Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSH7

Kcnf1, Potassium voltage-gated channel subfamily F member 1, mousemouse

Predictions only

Length 493 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnf1Q7TSH7 Lef1-201ENSMUST00000029611 3482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Kcnf1Q7TSH7 Zfp251-201ENSMUST00000080406 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Kcnf1Q7TSH7 Gm20425-201ENSMUST00000166836 3028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Kcnf1Q7TSH7 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Kcnf1Q7TSH7 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Kcnf1Q7TSH7 AC124577.2-201ENSMUST00000217413 2420 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Kcnf1Q7TSH7 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Kcnf1Q7TSH7 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Kcnf1Q7TSH7 Crispld2-202ENSMUST00000108972 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Kcnf1Q7TSH7 Stom-201ENSMUST00000028241 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Kcnf1Q7TSH7 Morf4l2-204ENSMUST00000113097 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Kcnf1Q7TSH7 Agpat3-211ENSMUST00000166360 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Kcnf1Q7TSH7 Plet1-201ENSMUST00000114474 1689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Kcnf1Q7TSH7 Jaml-201ENSMUST00000050020 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Kcnf1Q7TSH7 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Kcnf1Q7TSH7 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Kcnf1Q7TSH7 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Kcnf1Q7TSH7 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Kcnf1Q7TSH7 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Kcnf1Q7TSH7 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Kcnf1Q7TSH7 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Kcnf1Q7TSH7 Aldh4a1-201ENSMUST00000039818 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Kcnf1Q7TSH7 H2-M2-201ENSMUST00000016427 1550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Kcnf1Q7TSH7 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Kcnf1Q7TSH7 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Kcnf1Q7TSH7 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Kcnf1Q7TSH7 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Kcnf1Q7TSH7 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Kcnf1Q7TSH7 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Kcnf1Q7TSH7 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Kcnf1Q7TSH7 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Kcnf1Q7TSH7 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Kcnf1Q7TSH7 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Kcnf1Q7TSH7 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Kcnf1Q7TSH7 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Kcnf1Q7TSH7 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Kcnf1Q7TSH7 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Kcnf1Q7TSH7 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Kcnf1Q7TSH7 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Kcnf1Q7TSH7 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Kcnf1Q7TSH7 Ptgir-202ENSMUST00000144408 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Kcnf1Q7TSH7 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Kcnf1Q7TSH7 4931406C07Rik-202ENSMUST00000178977 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Kcnf1Q7TSH7 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Kcnf1Q7TSH7 Ces2d-ps-201ENSMUST00000043209 1656 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Kcnf1Q7TSH7 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Kcnf1Q7TSH7 Tmem25-202ENSMUST00000114705 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Kcnf1Q7TSH7 2810404F17Rik-201ENSMUST00000156615 1704 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Kcnf1Q7TSH7 A430033K04Rik-203ENSMUST00000198958 2264 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Kcnf1Q7TSH7 Kifap3-201ENSMUST00000027877 3946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Kcnf1Q7TSH7 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Kcnf1Q7TSH7 Rdh13-201ENSMUST00000008579 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Kcnf1Q7TSH7 Slc37a4-207ENSMUST00000215420 2128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Kcnf1Q7TSH7 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Kcnf1Q7TSH7 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Kcnf1Q7TSH7 Elavl2-204ENSMUST00000107110 3671 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Kcnf1Q7TSH7 Astn1-209ENSMUST00000194369 3344 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Kcnf1Q7TSH7 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Kcnf1Q7TSH7 Ccdc97-201ENSMUST00000002683 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Kcnf1Q7TSH7 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Kcnf1Q7TSH7 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Kcnf1Q7TSH7 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Kcnf1Q7TSH7 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Kcnf1Q7TSH7 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Kcnf1Q7TSH7 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Kcnf1Q7TSH7 Gm19891-201ENSMUST00000189771 303 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Kcnf1Q7TSH7 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Kcnf1Q7TSH7 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Kcnf1Q7TSH7 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Kcnf1Q7TSH7 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Kcnf1Q7TSH7 Scpep1-201ENSMUST00000000287 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Kcnf1Q7TSH7 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Kcnf1Q7TSH7 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Kcnf1Q7TSH7 Zfyve26-203ENSMUST00000218377 2726 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Kcnf1Q7TSH7 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Kcnf1Q7TSH7 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Kcnf1Q7TSH7 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Kcnf1Q7TSH7 BC043934-202ENSMUST00000185694 2356 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Kcnf1Q7TSH7 Fcrl1-203ENSMUST00000167200 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Kcnf1Q7TSH7 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Kcnf1Q7TSH7 Serinc4-202ENSMUST00000110613 2240 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Kcnf1Q7TSH7 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Kcnf1Q7TSH7 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Kcnf1Q7TSH7 Cklf-202ENSMUST00000098464 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Kcnf1Q7TSH7 Matn2-201ENSMUST00000022947 3551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Kcnf1Q7TSH7 Adcy9-201ENSMUST00000005719 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Kcnf1Q7TSH7 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Kcnf1Q7TSH7 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Kcnf1Q7TSH7 Sstr3-201ENSMUST00000053239 3928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Kcnf1Q7TSH7 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Kcnf1Q7TSH7 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Kcnf1Q7TSH7 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Kcnf1Q7TSH7 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Kcnf1Q7TSH7 Dcun1d3-202ENSMUST00000098080 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Kcnf1Q7TSH7 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Kcnf1Q7TSH7 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Kcnf1Q7TSH7 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Kcnf1Q7TSH7 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Kcnf1Q7TSH7 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Kcnf1Q7TSH7 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
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