Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGA3

Lrrtm2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, mousemouse

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Length 515 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrtm2Q8BGA3 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Lrrtm2Q8BGA3 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Lrrtm2Q8BGA3 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Lrrtm2Q8BGA3 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Lrrtm2Q8BGA3 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Lrrtm2Q8BGA3 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Lrrtm2Q8BGA3 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Lrrtm2Q8BGA3 Egfem1-202ENSMUST00000119598 2687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Lrrtm2Q8BGA3 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Lrrtm2Q8BGA3 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Lrrtm2Q8BGA3 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Lrrtm2Q8BGA3 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Lrrtm2Q8BGA3 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Lrrtm2Q8BGA3 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Lrrtm2Q8BGA3 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Lrrtm2Q8BGA3 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Lrrtm2Q8BGA3 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Lrrtm2Q8BGA3 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Lrrtm2Q8BGA3 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Lrrtm2Q8BGA3 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Lrrtm2Q8BGA3 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Lrrtm2Q8BGA3 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Lrrtm2Q8BGA3 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Lrrtm2Q8BGA3 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Lrrtm2Q8BGA3 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Lrrtm2Q8BGA3 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Lrrtm2Q8BGA3 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Lrrtm2Q8BGA3 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Lrrtm2Q8BGA3 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Lrrtm2Q8BGA3 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Lrrtm2Q8BGA3 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Lrrtm2Q8BGA3 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Lrrtm2Q8BGA3 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Lrrtm2Q8BGA3 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Lrrtm2Q8BGA3 Plxna1-201ENSMUST00000049845 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Lrrtm2Q8BGA3 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Lrrtm2Q8BGA3 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Lrrtm2Q8BGA3 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Lrrtm2Q8BGA3 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Lrrtm2Q8BGA3 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Lrrtm2Q8BGA3 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Lrrtm2Q8BGA3 Madd-203ENSMUST00000075269 5756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Lrrtm2Q8BGA3 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Lrrtm2Q8BGA3 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Lrrtm2Q8BGA3 Grm5-201ENSMUST00000107263 3516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Lrrtm2Q8BGA3 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Lrrtm2Q8BGA3 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Lrrtm2Q8BGA3 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Lrrtm2Q8BGA3 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Lrrtm2Q8BGA3 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Lrrtm2Q8BGA3 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Lrrtm2Q8BGA3 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Lrrtm2Q8BGA3 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Lrrtm2Q8BGA3 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Lrrtm2Q8BGA3 Stox2-209ENSMUST00000211882 9696 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Lrrtm2Q8BGA3 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Lrrtm2Q8BGA3 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Lrrtm2Q8BGA3 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Lrrtm2Q8BGA3 Gm17077-201ENSMUST00000133179 279 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Lrrtm2Q8BGA3 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Lrrtm2Q8BGA3 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Lrrtm2Q8BGA3 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Lrrtm2Q8BGA3 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Lrrtm2Q8BGA3 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Lrrtm2Q8BGA3 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Lrrtm2Q8BGA3 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Lrrtm2Q8BGA3 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Lrrtm2Q8BGA3 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Lrrtm2Q8BGA3 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Lrrtm2Q8BGA3 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Lrrtm2Q8BGA3 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Lrrtm2Q8BGA3 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Lrrtm2Q8BGA3 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Lrrtm2Q8BGA3 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Lrrtm2Q8BGA3 Pnpla6-202ENSMUST00000111070 4496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Lrrtm2Q8BGA3 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Lrrtm2Q8BGA3 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Lrrtm2Q8BGA3 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Lrrtm2Q8BGA3 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Lrrtm2Q8BGA3 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Lrrtm2Q8BGA3 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Lrrtm2Q8BGA3 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Lrrtm2Q8BGA3 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Lrrtm2Q8BGA3 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Lrrtm2Q8BGA3 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Lrrtm2Q8BGA3 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Lrrtm2Q8BGA3 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Lrrtm2Q8BGA3 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Lrrtm2Q8BGA3 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Lrrtm2Q8BGA3 Myo18a-210ENSMUST00000130305 5450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Lrrtm2Q8BGA3 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Lrrtm2Q8BGA3 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Lrrtm2Q8BGA3 Epm2aip1-201ENSMUST00000060711 7149 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Lrrtm2Q8BGA3 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Lrrtm2Q8BGA3 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Lrrtm2Q8BGA3 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Lrrtm2Q8BGA3 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Lrrtm2Q8BGA3 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Lrrtm2Q8BGA3 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Lrrtm2Q8BGA3 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
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