Protein–RNA interactions for Protein: Q5F4S9

Trpm3, Transient receptor potential cation channel, subfamily M, member 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,721 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpm3Q5F4S9 Cox6a2-201ENSMUST00000033049 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trpm3Q5F4S9 Sstr2-201ENSMUST00000067591 1041 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trpm3Q5F4S9 Amtn-201ENSMUST00000073363 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trpm3Q5F4S9 Tepp-201ENSMUST00000098480 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trpm3Q5F4S9 6430571L13Rik-201ENSMUST00000042581 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trpm3Q5F4S9 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trpm3Q5F4S9 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trpm3Q5F4S9 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trpm3Q5F4S9 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trpm3Q5F4S9 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trpm3Q5F4S9 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trpm3Q5F4S9 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trpm3Q5F4S9 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trpm3Q5F4S9 Cd72-205ENSMUST00000107926 1419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trpm3Q5F4S9 Gm13910-201ENSMUST00000121752 1428 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Trpm3Q5F4S9 Cd72-203ENSMUST00000098105 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trpm3Q5F4S9 C130050O18Rik-202ENSMUST00000163940 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trpm3Q5F4S9 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
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Trpm3Q5F4S9 Gm16347-202ENSMUST00000149000 772 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trpm3Q5F4S9 Aamdc-213ENSMUST00000154853 883 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trpm3Q5F4S9 Gm3150-201ENSMUST00000166418 204 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Trpm3Q5F4S9 D8Ertd738e-201ENSMUST00000019506 616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trpm3Q5F4S9 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trpm3Q5F4S9 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trpm3Q5F4S9 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trpm3Q5F4S9 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trpm3Q5F4S9 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trpm3Q5F4S9 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Trpm3Q5F4S9 Tfdp1-201ENSMUST00000170909 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trpm3Q5F4S9 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trpm3Q5F4S9 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trpm3Q5F4S9 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trpm3Q5F4S9 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trpm3Q5F4S9 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trpm3Q5F4S9 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Trpm3Q5F4S9 Gm16312-201ENSMUST00000156285 362 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trpm3Q5F4S9 Gm8492-201ENSMUST00000182375 987 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
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Trpm3Q5F4S9 Gm34045-201ENSMUST00000217700 988 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Trpm3Q5F4S9 Gm34809-203ENSMUST00000222945 509 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trpm3Q5F4S9 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trpm3Q5F4S9 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trpm3Q5F4S9 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trpm3Q5F4S9 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trpm3Q5F4S9 Sypl-201ENSMUST00000020885 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trpm3Q5F4S9 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Trpm3Q5F4S9 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trpm3Q5F4S9 5430405H02Rik-201ENSMUST00000153616 1431 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trpm3Q5F4S9 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trpm3Q5F4S9 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trpm3Q5F4S9 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trpm3Q5F4S9 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trpm3Q5F4S9 Apoo-202ENSMUST00000113896 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Trpm3Q5F4S9 Nop56-204ENSMUST00000136621 868 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trpm3Q5F4S9 Gm22144-201ENSMUST00000157402 102 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
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Trpm3Q5F4S9 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Trpm3Q5F4S9 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trpm3Q5F4S9 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trpm3Q5F4S9 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trpm3Q5F4S9 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trpm3Q5F4S9 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trpm3Q5F4S9 Ncf4-201ENSMUST00000096357 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trpm3Q5F4S9 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trpm3Q5F4S9 Gm37348-201ENSMUST00000193104 1789 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Trpm3Q5F4S9 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trpm3Q5F4S9 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trpm3Q5F4S9 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Trpm3Q5F4S9 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trpm3Q5F4S9 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trpm3Q5F4S9 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trpm3Q5F4S9 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trpm3Q5F4S9 Cdk2ap1-202ENSMUST00000111472 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trpm3Q5F4S9 Gm15207-201ENSMUST00000119259 442 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Trpm3Q5F4S9 Coa3-202ENSMUST00000168089 291 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trpm3Q5F4S9 Rpl19-201ENSMUST00000017548 751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trpm3Q5F4S9 Gm6905-201ENSMUST00000205729 511 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Trpm3Q5F4S9 Psmg2-201ENSMUST00000025418 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trpm3Q5F4S9 Asna1-201ENSMUST00000064314 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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