Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEE2

Ctif, CBP80/20-dependent translation initiation factor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 600 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtifQ6PEE2 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
CtifQ6PEE2 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
CtifQ6PEE2 Rpap1-203ENSMUST00000110793 5458 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
CtifQ6PEE2 Cyp4b1-201ENSMUST00000102707 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
CtifQ6PEE2 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
CtifQ6PEE2 Vps54-201ENSMUST00000006221 4323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
CtifQ6PEE2 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
CtifQ6PEE2 Rgs12-203ENSMUST00000114280 2777 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CtifQ6PEE2 Spesp1-201ENSMUST00000056949 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CtifQ6PEE2 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CtifQ6PEE2 Sstr3-201ENSMUST00000053239 3928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CtifQ6PEE2 Srebf1-201ENSMUST00000020846 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CtifQ6PEE2 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CtifQ6PEE2 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CtifQ6PEE2 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CtifQ6PEE2 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CtifQ6PEE2 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
CtifQ6PEE2 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CtifQ6PEE2 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
CtifQ6PEE2 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CtifQ6PEE2 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CtifQ6PEE2 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
CtifQ6PEE2 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CtifQ6PEE2 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CtifQ6PEE2 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CtifQ6PEE2 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CtifQ6PEE2 Gm45428-201ENSMUST00000209619 1789 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
CtifQ6PEE2 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
CtifQ6PEE2 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CtifQ6PEE2 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CtifQ6PEE2 Matn2-201ENSMUST00000022947 3551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CtifQ6PEE2 Lox-201ENSMUST00000025409 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CtifQ6PEE2 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CtifQ6PEE2 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CtifQ6PEE2 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CtifQ6PEE2 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
CtifQ6PEE2 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CtifQ6PEE2 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CtifQ6PEE2 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CtifQ6PEE2 1700019D03Rik-201ENSMUST00000050567 3641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CtifQ6PEE2 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CtifQ6PEE2 Gm10829-201ENSMUST00000202084 2988 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
CtifQ6PEE2 Rad17-201ENSMUST00000022136 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CtifQ6PEE2 Gm38115-201ENSMUST00000194317 2413 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CtifQ6PEE2 Tapbpl-201ENSMUST00000043422 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CtifQ6PEE2 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CtifQ6PEE2 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CtifQ6PEE2 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CtifQ6PEE2 Igf1-201ENSMUST00000062862 2292 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CtifQ6PEE2 Rai2-201ENSMUST00000061514 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CtifQ6PEE2 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CtifQ6PEE2 Oas1d-201ENSMUST00000044224 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CtifQ6PEE2 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CtifQ6PEE2 Nsd3-210ENSMUST00000153597 1865 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CtifQ6PEE2 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CtifQ6PEE2 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CtifQ6PEE2 Brd1-202ENSMUST00000109380 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CtifQ6PEE2 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CtifQ6PEE2 Ablim1-213ENSMUST00000111559 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CtifQ6PEE2 Mfsd4b5-202ENSMUST00000073618 2978 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CtifQ6PEE2 Crybg3-205ENSMUST00000172910 2870 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CtifQ6PEE2 Hyal3-202ENSMUST00000148440 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CtifQ6PEE2 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CtifQ6PEE2 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
CtifQ6PEE2 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CtifQ6PEE2 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CtifQ6PEE2 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CtifQ6PEE2 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CtifQ6PEE2 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CtifQ6PEE2 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CtifQ6PEE2 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
CtifQ6PEE2 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CtifQ6PEE2 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CtifQ6PEE2 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CtifQ6PEE2 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CtifQ6PEE2 Aldh16a1-206ENSMUST00000209963 3537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CtifQ6PEE2 Foxred1-201ENSMUST00000043805 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CtifQ6PEE2 Klhl14-202ENSMUST00000122333 4423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CtifQ6PEE2 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CtifQ6PEE2 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CtifQ6PEE2 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CtifQ6PEE2 Tfr2-206ENSMUST00000198783 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CtifQ6PEE2 Pidd1-202ENSMUST00000106005 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CtifQ6PEE2 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CtifQ6PEE2 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CtifQ6PEE2 Slc6a5-202ENSMUST00000107605 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CtifQ6PEE2 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CtifQ6PEE2 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CtifQ6PEE2 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CtifQ6PEE2 Ppp1r18-201ENSMUST00000113814 3131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CtifQ6PEE2 Slc9a1-201ENSMUST00000030669 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CtifQ6PEE2 Vsig10l-201ENSMUST00000107977 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CtifQ6PEE2 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CtifQ6PEE2 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CtifQ6PEE2 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CtifQ6PEE2 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CtifQ6PEE2 Wt1os-203ENSMUST00000172701 2960 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CtifQ6PEE2 Astn1-211ENSMUST00000195311 3642 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CtifQ6PEE2 Rps6ka6-202ENSMUST00000082034 4170 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CtifQ6PEE2 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
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