Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSC1

Prrc2a, Protein PRRC2A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,158 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrc2aQ7TSC1 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Prrc2aQ7TSC1 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Prrc2aQ7TSC1 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Prrc2aQ7TSC1 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Prrc2aQ7TSC1 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Prrc2aQ7TSC1 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Prrc2aQ7TSC1 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Prrc2aQ7TSC1 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Prrc2aQ7TSC1 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Prrc2aQ7TSC1 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Prrc2aQ7TSC1 Nphs1os-201ENSMUST00000152625 1339 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Prrc2aQ7TSC1 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Prrc2aQ7TSC1 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Prrc2aQ7TSC1 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Prrc2aQ7TSC1 H2-Bl-202ENSMUST00000183560 316 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Prrc2aQ7TSC1 Insig2-214ENSMUST00000186915 674 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Prrc2aQ7TSC1 Gm18038-201ENSMUST00000197900 485 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Prrc2aQ7TSC1 Ccdc12-201ENSMUST00000019803 834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Prrc2aQ7TSC1 AC107638.1-201ENSMUST00000213690 1061 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Prrc2aQ7TSC1 AC166992.1-201ENSMUST00000216356 565 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Prrc2aQ7TSC1 Tas2r126-201ENSMUST00000059534 930 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Prrc2aQ7TSC1 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Prrc2aQ7TSC1 Mir219a-1-201ENSMUST00000083621 110 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Prrc2aQ7TSC1 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Prrc2aQ7TSC1 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Prrc2aQ7TSC1 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Prrc2aQ7TSC1 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Prrc2aQ7TSC1 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Prrc2aQ7TSC1 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Prrc2aQ7TSC1 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Prrc2aQ7TSC1 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Prrc2aQ7TSC1 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Prrc2aQ7TSC1 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Prrc2aQ7TSC1 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Prrc2aQ7TSC1 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Prrc2aQ7TSC1 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Prrc2aQ7TSC1 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Prrc2aQ7TSC1 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Prrc2aQ7TSC1 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Prrc2aQ7TSC1 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Prrc2aQ7TSC1 Bbs5-202ENSMUST00000112286 1397 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Prrc2aQ7TSC1 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Prrc2aQ7TSC1 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Prrc2aQ7TSC1 Gm5525-201ENSMUST00000190438 1312 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Prrc2aQ7TSC1 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Prrc2aQ7TSC1 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Prrc2aQ7TSC1 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Prrc2aQ7TSC1 Gm14199-201ENSMUST00000130021 495 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Prrc2aQ7TSC1 Tmem190-201ENSMUST00000013235 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Prrc2aQ7TSC1 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Prrc2aQ7TSC1 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Prrc2aQ7TSC1 Cox6a2-201ENSMUST00000033049 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Prrc2aQ7TSC1 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Prrc2aQ7TSC1 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Prrc2aQ7TSC1 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Prrc2aQ7TSC1 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Prrc2aQ7TSC1 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Prrc2aQ7TSC1 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Prrc2aQ7TSC1 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Prrc2aQ7TSC1 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Prrc2aQ7TSC1 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Prrc2aQ7TSC1 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Prrc2aQ7TSC1 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Prrc2aQ7TSC1 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Prrc2aQ7TSC1 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Prrc2aQ7TSC1 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Prrc2aQ7TSC1 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Prrc2aQ7TSC1 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Prrc2aQ7TSC1 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Prrc2aQ7TSC1 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Prrc2aQ7TSC1 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Prrc2aQ7TSC1 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Prrc2aQ7TSC1 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Prrc2aQ7TSC1 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Prrc2aQ7TSC1 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Prrc2aQ7TSC1 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Prrc2aQ7TSC1 Ssc4d-202ENSMUST00000111150 459 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Prrc2aQ7TSC1 Gm14644-201ENSMUST00000116671 647 ntBASIC10.15□□□□□ -0.79
Prrc2aQ7TSC1 Gm15711-201ENSMUST00000118889 535 ntBASIC10.15□□□□□ -0.79
Prrc2aQ7TSC1 Rpsa-ps4-201ENSMUST00000121691 888 ntBASIC10.15□□□□□ -0.79
Prrc2aQ7TSC1 Gm15972-201ENSMUST00000132571 418 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Prrc2aQ7TSC1 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Prrc2aQ7TSC1 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Prrc2aQ7TSC1 F12-202ENSMUST00000170921 478 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Prrc2aQ7TSC1 Rps13-ps2-201ENSMUST00000182017 453 ntBASIC10.15□□□□□ -0.79
Prrc2aQ7TSC1 Gm9358-201ENSMUST00000183067 927 ntBASIC10.15□□□□□ -0.79
Prrc2aQ7TSC1 Gm28778-201ENSMUST00000190734 785 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Prrc2aQ7TSC1 Gm43962-201ENSMUST00000203898 190 ntBASIC10.15□□□□□ -0.79
Prrc2aQ7TSC1 AC159462.1-201ENSMUST00000214822 687 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Prrc2aQ7TSC1 Gm6781-201ENSMUST00000038304 1242 ntBASIC10.15□□□□□ -0.79
Prrc2aQ7TSC1 Sftpd-201ENSMUST00000077136 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Prrc2aQ7TSC1 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Prrc2aQ7TSC1 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Prrc2aQ7TSC1 Bahcc1-202ENSMUST00000118987 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Prrc2aQ7TSC1 Shank2-202ENSMUST00000105900 8169 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Prrc2aQ7TSC1 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Prrc2aQ7TSC1 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Prrc2aQ7TSC1 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Prrc2aQ7TSC1 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Prrc2aQ7TSC1 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
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