Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIT9

Sbsn, Suprabasin, mousemouse

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Length 700 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbsnQ8CIT9 Cyp2s1-202ENSMUST00000108395 3161 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
SbsnQ8CIT9 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
SbsnQ8CIT9 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
SbsnQ8CIT9 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
SbsnQ8CIT9 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
SbsnQ8CIT9 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
SbsnQ8CIT9 Gm38292-201ENSMUST00000192646 3045 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
SbsnQ8CIT9 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
SbsnQ8CIT9 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
SbsnQ8CIT9 Hspa5-201ENSMUST00000028222 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
SbsnQ8CIT9 Setd5-201ENSMUST00000042889 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
SbsnQ8CIT9 Ica1-204ENSMUST00000115520 1876 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
SbsnQ8CIT9 Slc25a42-202ENSMUST00000110127 3196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
SbsnQ8CIT9 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
SbsnQ8CIT9 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
SbsnQ8CIT9 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
SbsnQ8CIT9 Gtf2ird2-201ENSMUST00000016086 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
SbsnQ8CIT9 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
SbsnQ8CIT9 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
SbsnQ8CIT9 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
SbsnQ8CIT9 Nefl-201ENSMUST00000022639 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
SbsnQ8CIT9 Acad9-201ENSMUST00000011492 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
SbsnQ8CIT9 Hdac6-202ENSMUST00000115642 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
SbsnQ8CIT9 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
SbsnQ8CIT9 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
SbsnQ8CIT9 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC10.55□□□□□ -0.72
SbsnQ8CIT9 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC10.55□□□□□ -0.72
SbsnQ8CIT9 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
SbsnQ8CIT9 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
SbsnQ8CIT9 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
SbsnQ8CIT9 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
SbsnQ8CIT9 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC10.55□□□□□ -0.72
SbsnQ8CIT9 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
SbsnQ8CIT9 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
SbsnQ8CIT9 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
SbsnQ8CIT9 Alox12-201ENSMUST00000000329 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
SbsnQ8CIT9 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
SbsnQ8CIT9 Pitpnb-204ENSMUST00000200298 2632 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
SbsnQ8CIT9 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
SbsnQ8CIT9 5830417I10Rik-201ENSMUST00000135913 6190 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
SbsnQ8CIT9 F730043M19Rik-204ENSMUST00000148740 3312 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
SbsnQ8CIT9 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
SbsnQ8CIT9 Myo16-201ENSMUST00000042103 6725 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
SbsnQ8CIT9 Ascc2-202ENSMUST00000109930 4844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
SbsnQ8CIT9 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
SbsnQ8CIT9 Abcg4-201ENSMUST00000034648 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
SbsnQ8CIT9 Kirrel3-209ENSMUST00000190549 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
SbsnQ8CIT9 Tbc1d14-204ENSMUST00000130417 2665 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
SbsnQ8CIT9 Nrd1-203ENSMUST00000106644 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
SbsnQ8CIT9 Apol7a-203ENSMUST00000175919 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
SbsnQ8CIT9 Gnb1l-202ENSMUST00000090086 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
SbsnQ8CIT9 Golga2-202ENSMUST00000100194 4373 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
SbsnQ8CIT9 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
SbsnQ8CIT9 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
SbsnQ8CIT9 Srebf1-201ENSMUST00000020846 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
SbsnQ8CIT9 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
SbsnQ8CIT9 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
SbsnQ8CIT9 Mapk8ip3-202ENSMUST00000115228 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
SbsnQ8CIT9 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
SbsnQ8CIT9 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
SbsnQ8CIT9 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
SbsnQ8CIT9 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
SbsnQ8CIT9 Sowahc-201ENSMUST00000182161 4482 ntAPPRIS P1 BASIC10.54□□□□□ -0.72
SbsnQ8CIT9 Dnmt1-201ENSMUST00000004202 5367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
SbsnQ8CIT9 Tdrd9-201ENSMUST00000079009 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
SbsnQ8CIT9 Mthfd1l-202ENSMUST00000117291 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
SbsnQ8CIT9 Cdc37-201ENSMUST00000019615 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
SbsnQ8CIT9 Pbrm1-208ENSMUST00000112098 6566 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
SbsnQ8CIT9 Cobl-202ENSMUST00000109650 5271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
SbsnQ8CIT9 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
SbsnQ8CIT9 Phf24-202ENSMUST00000107975 6494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
SbsnQ8CIT9 Rassf4-201ENSMUST00000035842 6460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
SbsnQ8CIT9 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
SbsnQ8CIT9 Matn2-202ENSMUST00000163455 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
SbsnQ8CIT9 Trmt61b-202ENSMUST00000137830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
SbsnQ8CIT9 App-206ENSMUST00000227723 8167 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
SbsnQ8CIT9 Nfia-202ENSMUST00000075448 9526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
SbsnQ8CIT9 Ifnar1-201ENSMUST00000023689 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
SbsnQ8CIT9 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
SbsnQ8CIT9 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
SbsnQ8CIT9 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
SbsnQ8CIT9 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
SbsnQ8CIT9 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
SbsnQ8CIT9 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
SbsnQ8CIT9 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
SbsnQ8CIT9 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
SbsnQ8CIT9 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
SbsnQ8CIT9 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
SbsnQ8CIT9 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
SbsnQ8CIT9 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC10.54□□□□□ -0.72
SbsnQ8CIT9 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
SbsnQ8CIT9 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
SbsnQ8CIT9 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
SbsnQ8CIT9 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
SbsnQ8CIT9 Enox1-203ENSMUST00000227662 3064 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
SbsnQ8CIT9 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
SbsnQ8CIT9 Prkar1a-201ENSMUST00000049527 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
SbsnQ8CIT9 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC10.54□□□□□ -0.72
SbsnQ8CIT9 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
SbsnQ8CIT9 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
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