q8K284 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gtf3c1Q8K284 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gtf3c1Q8K284 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gtf3c1Q8K284 Tbcel-206ENSMUST00000138506 1534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gtf3c1Q8K284 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gtf3c1Q8K284 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gtf3c1Q8K284 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gtf3c1Q8K284 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gtf3c1Q8K284 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gtf3c1Q8K284 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gtf3c1Q8K284 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Gtf3c1Q8K284 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gtf3c1Q8K284 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gtf3c1Q8K284 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gtf3c1Q8K284 Gstm4-202ENSMUST00000106670 777 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gtf3c1Q8K284 Mapkapk5-203ENSMUST00000111782 969 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gtf3c1Q8K284 Gm22711-201ENSMUST00000116890 133 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Gtf3c1Q8K284 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gtf3c1Q8K284 Gm17334-201ENSMUST00000170390 907 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gtf3c1Q8K284 Med8-201ENSMUST00000019229 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gtf3c1Q8K284 Gm17889-201ENSMUST00000198410 598 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Gtf3c1Q8K284 Mt3-202ENSMUST00000211915 440 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gtf3c1Q8K284 Gm45781-201ENSMUST00000212860 539 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gtf3c1Q8K284 Prss52-201ENSMUST00000022537 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gtf3c1Q8K284 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gtf3c1Q8K284 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gtf3c1Q8K284 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gtf3c1Q8K284 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gtf3c1Q8K284 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gtf3c1Q8K284 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gtf3c1Q8K284 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gtf3c1Q8K284 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
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