Protein–RNA interactions for Protein: Q6VGS5

Ccdc88c, Protein Daple, mousemouse

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Length 2,009 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88cQ6VGS5 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc88cQ6VGS5 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc88cQ6VGS5 Gm11989-201ENSMUST00000117240 672 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc88cQ6VGS5 Gm11362-201ENSMUST00000118838 850 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc88cQ6VGS5 Gm16481-201ENSMUST00000119074 1227 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc88cQ6VGS5 Gm13442-201ENSMUST00000135749 663 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc88cQ6VGS5 Tnni2-206ENSMUST00000149529 768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc88cQ6VGS5 Gm26361-201ENSMUST00000158868 186 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc88cQ6VGS5 Ldlrad2-201ENSMUST00000178923 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc88cQ6VGS5 Ank3-234ENSMUST00000182993 1233 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc88cQ6VGS5 Vdac1-201ENSMUST00000020673 891 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc88cQ6VGS5 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc88cQ6VGS5 AC160052.1-201ENSMUST00000213173 1248 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc88cQ6VGS5 AC167229.2-201ENSMUST00000218902 675 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc88cQ6VGS5 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc88cQ6VGS5 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc88cQ6VGS5 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc88cQ6VGS5 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc88cQ6VGS5 Thegl-201ENSMUST00000031161 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc88cQ6VGS5 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc88cQ6VGS5 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc88cQ6VGS5 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc88cQ6VGS5 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc88cQ6VGS5 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc88cQ6VGS5 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc88cQ6VGS5 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc88cQ6VGS5 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc88cQ6VGS5 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc88cQ6VGS5 Gm37131-201ENSMUST00000192502 1561 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc88cQ6VGS5 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc88cQ6VGS5 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc88cQ6VGS5 Spata48-201ENSMUST00000020410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc88cQ6VGS5 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc88cQ6VGS5 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc88cQ6VGS5 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc88cQ6VGS5 Has2os-201ENSMUST00000125401 485 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc88cQ6VGS5 Gm13587-201ENSMUST00000152645 366 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc88cQ6VGS5 Gm3625-201ENSMUST00000170816 102 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc88cQ6VGS5 Gm29087-201ENSMUST00000186462 645 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc88cQ6VGS5 Abhd11os-203ENSMUST00000222613 363 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc88cQ6VGS5 Eef1d-203ENSMUST00000089680 973 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc88cQ6VGS5 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc88cQ6VGS5 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc88cQ6VGS5 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc88cQ6VGS5 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc88cQ6VGS5 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc88cQ6VGS5 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc88cQ6VGS5 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc88cQ6VGS5 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc88cQ6VGS5 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc88cQ6VGS5 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc88cQ6VGS5 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc88cQ6VGS5 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc88cQ6VGS5 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc88cQ6VGS5 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc88cQ6VGS5 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc88cQ6VGS5 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc88cQ6VGS5 Tmem50a-202ENSMUST00000105863 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc88cQ6VGS5 Gm13996-201ENSMUST00000118456 430 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc88cQ6VGS5 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc88cQ6VGS5 Gm20537-202ENSMUST00000173131 889 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc88cQ6VGS5 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc88cQ6VGS5 Gm29264-201ENSMUST00000191240 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc88cQ6VGS5 Gm31224-201ENSMUST00000212682 513 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc88cQ6VGS5 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc88cQ6VGS5 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc88cQ6VGS5 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc88cQ6VGS5 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc88cQ6VGS5 Wac-216ENSMUST00000171486 1608 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc88cQ6VGS5 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc88cQ6VGS5 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc88cQ6VGS5 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc88cQ6VGS5 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc88cQ6VGS5 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc88cQ6VGS5 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc88cQ6VGS5 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc88cQ6VGS5 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc88cQ6VGS5 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc88cQ6VGS5 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc88cQ6VGS5 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc88cQ6VGS5 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc88cQ6VGS5 Gm16505-201ENSMUST00000179981 232 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc88cQ6VGS5 Anapc16-202ENSMUST00000182116 581 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc88cQ6VGS5 Gm9230-201ENSMUST00000188228 532 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc88cQ6VGS5 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc88cQ6VGS5 CT571245.2-201ENSMUST00000218421 305 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc88cQ6VGS5 Mettl5-201ENSMUST00000060447 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc88cQ6VGS5 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc88cQ6VGS5 Asb18-202ENSMUST00000097656 788 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc88cQ6VGS5 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc88cQ6VGS5 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc88cQ6VGS5 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc88cQ6VGS5 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc88cQ6VGS5 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc88cQ6VGS5 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc88cQ6VGS5 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc88cQ6VGS5 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc88cQ6VGS5 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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