Protein–RNA interactions for Protein: Q6EBV9

Atg9b, Autophagy-related protein 9B, mousemouse

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Length 922 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg9bQ6EBV9 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Atg9bQ6EBV9 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Atg9bQ6EBV9 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Atg9bQ6EBV9 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Atg9bQ6EBV9 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Atg9bQ6EBV9 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Atg9bQ6EBV9 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Atg9bQ6EBV9 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Atg9bQ6EBV9 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Atg9bQ6EBV9 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Atg9bQ6EBV9 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Atg9bQ6EBV9 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Atg9bQ6EBV9 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Atg9bQ6EBV9 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Atg9bQ6EBV9 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Atg9bQ6EBV9 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Atg9bQ6EBV9 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Atg9bQ6EBV9 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Atg9bQ6EBV9 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Atg9bQ6EBV9 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Atg9bQ6EBV9 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Atg9bQ6EBV9 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Atg9bQ6EBV9 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Atg9bQ6EBV9 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Atg9bQ6EBV9 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Atg9bQ6EBV9 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Atg9bQ6EBV9 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Atg9bQ6EBV9 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Atg9bQ6EBV9 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Atg9bQ6EBV9 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
Atg9bQ6EBV9 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atg9bQ6EBV9 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atg9bQ6EBV9 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atg9bQ6EBV9 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atg9bQ6EBV9 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Atg9bQ6EBV9 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atg9bQ6EBV9 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atg9bQ6EBV9 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atg9bQ6EBV9 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atg9bQ6EBV9 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atg9bQ6EBV9 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atg9bQ6EBV9 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Atg9bQ6EBV9 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atg9bQ6EBV9 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Atg9bQ6EBV9 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atg9bQ6EBV9 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atg9bQ6EBV9 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atg9bQ6EBV9 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atg9bQ6EBV9 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atg9bQ6EBV9 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atg9bQ6EBV9 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Atg9bQ6EBV9 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Atg9bQ6EBV9 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Atg9bQ6EBV9 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atg9bQ6EBV9 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Atg9bQ6EBV9 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Atg9bQ6EBV9 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atg9bQ6EBV9 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atg9bQ6EBV9 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atg9bQ6EBV9 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atg9bQ6EBV9 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atg9bQ6EBV9 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atg9bQ6EBV9 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atg9bQ6EBV9 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atg9bQ6EBV9 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atg9bQ6EBV9 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atg9bQ6EBV9 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atg9bQ6EBV9 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atg9bQ6EBV9 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atg9bQ6EBV9 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atg9bQ6EBV9 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atg9bQ6EBV9 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atg9bQ6EBV9 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atg9bQ6EBV9 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atg9bQ6EBV9 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atg9bQ6EBV9 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atg9bQ6EBV9 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atg9bQ6EBV9 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atg9bQ6EBV9 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atg9bQ6EBV9 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atg9bQ6EBV9 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Atg9bQ6EBV9 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atg9bQ6EBV9 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atg9bQ6EBV9 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atg9bQ6EBV9 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atg9bQ6EBV9 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atg9bQ6EBV9 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atg9bQ6EBV9 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atg9bQ6EBV9 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atg9bQ6EBV9 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atg9bQ6EBV9 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atg9bQ6EBV9 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atg9bQ6EBV9 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atg9bQ6EBV9 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atg9bQ6EBV9 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atg9bQ6EBV9 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atg9bQ6EBV9 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atg9bQ6EBV9 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Atg9bQ6EBV9 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atg9bQ6EBV9 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms