Protein–RNA interactions for Protein: Q6KCD5

Nipbl, Nipped-B-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,798 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NipblQ6KCD5 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
NipblQ6KCD5 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
NipblQ6KCD5 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
NipblQ6KCD5 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
NipblQ6KCD5 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
NipblQ6KCD5 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
NipblQ6KCD5 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
NipblQ6KCD5 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
NipblQ6KCD5 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
NipblQ6KCD5 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
NipblQ6KCD5 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
NipblQ6KCD5 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC9.47□□□□□ -0.89
NipblQ6KCD5 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
NipblQ6KCD5 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
NipblQ6KCD5 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
NipblQ6KCD5 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
NipblQ6KCD5 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
NipblQ6KCD5 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
NipblQ6KCD5 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
NipblQ6KCD5 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
NipblQ6KCD5 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
NipblQ6KCD5 Gm14190-201ENSMUST00000105073 153 ntAPPRIS P1 BASIC9.46□□□□□ -0.89
NipblQ6KCD5 Gm12501-201ENSMUST00000119163 529 ntBASIC9.46□□□□□ -0.89
NipblQ6KCD5 Gm13668-201ENSMUST00000119237 1001 ntBASIC9.46□□□□□ -0.89
NipblQ6KCD5 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC9.46□□□□□ -0.89
NipblQ6KCD5 Gm5555-201ENSMUST00000120352 1111 ntBASIC9.46□□□□□ -0.89
NipblQ6KCD5 Gm14004-201ENSMUST00000138875 590 ntTSL 2 BASIC9.46□□□□□ -0.89
NipblQ6KCD5 4930471C06Rik-202ENSMUST00000143070 579 ntTSL 3 BASIC9.46□□□□□ -0.89
NipblQ6KCD5 AC158355.1-201ENSMUST00000215895 1705 ntBASIC9.46□□□□□ -0.89
NipblQ6KCD5 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
NipblQ6KCD5 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
NipblQ6KCD5 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
NipblQ6KCD5 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
NipblQ6KCD5 Dubr-204ENSMUST00000186944 2052 ntTSL 2 BASIC9.46□□□□□ -0.89
NipblQ6KCD5 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
NipblQ6KCD5 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
NipblQ6KCD5 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC9.46□□□□□ -0.89
NipblQ6KCD5 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
NipblQ6KCD5 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC9.46□□□□□ -0.89
NipblQ6KCD5 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
NipblQ6KCD5 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
NipblQ6KCD5 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
NipblQ6KCD5 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.89
NipblQ6KCD5 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
NipblQ6KCD5 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
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NipblQ6KCD5 Slc6a21-201ENSMUST00000085364 1732 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
NipblQ6KCD5 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
NipblQ6KCD5 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
NipblQ6KCD5 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
NipblQ6KCD5 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
NipblQ6KCD5 Gm12915-201ENSMUST00000131381 1499 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
NipblQ6KCD5 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.46□□□□□ -0.9
NipblQ6KCD5 Nudt7-204ENSMUST00000134593 707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
NipblQ6KCD5 Gm10550-201ENSMUST00000188846 982 ntTSL 2 BASIC9.46□□□□□ -0.9
NipblQ6KCD5 D5Ertd615e-203ENSMUST00000198493 1032 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
NipblQ6KCD5 Mllt11-204ENSMUST00000198948 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.46□□□□□ -0.9
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NipblQ6KCD5 Gm40983-201ENSMUST00000222524 502 ntTSL 3 BASIC9.46□□□□□ -0.9
NipblQ6KCD5 Pebp4-201ENSMUST00000022678 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
NipblQ6KCD5 Prok2-201ENSMUST00000008273 594 ntTSL 3 BASIC9.46□□□□□ -0.9
NipblQ6KCD5 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC9.46□□□□□ -0.9
NipblQ6KCD5 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
NipblQ6KCD5 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
NipblQ6KCD5 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
NipblQ6KCD5 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
NipblQ6KCD5 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
NipblQ6KCD5 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
NipblQ6KCD5 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
NipblQ6KCD5 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.9
NipblQ6KCD5 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
NipblQ6KCD5 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
NipblQ6KCD5 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
NipblQ6KCD5 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
NipblQ6KCD5 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
NipblQ6KCD5 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
NipblQ6KCD5 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
NipblQ6KCD5 Krtap4-8-201ENSMUST00000107439 983 ntAPPRIS P1 BASIC9.46□□□□□ -0.9
NipblQ6KCD5 Gm14314-201ENSMUST00000118225 1015 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
NipblQ6KCD5 Gm13624-201ENSMUST00000120263 462 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
NipblQ6KCD5 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
NipblQ6KCD5 Gm6397-201ENSMUST00000161973 1069 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
NipblQ6KCD5 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC9.46□□□□□ -0.9
NipblQ6KCD5 Nr1h2-ps-201ENSMUST00000183844 478 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
NipblQ6KCD5 Shisa5-205ENSMUST00000197099 742 ntTSL 3 BASIC9.46□□□□□ -0.9
NipblQ6KCD5 CT025553.1-201ENSMUST00000226292 299 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
NipblQ6KCD5 Hils1-201ENSMUST00000038928 864 ntAPPRIS P1 BASIC9.46□□□□□ -0.9
NipblQ6KCD5 Ifi27-201ENSMUST00000066701 889 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
NipblQ6KCD5 Cmbl-201ENSMUST00000070918 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
NipblQ6KCD5 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
NipblQ6KCD5 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.46□□□□□ -0.9
NipblQ6KCD5 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
NipblQ6KCD5 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
NipblQ6KCD5 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.46□□□□□ -0.9
NipblQ6KCD5 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
NipblQ6KCD5 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
NipblQ6KCD5 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC9.45□□□□□ -0.9
NipblQ6KCD5 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
NipblQ6KCD5 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
NipblQ6KCD5 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
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