Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1R7

Nek9, Serine/threonine-protein kinase Nek9, mousemouse

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Length 984 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek9Q8K1R7 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nek9Q8K1R7 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nek9Q8K1R7 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nek9Q8K1R7 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nek9Q8K1R7 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nek9Q8K1R7 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Nek9Q8K1R7 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nek9Q8K1R7 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nek9Q8K1R7 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nek9Q8K1R7 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nek9Q8K1R7 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nek9Q8K1R7 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nek9Q8K1R7 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nek9Q8K1R7 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nek9Q8K1R7 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nek9Q8K1R7 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nek9Q8K1R7 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nek9Q8K1R7 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nek9Q8K1R7 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nek9Q8K1R7 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nek9Q8K1R7 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Nek9Q8K1R7 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nek9Q8K1R7 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nek9Q8K1R7 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nek9Q8K1R7 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nek9Q8K1R7 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nek9Q8K1R7 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nek9Q8K1R7 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nek9Q8K1R7 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nek9Q8K1R7 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nek9Q8K1R7 Bnip3-203ENSMUST00000130500 719 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nek9Q8K1R7 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nek9Q8K1R7 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nek9Q8K1R7 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Nek9Q8K1R7 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nek9Q8K1R7 Gm4607-201ENSMUST00000206649 577 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Nek9Q8K1R7 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nek9Q8K1R7 Gm7207-201ENSMUST00000211575 1067 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Nek9Q8K1R7 Lcn6-201ENSMUST00000059693 1254 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nek9Q8K1R7 Nudt7-201ENSMUST00000066514 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nek9Q8K1R7 Cd320-202ENSMUST00000087559 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nek9Q8K1R7 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nek9Q8K1R7 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nek9Q8K1R7 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nek9Q8K1R7 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Nek9Q8K1R7 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nek9Q8K1R7 Fyn-206ENSMUST00000136659 1910 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nek9Q8K1R7 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nek9Q8K1R7 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nek9Q8K1R7 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nek9Q8K1R7 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nek9Q8K1R7 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nek9Q8K1R7 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nek9Q8K1R7 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nek9Q8K1R7 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nek9Q8K1R7 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nek9Q8K1R7 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nek9Q8K1R7 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nek9Q8K1R7 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nek9Q8K1R7 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nek9Q8K1R7 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nek9Q8K1R7 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
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Nek9Q8K1R7 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nek9Q8K1R7 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
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Nek9Q8K1R7 Defb36-201ENSMUST00000058086 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nek9Q8K1R7 1700001J03Rik-201ENSMUST00000073721 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nek9Q8K1R7 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nek9Q8K1R7 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nek9Q8K1R7 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nek9Q8K1R7 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nek9Q8K1R7 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nek9Q8K1R7 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nek9Q8K1R7 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nek9Q8K1R7 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Nek9Q8K1R7 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Nek9Q8K1R7 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Nek9Q8K1R7 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Nek9Q8K1R7 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Nek9Q8K1R7 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Nek9Q8K1R7 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Nek9Q8K1R7 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Nek9Q8K1R7 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Nek9Q8K1R7 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Nek9Q8K1R7 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Nek9Q8K1R7 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Nek9Q8K1R7 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Nek9Q8K1R7 Trav13-1-201ENSMUST00000103651 331 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Nek9Q8K1R7 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Nek9Q8K1R7 Ssc4d-202ENSMUST00000111150 459 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Nek9Q8K1R7 Rpl15-204ENSMUST00000112598 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
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