Protein–RNA interactions for Protein: Q3UNB8

Tmem253, Transmembrane protein 253, mousemouse

Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem253Q3UNB8 Hdac6-201ENSMUST00000033501 4142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmem253Q3UNB8 Rufy2-203ENSMUST00000122231 2664 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tmem253Q3UNB8 C230014O12Rik-201ENSMUST00000134921 2668 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tmem253Q3UNB8 Pfkp-201ENSMUST00000021614 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tmem253Q3UNB8 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tmem253Q3UNB8 Uqcc1-203ENSMUST00000109632 2313 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tmem253Q3UNB8 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tmem253Q3UNB8 Gm45897-201ENSMUST00000212679 1998 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tmem253Q3UNB8 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tmem253Q3UNB8 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tmem253Q3UNB8 Gucy2e-203ENSMUST00000108665 3645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tmem253Q3UNB8 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tmem253Q3UNB8 Parvg-201ENSMUST00000023074 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tmem253Q3UNB8 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tmem253Q3UNB8 Klhl14-201ENSMUST00000049105 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tmem253Q3UNB8 Arhgef9-206ENSMUST00000113884 3784 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tmem253Q3UNB8 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tmem253Q3UNB8 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tmem253Q3UNB8 Mtap-201ENSMUST00000058030 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tmem253Q3UNB8 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tmem253Q3UNB8 Jade2-203ENSMUST00000109091 6099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tmem253Q3UNB8 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tmem253Q3UNB8 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tmem253Q3UNB8 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tmem253Q3UNB8 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tmem253Q3UNB8 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tmem253Q3UNB8 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tmem253Q3UNB8 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tmem253Q3UNB8 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Tmem253Q3UNB8 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tmem253Q3UNB8 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Tmem253Q3UNB8 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tmem253Q3UNB8 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Tmem253Q3UNB8 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tmem253Q3UNB8 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tmem253Q3UNB8 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Tmem253Q3UNB8 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Tmem253Q3UNB8 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tmem253Q3UNB8 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tmem253Q3UNB8 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tmem253Q3UNB8 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tmem253Q3UNB8 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tmem253Q3UNB8 Trim55-201ENSMUST00000029139 2595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tmem253Q3UNB8 Lrmp-201ENSMUST00000032396 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tmem253Q3UNB8 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tmem253Q3UNB8 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tmem253Q3UNB8 Jak3-203ENSMUST00000110013 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tmem253Q3UNB8 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tmem253Q3UNB8 Satb2-205ENSMUST00000177424 4694 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tmem253Q3UNB8 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tmem253Q3UNB8 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tmem253Q3UNB8 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tmem253Q3UNB8 Zfp516-202ENSMUST00000171238 7725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tmem253Q3UNB8 Zfp516-201ENSMUST00000071233 7703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tmem253Q3UNB8 Dlc1-201ENSMUST00000033923 6159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tmem253Q3UNB8 Gfm1-201ENSMUST00000077271 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tmem253Q3UNB8 Dusp6-204ENSMUST00000220291 2359 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tmem253Q3UNB8 Pcdh15-238ENSMUST00000193739 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tmem253Q3UNB8 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tmem253Q3UNB8 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tmem253Q3UNB8 Gm14137-201ENSMUST00000069711 3067 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tmem253Q3UNB8 Robo3-201ENSMUST00000034643 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tmem253Q3UNB8 Rsl1-201ENSMUST00000021997 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tmem253Q3UNB8 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tmem253Q3UNB8 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tmem253Q3UNB8 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tmem253Q3UNB8 Camta2-206ENSMUST00000120261 4398 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tmem253Q3UNB8 Entpd8-203ENSMUST00000114380 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tmem253Q3UNB8 A930024N18Rik-201ENSMUST00000181251 3955 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tmem253Q3UNB8 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tmem253Q3UNB8 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tmem253Q3UNB8 Dcaf8-202ENSMUST00000191689 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tmem253Q3UNB8 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tmem253Q3UNB8 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tmem253Q3UNB8 Cep97-203ENSMUST00000118500 3389 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tmem253Q3UNB8 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tmem253Q3UNB8 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Tmem253Q3UNB8 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tmem253Q3UNB8 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tmem253Q3UNB8 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tmem253Q3UNB8 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tmem253Q3UNB8 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tmem253Q3UNB8 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Tmem253Q3UNB8 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tmem253Q3UNB8 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Tmem253Q3UNB8 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tmem253Q3UNB8 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tmem253Q3UNB8 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tmem253Q3UNB8 Stx5a-213ENSMUST00000176381 2251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tmem253Q3UNB8 Prpf8-201ENSMUST00000018449 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tmem253Q3UNB8 Pbx1-205ENSMUST00000176540 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tmem253Q3UNB8 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tmem253Q3UNB8 Rps6ka6-202ENSMUST00000082034 4170 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tmem253Q3UNB8 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tmem253Q3UNB8 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tmem253Q3UNB8 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tmem253Q3UNB8 Acsm1-201ENSMUST00000047929 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tmem253Q3UNB8 Gm37542-201ENSMUST00000192563 2832 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Tmem253Q3UNB8 Cd163l1-201ENSMUST00000084460 3454 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tmem253Q3UNB8 Grhl1-202ENSMUST00000085553 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.3 ms