Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSQ1

Clec18a, C-type lectin domain family 18 member A, mousemouse

Predictions only

Length 534 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clec18aQ7TSQ1 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Clec18aQ7TSQ1 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Clec18aQ7TSQ1 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Clec18aQ7TSQ1 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Clec18aQ7TSQ1 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Clec18aQ7TSQ1 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Clec18aQ7TSQ1 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Clec18aQ7TSQ1 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Clec18aQ7TSQ1 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Clec18aQ7TSQ1 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Clec18aQ7TSQ1 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Clec18aQ7TSQ1 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Clec18aQ7TSQ1 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Clec18aQ7TSQ1 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Clec18aQ7TSQ1 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Clec18aQ7TSQ1 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Clec18aQ7TSQ1 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Clec18aQ7TSQ1 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Clec18aQ7TSQ1 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Clec18aQ7TSQ1 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Clec18aQ7TSQ1 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Clec18aQ7TSQ1 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Clec18aQ7TSQ1 Dctn6-203ENSMUST00000118811 934 ntTSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Clec18aQ7TSQ1 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Clec18aQ7TSQ1 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Clec18aQ7TSQ1 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Clec18aQ7TSQ1 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Clec18aQ7TSQ1 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Clec18aQ7TSQ1 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Clec18aQ7TSQ1 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Clec18aQ7TSQ1 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Clec18aQ7TSQ1 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Clec18aQ7TSQ1 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Clec18aQ7TSQ1 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Clec18aQ7TSQ1 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Clec18aQ7TSQ1 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Clec18aQ7TSQ1 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Clec18aQ7TSQ1 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Clec18aQ7TSQ1 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Clec18aQ7TSQ1 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Clec18aQ7TSQ1 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Clec18aQ7TSQ1 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Clec18aQ7TSQ1 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Clec18aQ7TSQ1 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Clec18aQ7TSQ1 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Clec18aQ7TSQ1 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Clec18aQ7TSQ1 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Clec18aQ7TSQ1 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Clec18aQ7TSQ1 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Clec18aQ7TSQ1 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Clec18aQ7TSQ1 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Clec18aQ7TSQ1 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Clec18aQ7TSQ1 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Clec18aQ7TSQ1 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Clec18aQ7TSQ1 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Clec18aQ7TSQ1 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Clec18aQ7TSQ1 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Clec18aQ7TSQ1 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Clec18aQ7TSQ1 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Clec18aQ7TSQ1 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Clec18aQ7TSQ1 4933424N20Rik-201ENSMUST00000200749 1463 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Clec18aQ7TSQ1 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Clec18aQ7TSQ1 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Clec18aQ7TSQ1 Gm12012-201ENSMUST00000118857 1066 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Clec18aQ7TSQ1 Gm14017-201ENSMUST00000121934 386 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Clec18aQ7TSQ1 Platr29-201ENSMUST00000130022 830 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Clec18aQ7TSQ1 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Clec18aQ7TSQ1 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Clec18aQ7TSQ1 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Clec18aQ7TSQ1 Mir3547-201ENSMUST00000175461 88 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Clec18aQ7TSQ1 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Clec18aQ7TSQ1 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Clec18aQ7TSQ1 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Clec18aQ7TSQ1 Calca-204ENSMUST00000205714 416 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Clec18aQ7TSQ1 Gm44992-206ENSMUST00000209313 1261 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Clec18aQ7TSQ1 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Clec18aQ7TSQ1 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Clec18aQ7TSQ1 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Clec18aQ7TSQ1 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Clec18aQ7TSQ1 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Clec18aQ7TSQ1 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Clec18aQ7TSQ1 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Clec18aQ7TSQ1 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Clec18aQ7TSQ1 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Clec18aQ7TSQ1 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Clec18aQ7TSQ1 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Clec18aQ7TSQ1 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Clec18aQ7TSQ1 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Clec18aQ7TSQ1 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Clec18aQ7TSQ1 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Clec18aQ7TSQ1 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Clec18aQ7TSQ1 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Clec18aQ7TSQ1 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Clec18aQ7TSQ1 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Clec18aQ7TSQ1 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Clec18aQ7TSQ1 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Clec18aQ7TSQ1 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Clec18aQ7TSQ1 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Clec18aQ7TSQ1 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Clec18aQ7TSQ1 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.8 ms