Protein–RNA interactions for Protein: Q80TM9

Nisch, Nischarin, mousemouse

Predictions only

Length 1,593 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NischQ80TM9 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NischQ80TM9 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NischQ80TM9 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NischQ80TM9 Zfp667-204ENSMUST00000153840 596 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NischQ80TM9 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NischQ80TM9 Park2-204ENSMUST00000179624 1108 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NischQ80TM9 Gm5621-201ENSMUST00000187303 640 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
NischQ80TM9 Gm19587-201ENSMUST00000191395 545 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
NischQ80TM9 Gm43912-201ENSMUST00000204352 538 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
NischQ80TM9 AC126799.1-201ENSMUST00000221976 246 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
NischQ80TM9 Rpl10-ps3-201ENSMUST00000076364 768 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NischQ80TM9 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NischQ80TM9 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NischQ80TM9 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NischQ80TM9 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NischQ80TM9 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NischQ80TM9 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NischQ80TM9 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NischQ80TM9 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NischQ80TM9 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NischQ80TM9 Trav13d-4-201ENSMUST00000103607 264 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NischQ80TM9 Gm10169-201ENSMUST00000121822 348 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
NischQ80TM9 Cdpf1-205ENSMUST00000150995 566 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NischQ80TM9 Trav13-4-dv7-202ENSMUST00000184905 264 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NischQ80TM9 Gm18561-201ENSMUST00000206027 804 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
NischQ80TM9 Gm45592-201ENSMUST00000209605 1043 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
NischQ80TM9 Gm7959-201ENSMUST00000221823 1078 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
NischQ80TM9 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NischQ80TM9 Ankrd53-201ENSMUST00000014891 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NischQ80TM9 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NischQ80TM9 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NischQ80TM9 Nxf2-202ENSMUST00000113187 2316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NischQ80TM9 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NischQ80TM9 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NischQ80TM9 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NischQ80TM9 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NischQ80TM9 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NischQ80TM9 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NischQ80TM9 Rad51ap1-202ENSMUST00000112221 1871 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NischQ80TM9 Ighv5-9-201ENSMUST00000103448 418 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NischQ80TM9 Gm14892-201ENSMUST00000117636 267 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
NischQ80TM9 Gm9089-201ENSMUST00000122027 526 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
NischQ80TM9 Gm18201-201ENSMUST00000174735 875 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
NischQ80TM9 Gm43001-201ENSMUST00000198925 603 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NischQ80TM9 Gm43634-201ENSMUST00000202671 675 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NischQ80TM9 Cdipt-204ENSMUST00000206346 806 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NischQ80TM9 Gm35713-201ENSMUST00000210516 199 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
NischQ80TM9 5830428M24Rik-201ENSMUST00000221805 825 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NischQ80TM9 Crygs-201ENSMUST00000040592 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NischQ80TM9 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NischQ80TM9 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NischQ80TM9 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NischQ80TM9 Snai2-201ENSMUST00000023356 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NischQ80TM9 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NischQ80TM9 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NischQ80TM9 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NischQ80TM9 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NischQ80TM9 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NischQ80TM9 Nppa-201ENSMUST00000103230 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NischQ80TM9 Srd5a3-202ENSMUST00000113506 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NischQ80TM9 Gm15615-201ENSMUST00000118876 198 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
NischQ80TM9 1700123M08Rik-202ENSMUST00000146154 770 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NischQ80TM9 Gzmc-201ENSMUST00000015585 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NischQ80TM9 Gm16081-201ENSMUST00000155992 684 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NischQ80TM9 Gm15469-201ENSMUST00000201750 961 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NischQ80TM9 Gm44759-201ENSMUST00000206057 430 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NischQ80TM9 AC114645.1-201ENSMUST00000215831 187 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
NischQ80TM9 Apoc4-201ENSMUST00000003071 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NischQ80TM9 Mnd1-201ENSMUST00000047368 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NischQ80TM9 Chmp3-202ENSMUST00000065364 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NischQ80TM9 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NischQ80TM9 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NischQ80TM9 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NischQ80TM9 Ephx1-201ENSMUST00000036928 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NischQ80TM9 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NischQ80TM9 Slc37a4-202ENSMUST00000213268 1353 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
NischQ80TM9 Srsf5-201ENSMUST00000094693 1527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
NischQ80TM9 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
NischQ80TM9 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NischQ80TM9 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NischQ80TM9 Ino80c-203ENSMUST00000141489 2207 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NischQ80TM9 Rffl-205ENSMUST00000103218 1264 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NischQ80TM9 Bach2it1-201ENSMUST00000133451 481 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NischQ80TM9 Smim20-201ENSMUST00000147148 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NischQ80TM9 A930005H10Rik-204ENSMUST00000185681 625 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NischQ80TM9 A930005H10Rik-206ENSMUST00000188260 739 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NischQ80TM9 Gng8-202ENSMUST00000205459 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NischQ80TM9 Tex29-205ENSMUST00000209692 884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NischQ80TM9 AC164105.2-201ENSMUST00000215484 524 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NischQ80TM9 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NischQ80TM9 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NischQ80TM9 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NischQ80TM9 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NischQ80TM9 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NischQ80TM9 EU599041-202ENSMUST00000205291 1386 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NischQ80TM9 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NischQ80TM9 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NischQ80TM9 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NischQ80TM9 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NischQ80TM9 Fam3a-201ENSMUST00000015427 1427 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
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