Protein–RNA interactions for Protein: Q3UP44

Nhlrc4, NHL-repeat-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlrc4Q3UP44 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Nhlrc4Q3UP44 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Nhlrc4Q3UP44 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Nhlrc4Q3UP44 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Nhlrc4Q3UP44 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Nhlrc4Q3UP44 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Nhlrc4Q3UP44 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Nhlrc4Q3UP44 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Nhlrc4Q3UP44 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Nhlrc4Q3UP44 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Nhlrc4Q3UP44 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Nhlrc4Q3UP44 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Nhlrc4Q3UP44 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Nhlrc4Q3UP44 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Nhlrc4Q3UP44 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Nhlrc4Q3UP44 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Nhlrc4Q3UP44 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Nhlrc4Q3UP44 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Nhlrc4Q3UP44 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Nhlrc4Q3UP44 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Nhlrc4Q3UP44 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Nhlrc4Q3UP44 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Nhlrc4Q3UP44 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Nhlrc4Q3UP44 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Nhlrc4Q3UP44 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Nhlrc4Q3UP44 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Nhlrc4Q3UP44 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Nhlrc4Q3UP44 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Nhlrc4Q3UP44 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Nhlrc4Q3UP44 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Nhlrc4Q3UP44 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Nhlrc4Q3UP44 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Nhlrc4Q3UP44 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Nhlrc4Q3UP44 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Nhlrc4Q3UP44 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Nhlrc4Q3UP44 Mirlet7c-2-201ENSMUST00000083674 95 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Nhlrc4Q3UP44 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Nhlrc4Q3UP44 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Nhlrc4Q3UP44 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Nhlrc4Q3UP44 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Nhlrc4Q3UP44 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Nhlrc4Q3UP44 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Nhlrc4Q3UP44 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Nhlrc4Q3UP44 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Nhlrc4Q3UP44 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Nhlrc4Q3UP44 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Nhlrc4Q3UP44 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Nhlrc4Q3UP44 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Nhlrc4Q3UP44 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Nhlrc4Q3UP44 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Nhlrc4Q3UP44 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Nhlrc4Q3UP44 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Nhlrc4Q3UP44 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Nhlrc4Q3UP44 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Nhlrc4Q3UP44 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Nhlrc4Q3UP44 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Nhlrc4Q3UP44 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Nhlrc4Q3UP44 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Nhlrc4Q3UP44 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Nhlrc4Q3UP44 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Nhlrc4Q3UP44 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Nhlrc4Q3UP44 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Nhlrc4Q3UP44 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Nhlrc4Q3UP44 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Nhlrc4Q3UP44 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Nhlrc4Q3UP44 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Nhlrc4Q3UP44 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Nhlrc4Q3UP44 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Nhlrc4Q3UP44 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Nhlrc4Q3UP44 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Nhlrc4Q3UP44 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Nhlrc4Q3UP44 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Nhlrc4Q3UP44 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Nhlrc4Q3UP44 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Nhlrc4Q3UP44 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Nhlrc4Q3UP44 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Nhlrc4Q3UP44 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Nhlrc4Q3UP44 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Nhlrc4Q3UP44 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Nhlrc4Q3UP44 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Nhlrc4Q3UP44 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Nhlrc4Q3UP44 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Nhlrc4Q3UP44 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Nhlrc4Q3UP44 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Nhlrc4Q3UP44 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Nhlrc4Q3UP44 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Nhlrc4Q3UP44 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Nhlrc4Q3UP44 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Nhlrc4Q3UP44 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Nhlrc4Q3UP44 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Nhlrc4Q3UP44 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Nhlrc4Q3UP44 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Nhlrc4Q3UP44 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Nhlrc4Q3UP44 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Nhlrc4Q3UP44 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Nhlrc4Q3UP44 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Nhlrc4Q3UP44 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Nhlrc4Q3UP44 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Nhlrc4Q3UP44 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Nhlrc4Q3UP44 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms