Protein–RNA interactions for Protein: Q68FE2

Atg9a, Autophagy-related protein 9A, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg9aQ68FE2 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Atg9aQ68FE2 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Atg9aQ68FE2 Wdr31-201ENSMUST00000030087 1440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Atg9aQ68FE2 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Atg9aQ68FE2 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Atg9aQ68FE2 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Atg9aQ68FE2 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Atg9aQ68FE2 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Atg9aQ68FE2 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Atg9aQ68FE2 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Atg9aQ68FE2 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Atg9aQ68FE2 Gm15711-201ENSMUST00000118889 535 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Atg9aQ68FE2 Spata3-211ENSMUST00000159876 760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Atg9aQ68FE2 Gm29615-201ENSMUST00000185371 697 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Atg9aQ68FE2 Gm28224-201ENSMUST00000186078 697 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Atg9aQ68FE2 Gm29001-201ENSMUST00000186177 697 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Atg9aQ68FE2 Gm28292-201ENSMUST00000186593 697 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Atg9aQ68FE2 Gm28101-201ENSMUST00000187608 697 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Atg9aQ68FE2 Gm29076-201ENSMUST00000187689 697 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Atg9aQ68FE2 Gm28302-201ENSMUST00000187931 697 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Atg9aQ68FE2 Gm28646-201ENSMUST00000188220 697 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Atg9aQ68FE2 Gm28205-201ENSMUST00000189177 697 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Atg9aQ68FE2 Gm29032-201ENSMUST00000189797 697 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Atg9aQ68FE2 Gm28695-201ENSMUST00000190300 697 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Atg9aQ68FE2 Gm37448-201ENSMUST00000192795 697 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Atg9aQ68FE2 Gm43962-201ENSMUST00000203898 190 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Atg9aQ68FE2 Gm45339-201ENSMUST00000210823 877 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Atg9aQ68FE2 Abhd14b-210ENSMUST00000217496 631 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Atg9aQ68FE2 Abracl-204ENSMUST00000220110 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Atg9aQ68FE2 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Atg9aQ68FE2 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Atg9aQ68FE2 Henmt1-205ENSMUST00000196533 1491 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Atg9aQ68FE2 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Atg9aQ68FE2 Dync1i2-202ENSMUST00000100028 2097 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Atg9aQ68FE2 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Atg9aQ68FE2 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Atg9aQ68FE2 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Atg9aQ68FE2 Jhy-201ENSMUST00000034521 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Atg9aQ68FE2 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Atg9aQ68FE2 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Atg9aQ68FE2 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Atg9aQ68FE2 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Atg9aQ68FE2 Crem-233ENSMUST00000154135 2530 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Atg9aQ68FE2 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Atg9aQ68FE2 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Atg9aQ68FE2 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Atg9aQ68FE2 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Atg9aQ68FE2 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Atg9aQ68FE2 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Atg9aQ68FE2 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Atg9aQ68FE2 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Atg9aQ68FE2 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Atg9aQ68FE2 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Atg9aQ68FE2 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Atg9aQ68FE2 Dnajb12-203ENSMUST00000142819 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Atg9aQ68FE2 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Atg9aQ68FE2 Prr15l-203ENSMUST00000107633 930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Atg9aQ68FE2 Gng7-205ENSMUST00000118465 875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Atg9aQ68FE2 Gm14247-201ENSMUST00000120950 237 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Atg9aQ68FE2 Rtbdn-203ENSMUST00000121880 1223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Atg9aQ68FE2 Gm12690-201ENSMUST00000132108 354 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Atg9aQ68FE2 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Atg9aQ68FE2 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Atg9aQ68FE2 4930539M17Rik-201ENSMUST00000194792 846 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Atg9aQ68FE2 Gm18711-201ENSMUST00000199341 750 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Atg9aQ68FE2 AC153954.1-201ENSMUST00000216959 255 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Atg9aQ68FE2 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Atg9aQ68FE2 CT025694.1-201ENSMUST00000226188 934 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Atg9aQ68FE2 Ankrd2-201ENSMUST00000026172 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Atg9aQ68FE2 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Atg9aQ68FE2 Ndufaf5-201ENSMUST00000044825 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Atg9aQ68FE2 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Atg9aQ68FE2 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Atg9aQ68FE2 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Atg9aQ68FE2 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Atg9aQ68FE2 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Atg9aQ68FE2 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Atg9aQ68FE2 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Atg9aQ68FE2 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Atg9aQ68FE2 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Atg9aQ68FE2 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Atg9aQ68FE2 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Atg9aQ68FE2 Tectb-202ENSMUST00000120936 1349 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Atg9aQ68FE2 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Atg9aQ68FE2 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Atg9aQ68FE2 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Atg9aQ68FE2 Anxa11-201ENSMUST00000022416 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Atg9aQ68FE2 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Atg9aQ68FE2 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Atg9aQ68FE2 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Atg9aQ68FE2 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Atg9aQ68FE2 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Atg9aQ68FE2 Gngt2-207ENSMUST00000107714 558 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Atg9aQ68FE2 Fgf8-204ENSMUST00000111925 702 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Atg9aQ68FE2 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Atg9aQ68FE2 Zfp36l1-ps-201ENSMUST00000118349 899 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Atg9aQ68FE2 BC026585-202ENSMUST00000119891 1125 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Atg9aQ68FE2 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Atg9aQ68FE2 H2-Bl-202ENSMUST00000183560 316 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Atg9aQ68FE2 Olfr1347-205ENSMUST00000220413 964 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.8 ms