Protein–RNA interactions for Protein: Q60772

Cdkn2c, Cyclin-dependent kinase 4 inhibitor C, mousemouse

Predictions only

Length 168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkn2cQ60772 Zfp516-202ENSMUST00000171238 7725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cdkn2cQ60772 Zfp516-201ENSMUST00000071233 7703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cdkn2cQ60772 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cdkn2cQ60772 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cdkn2cQ60772 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cdkn2cQ60772 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cdkn2cQ60772 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cdkn2cQ60772 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cdkn2cQ60772 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cdkn2cQ60772 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cdkn2cQ60772 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cdkn2cQ60772 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cdkn2cQ60772 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cdkn2cQ60772 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cdkn2cQ60772 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cdkn2cQ60772 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cdkn2cQ60772 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cdkn2cQ60772 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Cdkn2cQ60772 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Cdkn2cQ60772 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cdkn2cQ60772 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Cdkn2cQ60772 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cdkn2cQ60772 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cdkn2cQ60772 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cdkn2cQ60772 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cdkn2cQ60772 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cdkn2cQ60772 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cdkn2cQ60772 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cdkn2cQ60772 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cdkn2cQ60772 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cdkn2cQ60772 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cdkn2cQ60772 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cdkn2cQ60772 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cdkn2cQ60772 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cdkn2cQ60772 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cdkn2cQ60772 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cdkn2cQ60772 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cdkn2cQ60772 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cdkn2cQ60772 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cdkn2cQ60772 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cdkn2cQ60772 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cdkn2cQ60772 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cdkn2cQ60772 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cdkn2cQ60772 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cdkn2cQ60772 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cdkn2cQ60772 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cdkn2cQ60772 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cdkn2cQ60772 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cdkn2cQ60772 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cdkn2cQ60772 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cdkn2cQ60772 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cdkn2cQ60772 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cdkn2cQ60772 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cdkn2cQ60772 Rbm8a-202ENSMUST00000196456 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cdkn2cQ60772 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cdkn2cQ60772 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cdkn2cQ60772 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cdkn2cQ60772 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cdkn2cQ60772 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cdkn2cQ60772 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cdkn2cQ60772 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cdkn2cQ60772 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cdkn2cQ60772 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cdkn2cQ60772 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cdkn2cQ60772 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cdkn2cQ60772 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cdkn2cQ60772 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cdkn2cQ60772 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Cdkn2cQ60772 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cdkn2cQ60772 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cdkn2cQ60772 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cdkn2cQ60772 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cdkn2cQ60772 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Cdkn2cQ60772 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Cdkn2cQ60772 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Cdkn2cQ60772 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Cdkn2cQ60772 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cdkn2cQ60772 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cdkn2cQ60772 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Cdkn2cQ60772 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Cdkn2cQ60772 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cdkn2cQ60772 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Cdkn2cQ60772 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cdkn2cQ60772 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Cdkn2cQ60772 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cdkn2cQ60772 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cdkn2cQ60772 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cdkn2cQ60772 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cdkn2cQ60772 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cdkn2cQ60772 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cdkn2cQ60772 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cdkn2cQ60772 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cdkn2cQ60772 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cdkn2cQ60772 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cdkn2cQ60772 Ctdspl2-201ENSMUST00000036647 5053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cdkn2cQ60772 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cdkn2cQ60772 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cdkn2cQ60772 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cdkn2cQ60772 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cdkn2cQ60772 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms