Protein–RNA interactions for Protein: Q64705

Usf2, Upstream stimulatory factor 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usf2Q64705 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Usf2Q64705 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Usf2Q64705 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Usf2Q64705 Rnf43-203ENSMUST00000121782 2640 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Usf2Q64705 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Usf2Q64705 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Usf2Q64705 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Usf2Q64705 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Usf2Q64705 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Usf2Q64705 Fen1-202ENSMUST00000116542 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Usf2Q64705 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Usf2Q64705 Fosb-201ENSMUST00000003640 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Usf2Q64705 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Usf2Q64705 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Usf2Q64705 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Usf2Q64705 Uqcc1-203ENSMUST00000109632 2313 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Usf2Q64705 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Usf2Q64705 Cit-202ENSMUST00000102560 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Usf2Q64705 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Usf2Q64705 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Usf2Q64705 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Usf2Q64705 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Usf2Q64705 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Usf2Q64705 Ubap1-201ENSMUST00000072866 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Usf2Q64705 Ern1-201ENSMUST00000001059 6946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Usf2Q64705 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Usf2Q64705 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Usf2Q64705 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Usf2Q64705 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Usf2Q64705 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Usf2Q64705 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Usf2Q64705 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Usf2Q64705 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Usf2Q64705 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Usf2Q64705 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Usf2Q64705 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Usf2Q64705 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Usf2Q64705 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Usf2Q64705 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Usf2Q64705 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Usf2Q64705 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Usf2Q64705 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Usf2Q64705 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Usf2Q64705 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Usf2Q64705 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Usf2Q64705 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Usf2Q64705 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Usf2Q64705 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Usf2Q64705 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Usf2Q64705 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Usf2Q64705 Otog-201ENSMUST00000164538 10043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Usf2Q64705 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Usf2Q64705 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Usf2Q64705 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Usf2Q64705 Bhlha15-201ENSMUST00000060747 3494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Usf2Q64705 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Usf2Q64705 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Usf2Q64705 Tom1l2-203ENSMUST00000093048 4864 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Usf2Q64705 Slc46a2-201ENSMUST00000030081 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Usf2Q64705 Coq8a-201ENSMUST00000027766 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Usf2Q64705 Sema5b-201ENSMUST00000050625 4350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Usf2Q64705 Apold1-201ENSMUST00000167323 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Usf2Q64705 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Usf2Q64705 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
Usf2Q64705 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Usf2Q64705 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Usf2Q64705 Gucy1a3-204ENSMUST00000193924 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Usf2Q64705 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Usf2Q64705 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Usf2Q64705 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Usf2Q64705 Lbh-201ENSMUST00000024857 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Usf2Q64705 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Usf2Q64705 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Usf2Q64705 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Usf2Q64705 Slc1a2-202ENSMUST00000080210 11595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Usf2Q64705 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Usf2Q64705 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Usf2Q64705 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Usf2Q64705 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Usf2Q64705 Dpep1-201ENSMUST00000019422 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Usf2Q64705 Avpr2-202ENSMUST00000101470 2787 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Usf2Q64705 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Usf2Q64705 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Usf2Q64705 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Usf2Q64705 Rims4-201ENSMUST00000044734 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Usf2Q64705 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Usf2Q64705 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Usf2Q64705 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Usf2Q64705 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Usf2Q64705 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Usf2Q64705 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Usf2Q64705 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Usf2Q64705 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Usf2Q64705 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Usf2Q64705 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Usf2Q64705 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Usf2Q64705 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Usf2Q64705 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Usf2Q64705 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Usf2Q64705 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.2 ms