Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFW4

Nop58, Nucleolar protein 58, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 536 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop58Q6DFW4 Mark3-208ENSMUST00000221753 2394 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nop58Q6DFW4 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nop58Q6DFW4 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nop58Q6DFW4 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nop58Q6DFW4 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nop58Q6DFW4 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nop58Q6DFW4 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nop58Q6DFW4 Cd300lf-201ENSMUST00000051264 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nop58Q6DFW4 Pbrm1-208ENSMUST00000112098 6566 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nop58Q6DFW4 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nop58Q6DFW4 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nop58Q6DFW4 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nop58Q6DFW4 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nop58Q6DFW4 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nop58Q6DFW4 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Nop58Q6DFW4 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Nop58Q6DFW4 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nop58Q6DFW4 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nop58Q6DFW4 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nop58Q6DFW4 Sypl2-201ENSMUST00000141387 4090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nop58Q6DFW4 Fip1l1-204ENSMUST00000113536 4769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nop58Q6DFW4 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nop58Q6DFW4 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Nop58Q6DFW4 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nop58Q6DFW4 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nop58Q6DFW4 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nop58Q6DFW4 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nop58Q6DFW4 Rps6kl1-202ENSMUST00000221972 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nop58Q6DFW4 Fam172a-201ENSMUST00000091459 3892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nop58Q6DFW4 Ifnar1-201ENSMUST00000023689 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nop58Q6DFW4 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nop58Q6DFW4 Zfp941-201ENSMUST00000080651 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nop58Q6DFW4 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nop58Q6DFW4 Olfml3-201ENSMUST00000029440 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nop58Q6DFW4 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nop58Q6DFW4 Ttc27-201ENSMUST00000024882 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nop58Q6DFW4 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Nop58Q6DFW4 A930038B10Rik-202ENSMUST00000181044 3415 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nop58Q6DFW4 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nop58Q6DFW4 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Nop58Q6DFW4 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nop58Q6DFW4 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Nop58Q6DFW4 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Nop58Q6DFW4 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Nop58Q6DFW4 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Nop58Q6DFW4 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Nop58Q6DFW4 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nop58Q6DFW4 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nop58Q6DFW4 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nop58Q6DFW4 Mical1-202ENSMUST00000099934 3292 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nop58Q6DFW4 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nop58Q6DFW4 Dmp1-201ENSMUST00000066708 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nop58Q6DFW4 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nop58Q6DFW4 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nop58Q6DFW4 Bcl2l14-201ENSMUST00000032321 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nop58Q6DFW4 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nop58Q6DFW4 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nop58Q6DFW4 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nop58Q6DFW4 Myo16-203ENSMUST00000207477 7169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nop58Q6DFW4 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nop58Q6DFW4 Clpb-211ENSMUST00000209579 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nop58Q6DFW4 Vmn1r45-206ENSMUST00000227977 3297 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nop58Q6DFW4 Patl1-201ENSMUST00000061618 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nop58Q6DFW4 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nop58Q6DFW4 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Nop58Q6DFW4 Gck-201ENSMUST00000102920 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nop58Q6DFW4 Stat3-202ENSMUST00000103114 6042 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nop58Q6DFW4 E330021D16Rik-203ENSMUST00000204830 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nop58Q6DFW4 Fam107b-201ENSMUST00000027965 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nop58Q6DFW4 Tmcc2-203ENSMUST00000132435 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nop58Q6DFW4 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Nop58Q6DFW4 Rnf17-201ENSMUST00000095793 5264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nop58Q6DFW4 Ttbk2-202ENSMUST00000057135 11066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nop58Q6DFW4 Gm45496-201ENSMUST00000209918 2917 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Nop58Q6DFW4 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nop58Q6DFW4 Acsl6-202ENSMUST00000064690 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nop58Q6DFW4 Nrd1-203ENSMUST00000106644 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nop58Q6DFW4 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nop58Q6DFW4 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nop58Q6DFW4 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nop58Q6DFW4 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nop58Q6DFW4 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nop58Q6DFW4 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nop58Q6DFW4 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nop58Q6DFW4 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nop58Q6DFW4 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nop58Q6DFW4 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nop58Q6DFW4 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nop58Q6DFW4 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nop58Q6DFW4 Ambra1-203ENSMUST00000099712 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nop58Q6DFW4 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nop58Q6DFW4 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nop58Q6DFW4 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nop58Q6DFW4 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nop58Q6DFW4 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nop58Q6DFW4 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nop58Q6DFW4 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nop58Q6DFW4 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nop58Q6DFW4 Poldip3-201ENSMUST00000058793 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nop58Q6DFW4 Hmbox1-202ENSMUST00000067843 2931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms