Protein–RNA interactions for Protein: Q62361

Trh, Pro-thyrotropin-releasing hormone, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrhQ62361 Gm9230-201ENSMUST00000188228 532 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TrhQ62361 1700081H04Rik-201ENSMUST00000190550 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TrhQ62361 Gm37028-201ENSMUST00000194276 107 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TrhQ62361 Gm31479-201ENSMUST00000209936 522 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TrhQ62361 AC133602.1-201ENSMUST00000227510 509 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TrhQ62361 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TrhQ62361 Rsph14-201ENSMUST00000009214 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TrhQ62361 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TrhQ62361 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TrhQ62361 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TrhQ62361 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TrhQ62361 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TrhQ62361 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TrhQ62361 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TrhQ62361 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TrhQ62361 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TrhQ62361 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TrhQ62361 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TrhQ62361 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TrhQ62361 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TrhQ62361 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TrhQ62361 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TrhQ62361 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TrhQ62361 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TrhQ62361 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TrhQ62361 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TrhQ62361 Gm10785-201ENSMUST00000156242 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TrhQ62361 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TrhQ62361 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TrhQ62361 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TrhQ62361 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TrhQ62361 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TrhQ62361 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TrhQ62361 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TrhQ62361 Ppil6-201ENSMUST00000105507 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TrhQ62361 Ccl27a-204ENSMUST00000108035 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TrhQ62361 Ccl27a-205ENSMUST00000108036 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TrhQ62361 Ccl27a-206ENSMUST00000108037 590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TrhQ62361 Rmdn1-202ENSMUST00000108253 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TrhQ62361 Gm13073-201ENSMUST00000134059 486 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TrhQ62361 Gm25881-201ENSMUST00000157783 103 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TrhQ62361 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TrhQ62361 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TrhQ62361 Lmo3-202ENSMUST00000161450 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TrhQ62361 A430050A11Rik-201ENSMUST00000195348 646 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TrhQ62361 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TrhQ62361 Gm45338-201ENSMUST00000209198 820 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TrhQ62361 Ankrd2-201ENSMUST00000026172 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TrhQ62361 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TrhQ62361 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TrhQ62361 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TrhQ62361 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TrhQ62361 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TrhQ62361 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TrhQ62361 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TrhQ62361 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TrhQ62361 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TrhQ62361 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TrhQ62361 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TrhQ62361 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TrhQ62361 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TrhQ62361 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TrhQ62361 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TrhQ62361 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TrhQ62361 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TrhQ62361 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TrhQ62361 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TrhQ62361 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TrhQ62361 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TrhQ62361 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TrhQ62361 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TrhQ62361 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TrhQ62361 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TrhQ62361 Dnajb12-203ENSMUST00000142819 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TrhQ62361 Hist1h3d-201ENSMUST00000105105 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TrhQ62361 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TrhQ62361 Pcnp-203ENSMUST00000119981 901 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TrhQ62361 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TrhQ62361 Magohb-205ENSMUST00000173837 897 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TrhQ62361 Park2-204ENSMUST00000179624 1108 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TrhQ62361 2610027F03Rik-202ENSMUST00000186982 603 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TrhQ62361 Gm28778-201ENSMUST00000190734 785 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TrhQ62361 Gng8-204ENSMUST00000205716 432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TrhQ62361 Gm6905-201ENSMUST00000205729 511 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TrhQ62361 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TrhQ62361 Gm4797-201ENSMUST00000219075 1283 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TrhQ62361 Olfr1230-201ENSMUST00000099787 918 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TrhQ62361 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TrhQ62361 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TrhQ62361 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TrhQ62361 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TrhQ62361 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TrhQ62361 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TrhQ62361 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TrhQ62361 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TrhQ62361 Nphs1os-201ENSMUST00000152625 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TrhQ62361 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TrhQ62361 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TrhQ62361 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TrhQ62361 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.5 ms