Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJB0

Sf3b2, Splicing factor 3b, subunit 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 878 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b2Q3UJB0 Slc6a21-201ENSMUST00000085364 1732 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sf3b2Q3UJB0 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sf3b2Q3UJB0 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sf3b2Q3UJB0 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sf3b2Q3UJB0 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sf3b2Q3UJB0 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sf3b2Q3UJB0 Krtap4-6-201ENSMUST00000100476 918 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sf3b2Q3UJB0 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sf3b2Q3UJB0 Eef1akmt2-202ENSMUST00000120425 573 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sf3b2Q3UJB0 Gm16081-201ENSMUST00000155992 684 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sf3b2Q3UJB0 4930405O22Rik-201ENSMUST00000164605 954 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sf3b2Q3UJB0 Znrd1-202ENSMUST00000172518 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sf3b2Q3UJB0 Mrpl23-ps1-201ENSMUST00000173086 580 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Sf3b2Q3UJB0 Nlrp5-ps-202ENSMUST00000173220 1294 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Sf3b2Q3UJB0 Gm9116-201ENSMUST00000192400 1018 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Sf3b2Q3UJB0 Gm37707-201ENSMUST00000195309 325 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sf3b2Q3UJB0 D5Ertd615e-203ENSMUST00000198493 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sf3b2Q3UJB0 Gm44421-201ENSMUST00000205064 1221 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Sf3b2Q3UJB0 Gm3619-201ENSMUST00000219947 775 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Sf3b2Q3UJB0 Gm36074-201ENSMUST00000221383 591 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sf3b2Q3UJB0 1700011B04Rik-212ENSMUST00000223526 889 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sf3b2Q3UJB0 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sf3b2Q3UJB0 Actg1-201ENSMUST00000062147 876 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sf3b2Q3UJB0 Hist1h1b-201ENSMUST00000080511 743 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sf3b2Q3UJB0 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sf3b2Q3UJB0 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sf3b2Q3UJB0 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sf3b2Q3UJB0 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sf3b2Q3UJB0 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sf3b2Q3UJB0 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sf3b2Q3UJB0 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sf3b2Q3UJB0 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sf3b2Q3UJB0 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sf3b2Q3UJB0 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sf3b2Q3UJB0 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sf3b2Q3UJB0 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Sf3b2Q3UJB0 Gm19680-201ENSMUST00000095050 1513 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Sf3b2Q3UJB0 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sf3b2Q3UJB0 Dubr-204ENSMUST00000186944 2052 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sf3b2Q3UJB0 Drd3-201ENSMUST00000023390 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sf3b2Q3UJB0 4930465M20Rik-201ENSMUST00000130564 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sf3b2Q3UJB0 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sf3b2Q3UJB0 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sf3b2Q3UJB0 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sf3b2Q3UJB0 Cfap161-201ENSMUST00000011298 1335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sf3b2Q3UJB0 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Sf3b2Q3UJB0 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sf3b2Q3UJB0 Gtf2h5-202ENSMUST00000100955 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sf3b2Q3UJB0 Gm11511-201ENSMUST00000118146 540 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Sf3b2Q3UJB0 Gm7722-201ENSMUST00000120646 741 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Sf3b2Q3UJB0 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Sf3b2Q3UJB0 Hmgn3-201ENSMUST00000161796 862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sf3b2Q3UJB0 Gm8531-201ENSMUST00000188319 893 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Sf3b2Q3UJB0 Gm5100-201ENSMUST00000195631 589 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Sf3b2Q3UJB0 Gm43001-201ENSMUST00000198925 603 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sf3b2Q3UJB0 Gm18204-201ENSMUST00000209835 793 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Sf3b2Q3UJB0 Gm9797-202ENSMUST00000218003 294 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Sf3b2Q3UJB0 AC165260.2-203ENSMUST00000224237 336 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Sf3b2Q3UJB0 AC122350.1-201ENSMUST00000228135 533 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Sf3b2Q3UJB0 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sf3b2Q3UJB0 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sf3b2Q3UJB0 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sf3b2Q3UJB0 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sf3b2Q3UJB0 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sf3b2Q3UJB0 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sf3b2Q3UJB0 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sf3b2Q3UJB0 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sf3b2Q3UJB0 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sf3b2Q3UJB0 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sf3b2Q3UJB0 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sf3b2Q3UJB0 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sf3b2Q3UJB0 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sf3b2Q3UJB0 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sf3b2Q3UJB0 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sf3b2Q3UJB0 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sf3b2Q3UJB0 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sf3b2Q3UJB0 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sf3b2Q3UJB0 8430408G22Rik-202ENSMUST00000178241 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sf3b2Q3UJB0 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sf3b2Q3UJB0 Clic3-201ENSMUST00000102918 791 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sf3b2Q3UJB0 Gm12943-201ENSMUST00000119616 210 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Sf3b2Q3UJB0 Gm24398-201ENSMUST00000157870 109 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Sf3b2Q3UJB0 Wdr53-204ENSMUST00000178573 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sf3b2Q3UJB0 Gm27232-201ENSMUST00000184373 597 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sf3b2Q3UJB0 Gm29088-201ENSMUST00000189363 581 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sf3b2Q3UJB0 Gm38228-201ENSMUST00000193169 1293 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Sf3b2Q3UJB0 Gm44158-201ENSMUST00000203881 505 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Sf3b2Q3UJB0 2010109P13Rik-201ENSMUST00000204605 392 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Sf3b2Q3UJB0 Pgpep1l-202ENSMUST00000207874 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sf3b2Q3UJB0 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Sf3b2Q3UJB0 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sf3b2Q3UJB0 Ifitm2-201ENSMUST00000081649 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sf3b2Q3UJB0 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Sf3b2Q3UJB0 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sf3b2Q3UJB0 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Sf3b2Q3UJB0 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sf3b2Q3UJB0 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sf3b2Q3UJB0 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sf3b2Q3UJB0 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sf3b2Q3UJB0 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.9 ms