Protein–RNA interactions for Protein: Q68FH0

Pkp4, Plakophilin-4, mousemouse

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Length 1,190 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp4Q68FH0 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pkp4Q68FH0 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pkp4Q68FH0 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pkp4Q68FH0 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pkp4Q68FH0 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pkp4Q68FH0 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pkp4Q68FH0 Plxna1-201ENSMUST00000049845 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pkp4Q68FH0 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pkp4Q68FH0 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pkp4Q68FH0 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pkp4Q68FH0 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pkp4Q68FH0 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
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Pkp4Q68FH0 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pkp4Q68FH0 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pkp4Q68FH0 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pkp4Q68FH0 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pkp4Q68FH0 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pkp4Q68FH0 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pkp4Q68FH0 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pkp4Q68FH0 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pkp4Q68FH0 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pkp4Q68FH0 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pkp4Q68FH0 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pkp4Q68FH0 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pkp4Q68FH0 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pkp4Q68FH0 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pkp4Q68FH0 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
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Pkp4Q68FH0 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
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Pkp4Q68FH0 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pkp4Q68FH0 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pkp4Q68FH0 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pkp4Q68FH0 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pkp4Q68FH0 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
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Pkp4Q68FH0 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
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Pkp4Q68FH0 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
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Pkp4Q68FH0 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pkp4Q68FH0 Rapgef2-202ENSMUST00000118340 6544 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
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Pkp4Q68FH0 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pkp4Q68FH0 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
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Pkp4Q68FH0 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
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Pkp4Q68FH0 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pkp4Q68FH0 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pkp4Q68FH0 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
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Pkp4Q68FH0 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pkp4Q68FH0 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pkp4Q68FH0 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
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Pkp4Q68FH0 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pkp4Q68FH0 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pkp4Q68FH0 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pkp4Q68FH0 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pkp4Q68FH0 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pkp4Q68FH0 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pkp4Q68FH0 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pkp4Q68FH0 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Pkp4Q68FH0 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Pkp4Q68FH0 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pkp4Q68FH0 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pkp4Q68FH0 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pkp4Q68FH0 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pkp4Q68FH0 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pkp4Q68FH0 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pkp4Q68FH0 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pkp4Q68FH0 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pkp4Q68FH0 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pkp4Q68FH0 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pkp4Q68FH0 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pkp4Q68FH0 Kif2a-202ENSMUST00000117423 2023 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pkp4Q68FH0 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
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