Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZS0

Pdzrn3, E3 ubiquitin-protein ligase PDZRN3, mousemouse

Predictions only

Length 1,063 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzrn3Q69ZS0 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pdzrn3Q69ZS0 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pdzrn3Q69ZS0 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pdzrn3Q69ZS0 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pdzrn3Q69ZS0 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pdzrn3Q69ZS0 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pdzrn3Q69ZS0 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pdzrn3Q69ZS0 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pdzrn3Q69ZS0 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pdzrn3Q69ZS0 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pdzrn3Q69ZS0 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pdzrn3Q69ZS0 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pdzrn3Q69ZS0 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pdzrn3Q69ZS0 Gm16481-201ENSMUST00000119074 1227 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Pdzrn3Q69ZS0 Nmb-202ENSMUST00000119428 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pdzrn3Q69ZS0 Gm12714-201ENSMUST00000143391 669 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pdzrn3Q69ZS0 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pdzrn3Q69ZS0 Gm45224-201ENSMUST00000208203 414 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Pdzrn3Q69ZS0 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Pdzrn3Q69ZS0 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pdzrn3Q69ZS0 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pdzrn3Q69ZS0 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pdzrn3Q69ZS0 Mybphl-201ENSMUST00000090563 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pdzrn3Q69ZS0 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pdzrn3Q69ZS0 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pdzrn3Q69ZS0 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pdzrn3Q69ZS0 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pdzrn3Q69ZS0 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pdzrn3Q69ZS0 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pdzrn3Q69ZS0 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pdzrn3Q69ZS0 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pdzrn3Q69ZS0 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pdzrn3Q69ZS0 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pdzrn3Q69ZS0 Dynlrb1-202ENSMUST00000109682 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pdzrn3Q69ZS0 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pdzrn3Q69ZS0 Bnip3-203ENSMUST00000130500 719 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pdzrn3Q69ZS0 Gm14235-201ENSMUST00000142445 366 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pdzrn3Q69ZS0 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pdzrn3Q69ZS0 Gm42791-202ENSMUST00000147473 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pdzrn3Q69ZS0 Gm17087-201ENSMUST00000184183 471 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pdzrn3Q69ZS0 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pdzrn3Q69ZS0 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pdzrn3Q69ZS0 Aprt-ps-201ENSMUST00000212311 505 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Pdzrn3Q69ZS0 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pdzrn3Q69ZS0 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Pdzrn3Q69ZS0 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Pdzrn3Q69ZS0 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pdzrn3Q69ZS0 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Pdzrn3Q69ZS0 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pdzrn3Q69ZS0 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Pdzrn3Q69ZS0 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pdzrn3Q69ZS0 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pdzrn3Q69ZS0 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pdzrn3Q69ZS0 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pdzrn3Q69ZS0 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Pdzrn3Q69ZS0 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pdzrn3Q69ZS0 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pdzrn3Q69ZS0 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pdzrn3Q69ZS0 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pdzrn3Q69ZS0 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pdzrn3Q69ZS0 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pdzrn3Q69ZS0 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pdzrn3Q69ZS0 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pdzrn3Q69ZS0 6030466F02Rik-201ENSMUST00000212339 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pdzrn3Q69ZS0 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pdzrn3Q69ZS0 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pdzrn3Q69ZS0 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pdzrn3Q69ZS0 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pdzrn3Q69ZS0 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pdzrn3Q69ZS0 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pdzrn3Q69ZS0 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pdzrn3Q69ZS0 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pdzrn3Q69ZS0 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pdzrn3Q69ZS0 Gsdma2-201ENSMUST00000017355 1314 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pdzrn3Q69ZS0 AC079680.2-201ENSMUST00000219181 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pdzrn3Q69ZS0 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pdzrn3Q69ZS0 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pdzrn3Q69ZS0 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pdzrn3Q69ZS0 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pdzrn3Q69ZS0 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pdzrn3Q69ZS0 Pmp22-203ENSMUST00000108701 723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pdzrn3Q69ZS0 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Pdzrn3Q69ZS0 Rtbdn-203ENSMUST00000121880 1223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pdzrn3Q69ZS0 Gm15891-201ENSMUST00000127307 611 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pdzrn3Q69ZS0 Gm14051-201ENSMUST00000131603 377 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pdzrn3Q69ZS0 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pdzrn3Q69ZS0 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pdzrn3Q69ZS0 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pdzrn3Q69ZS0 D530033B14Rik-202ENSMUST00000206282 216 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Pdzrn3Q69ZS0 Gm3898-202ENSMUST00000216905 328 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pdzrn3Q69ZS0 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Pdzrn3Q69ZS0 Abhd14a-201ENSMUST00000048685 1256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pdzrn3Q69ZS0 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pdzrn3Q69ZS0 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pdzrn3Q69ZS0 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pdzrn3Q69ZS0 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pdzrn3Q69ZS0 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Pdzrn3Q69ZS0 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pdzrn3Q69ZS0 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pdzrn3Q69ZS0 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.7 ms