Protein–RNA interactions for Protein: Q78J03

Msrb2, Methionine-R-sulfoxide reductase B2, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 175 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msrb2Q78J03 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Msrb2Q78J03 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Msrb2Q78J03 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Msrb2Q78J03 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Msrb2Q78J03 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Msrb2Q78J03 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Msrb2Q78J03 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Msrb2Q78J03 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Msrb2Q78J03 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Msrb2Q78J03 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Msrb2Q78J03 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Msrb2Q78J03 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Msrb2Q78J03 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Msrb2Q78J03 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Msrb2Q78J03 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Msrb2Q78J03 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Msrb2Q78J03 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Msrb2Q78J03 Gm11892-201ENSMUST00000117711 1202 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Msrb2Q78J03 Selenot-ps-201ENSMUST00000119098 593 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Msrb2Q78J03 Asb8-202ENSMUST00000123626 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Msrb2Q78J03 Asb8-203ENSMUST00000123922 1162 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Msrb2Q78J03 Gm3948-201ENSMUST00000147795 421 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Msrb2Q78J03 5730437C11Rik-201ENSMUST00000155540 242 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Msrb2Q78J03 Gm22144-201ENSMUST00000157402 102 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Msrb2Q78J03 Gm20535-201ENSMUST00000173157 1268 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Msrb2Q78J03 Gm23153-201ENSMUST00000175323 313 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Msrb2Q78J03 Mir6958-201ENSMUST00000184207 73 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Msrb2Q78J03 1700011B04Rik-212ENSMUST00000223526 889 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Msrb2Q78J03 AC115122.1-201ENSMUST00000224850 1040 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Msrb2Q78J03 Ngdn-201ENSMUST00000022815 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Msrb2Q78J03 Emp3-201ENSMUST00000038876 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Msrb2Q78J03 Rdh16f2-201ENSMUST00000092058 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Msrb2Q78J03 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Msrb2Q78J03 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Msrb2Q78J03 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Msrb2Q78J03 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Msrb2Q78J03 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Msrb2Q78J03 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Msrb2Q78J03 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Msrb2Q78J03 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Msrb2Q78J03 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Msrb2Q78J03 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Msrb2Q78J03 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Msrb2Q78J03 Scoc-202ENSMUST00000167525 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Msrb2Q78J03 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Msrb2Q78J03 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Msrb2Q78J03 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Msrb2Q78J03 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Msrb2Q78J03 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Msrb2Q78J03 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Msrb2Q78J03 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Msrb2Q78J03 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Msrb2Q78J03 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Msrb2Q78J03 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Msrb2Q78J03 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Msrb2Q78J03 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Msrb2Q78J03 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Msrb2Q78J03 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Msrb2Q78J03 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Msrb2Q78J03 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Msrb2Q78J03 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Msrb2Q78J03 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Msrb2Q78J03 4933434E20Rik-206ENSMUST00000160640 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Msrb2Q78J03 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Msrb2Q78J03 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Msrb2Q78J03 Olfr22-ps1-201ENSMUST00000115991 1237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Msrb2Q78J03 Gm11509-201ENSMUST00000117358 325 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Msrb2Q78J03 Gm11451-201ENSMUST00000118946 630 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Msrb2Q78J03 Mir1901-201ENSMUST00000122616 78 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Msrb2Q78J03 Dnmt3bos-201ENSMUST00000124988 718 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Msrb2Q78J03 Gm4726-201ENSMUST00000135604 736 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Msrb2Q78J03 Gm6019-201ENSMUST00000148369 736 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Msrb2Q78J03 Rprl1-201ENSMUST00000158050 327 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Msrb2Q78J03 Ager-207ENSMUST00000173992 1248 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Msrb2Q78J03 Rn7s6-201ENSMUST00000175005 291 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Msrb2Q78J03 8030442B05Rik-201ENSMUST00000192626 1035 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Msrb2Q78J03 Gm42518-201ENSMUST00000196277 938 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Msrb2Q78J03 Ccdc12-201ENSMUST00000019803 834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Msrb2Q78J03 Gm33201-201ENSMUST00000204791 855 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Msrb2Q78J03 Gng8-204ENSMUST00000205716 432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Msrb2Q78J03 Pgam2-201ENSMUST00000020768 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Msrb2Q78J03 Gm34821-201ENSMUST00000208399 1031 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Msrb2Q78J03 Gm2517-201ENSMUST00000215651 348 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Msrb2Q78J03 AC132901.1-201ENSMUST00000224345 508 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Msrb2Q78J03 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Msrb2Q78J03 Gm5705-201ENSMUST00000066241 711 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Msrb2Q78J03 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Msrb2Q78J03 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Msrb2Q78J03 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Msrb2Q78J03 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Msrb2Q78J03 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Msrb2Q78J03 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Msrb2Q78J03 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Msrb2Q78J03 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Msrb2Q78J03 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Msrb2Q78J03 Gnrhr-202ENSMUST00000094654 1475 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Msrb2Q78J03 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Msrb2Q78J03 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Msrb2Q78J03 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Msrb2Q78J03 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms