Protein–RNA interactions for Protein: Q78T54

Vma21, Vacuolar ATPase assembly integral membrane protein Vma21, mousemouse

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Length 101 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vma21Q78T54 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vma21Q78T54 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vma21Q78T54 Sptbn2-201ENSMUST00000008991 8251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vma21Q78T54 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vma21Q78T54 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vma21Q78T54 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vma21Q78T54 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vma21Q78T54 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vma21Q78T54 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vma21Q78T54 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vma21Q78T54 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Vma21Q78T54 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vma21Q78T54 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vma21Q78T54 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Vma21Q78T54 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vma21Q78T54 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Vma21Q78T54 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Vma21Q78T54 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vma21Q78T54 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vma21Q78T54 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vma21Q78T54 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Vma21Q78T54 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vma21Q78T54 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vma21Q78T54 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vma21Q78T54 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vma21Q78T54 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vma21Q78T54 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vma21Q78T54 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Vma21Q78T54 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Vma21Q78T54 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vma21Q78T54 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vma21Q78T54 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vma21Q78T54 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vma21Q78T54 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vma21Q78T54 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vma21Q78T54 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vma21Q78T54 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vma21Q78T54 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vma21Q78T54 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vma21Q78T54 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vma21Q78T54 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vma21Q78T54 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vma21Q78T54 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Vma21Q78T54 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vma21Q78T54 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vma21Q78T54 Tex2-201ENSMUST00000042780 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vma21Q78T54 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vma21Q78T54 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Vma21Q78T54 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vma21Q78T54 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vma21Q78T54 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vma21Q78T54 Chl1-204ENSMUST00000203912 4628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vma21Q78T54 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vma21Q78T54 Akap10-202ENSMUST00000102650 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vma21Q78T54 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vma21Q78T54 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vma21Q78T54 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vma21Q78T54 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vma21Q78T54 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Vma21Q78T54 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
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Vma21Q78T54 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
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Vma21Q78T54 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vma21Q78T54 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vma21Q78T54 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
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Vma21Q78T54 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vma21Q78T54 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vma21Q78T54 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vma21Q78T54 E2f3-201ENSMUST00000102948 5097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vma21Q78T54 Abcc10-204ENSMUST00000167360 4866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vma21Q78T54 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vma21Q78T54 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vma21Q78T54 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Vma21Q78T54 Armcx4-201ENSMUST00000124226 7996 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vma21Q78T54 Pcdhga6-201ENSMUST00000195823 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vma21Q78T54 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vma21Q78T54 Csnk1g1-202ENSMUST00000117849 5173 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vma21Q78T54 Mfap3l-203ENSMUST00000161421 4142 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vma21Q78T54 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vma21Q78T54 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vma21Q78T54 Sel1l-210ENSMUST00000178462 6150 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vma21Q78T54 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vma21Q78T54 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vma21Q78T54 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vma21Q78T54 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vma21Q78T54 Cbl-211ENSMUST00000206720 11372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vma21Q78T54 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vma21Q78T54 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vma21Q78T54 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Vma21Q78T54 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vma21Q78T54 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vma21Q78T54 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Vma21Q78T54 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
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