Protein–RNA interactions for Protein: Q8C1M2

Znf428, Zinc finger protein 428, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf428Q8C1M2 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Znf428Q8C1M2 Snap29-201ENSMUST00000023449 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Znf428Q8C1M2 Sun3-202ENSMUST00000102909 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Znf428Q8C1M2 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Znf428Q8C1M2 Vps25-205ENSMUST00000121331 790 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Znf428Q8C1M2 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Znf428Q8C1M2 Nop16-202ENSMUST00000148222 790 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Znf428Q8C1M2 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Znf428Q8C1M2 Gm28516-201ENSMUST00000190257 663 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Znf428Q8C1M2 2010001M07Rik-201ENSMUST00000214235 364 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Znf428Q8C1M2 Gm9139-201ENSMUST00000218817 700 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Znf428Q8C1M2 AC129219.2-201ENSMUST00000224324 701 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Znf428Q8C1M2 Tmem258-201ENSMUST00000040372 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Znf428Q8C1M2 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Znf428Q8C1M2 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Znf428Q8C1M2 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Znf428Q8C1M2 Tmem62-202ENSMUST00000110686 2417 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Znf428Q8C1M2 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Znf428Q8C1M2 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Znf428Q8C1M2 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Znf428Q8C1M2 Cd207-201ENSMUST00000037882 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Znf428Q8C1M2 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Znf428Q8C1M2 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Znf428Q8C1M2 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Znf428Q8C1M2 Gm37744-201ENSMUST00000194616 1590 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Znf428Q8C1M2 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Znf428Q8C1M2 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Znf428Q8C1M2 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Znf428Q8C1M2 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Znf428Q8C1M2 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Znf428Q8C1M2 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Znf428Q8C1M2 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Znf428Q8C1M2 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Znf428Q8C1M2 Gm15725-201ENSMUST00000119947 1090 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Znf428Q8C1M2 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Znf428Q8C1M2 Plgrkt-209ENSMUST00000152936 604 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Znf428Q8C1M2 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Znf428Q8C1M2 Ctdspl-202ENSMUST00000172464 798 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Znf428Q8C1M2 Gm22877-201ENSMUST00000175451 105 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Znf428Q8C1M2 Gm2449-201ENSMUST00000180676 585 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Znf428Q8C1M2 9330159M07Rik-202ENSMUST00000180783 1044 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Znf428Q8C1M2 1700025F24Rik-201ENSMUST00000185238 894 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Znf428Q8C1M2 Gm43778-201ENSMUST00000199438 199 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Znf428Q8C1M2 Gm19091-201ENSMUST00000208120 978 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Znf428Q8C1M2 Immp1l-201ENSMUST00000037499 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Znf428Q8C1M2 Ifnab-201ENSMUST00000071378 1058 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Znf428Q8C1M2 Mir483-201ENSMUST00000093631 73 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Znf428Q8C1M2 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Znf428Q8C1M2 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Znf428Q8C1M2 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Znf428Q8C1M2 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Znf428Q8C1M2 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Znf428Q8C1M2 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Znf428Q8C1M2 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Znf428Q8C1M2 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Znf428Q8C1M2 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Znf428Q8C1M2 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Znf428Q8C1M2 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Znf428Q8C1M2 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Znf428Q8C1M2 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Znf428Q8C1M2 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Znf428Q8C1M2 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Znf428Q8C1M2 Gm36855-203ENSMUST00000216660 1406 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Znf428Q8C1M2 Tssk4-201ENSMUST00000007735 1420 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Znf428Q8C1M2 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Znf428Q8C1M2 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Znf428Q8C1M2 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Znf428Q8C1M2 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Znf428Q8C1M2 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Znf428Q8C1M2 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Znf428Q8C1M2 AC163354.1-205ENSMUST00000223262 1511 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Znf428Q8C1M2 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Znf428Q8C1M2 Ifna2-201ENSMUST00000105147 1032 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Znf428Q8C1M2 Gm11509-201ENSMUST00000117358 325 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Znf428Q8C1M2 Gm11451-201ENSMUST00000118946 630 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Znf428Q8C1M2 Gm4879-201ENSMUST00000122190 1272 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Znf428Q8C1M2 C230038L03Rik-202ENSMUST00000136294 1197 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Znf428Q8C1M2 Gm15996-201ENSMUST00000161925 762 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Znf428Q8C1M2 Gm37299-201ENSMUST00000193951 826 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Znf428Q8C1M2 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Znf428Q8C1M2 AC154252.2-201ENSMUST00000223593 767 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Znf428Q8C1M2 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Znf428Q8C1M2 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Znf428Q8C1M2 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Znf428Q8C1M2 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Znf428Q8C1M2 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Znf428Q8C1M2 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Znf428Q8C1M2 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Znf428Q8C1M2 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Znf428Q8C1M2 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Znf428Q8C1M2 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Znf428Q8C1M2 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Znf428Q8C1M2 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Znf428Q8C1M2 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Znf428Q8C1M2 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Znf428Q8C1M2 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Znf428Q8C1M2 Cd72-205ENSMUST00000107926 1419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Znf428Q8C1M2 Cd72-203ENSMUST00000098105 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Znf428Q8C1M2 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Znf428Q8C1M2 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.5 ms