Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGR7

Upp2, Uridine phosphorylase 2, mousemouse

Predictions only

Length 320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upp2Q8CGR7 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Upp2Q8CGR7 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Upp2Q8CGR7 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Upp2Q8CGR7 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Upp2Q8CGR7 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Upp2Q8CGR7 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Upp2Q8CGR7 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Upp2Q8CGR7 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Upp2Q8CGR7 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Upp2Q8CGR7 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Upp2Q8CGR7 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Upp2Q8CGR7 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Upp2Q8CGR7 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Upp2Q8CGR7 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Upp2Q8CGR7 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Upp2Q8CGR7 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Upp2Q8CGR7 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Upp2Q8CGR7 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Upp2Q8CGR7 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Upp2Q8CGR7 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Upp2Q8CGR7 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Upp2Q8CGR7 Gm9962-202ENSMUST00000186595 1417 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Upp2Q8CGR7 Abhd6-201ENSMUST00000026313 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Upp2Q8CGR7 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Upp2Q8CGR7 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Upp2Q8CGR7 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Upp2Q8CGR7 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Upp2Q8CGR7 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Upp2Q8CGR7 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Upp2Q8CGR7 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Upp2Q8CGR7 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Upp2Q8CGR7 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Upp2Q8CGR7 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Upp2Q8CGR7 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Upp2Q8CGR7 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Upp2Q8CGR7 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Upp2Q8CGR7 Uox-202ENSMUST00000121133 768 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Upp2Q8CGR7 Ankrd29-202ENSMUST00000122408 850 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Upp2Q8CGR7 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Upp2Q8CGR7 Tnfrsf19-203ENSMUST00000224371 1239 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Upp2Q8CGR7 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Upp2Q8CGR7 Lcn8-201ENSMUST00000038482 651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Upp2Q8CGR7 Hist1h3a-201ENSMUST00000091701 534 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Upp2Q8CGR7 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Upp2Q8CGR7 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Upp2Q8CGR7 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Upp2Q8CGR7 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Upp2Q8CGR7 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Upp2Q8CGR7 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Upp2Q8CGR7 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Upp2Q8CGR7 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Upp2Q8CGR7 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Upp2Q8CGR7 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Upp2Q8CGR7 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Upp2Q8CGR7 Sparc-209ENSMUST00000216313 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Upp2Q8CGR7 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Upp2Q8CGR7 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Upp2Q8CGR7 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Upp2Q8CGR7 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Upp2Q8CGR7 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Upp2Q8CGR7 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Upp2Q8CGR7 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Upp2Q8CGR7 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Upp2Q8CGR7 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Upp2Q8CGR7 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Upp2Q8CGR7 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Upp2Q8CGR7 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Upp2Q8CGR7 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Upp2Q8CGR7 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Upp2Q8CGR7 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Upp2Q8CGR7 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Upp2Q8CGR7 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Upp2Q8CGR7 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Upp2Q8CGR7 Anp32a-205ENSMUST00000135395 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Upp2Q8CGR7 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Upp2Q8CGR7 Gm19353-201ENSMUST00000184561 445 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Upp2Q8CGR7 Mir124-2hg-207ENSMUST00000189868 535 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Upp2Q8CGR7 Gm28694-201ENSMUST00000190681 722 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Upp2Q8CGR7 Cct2-206ENSMUST00000219573 637 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Upp2Q8CGR7 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Upp2Q8CGR7 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Upp2Q8CGR7 AC159308.2-201ENSMUST00000213592 2325 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Upp2Q8CGR7 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Upp2Q8CGR7 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Upp2Q8CGR7 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Upp2Q8CGR7 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Upp2Q8CGR7 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Upp2Q8CGR7 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Upp2Q8CGR7 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Upp2Q8CGR7 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Upp2Q8CGR7 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Upp2Q8CGR7 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Upp2Q8CGR7 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Upp2Q8CGR7 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Upp2Q8CGR7 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Upp2Q8CGR7 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Upp2Q8CGR7 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Upp2Q8CGR7 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Upp2Q8CGR7 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Upp2Q8CGR7 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms