Protein–RNA interactions for Protein: Q3UD82

Parp8, Poly [ADP-ribose] polymerase 8, mousemouse

Predictions only

Length 852 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Parp8Q3UD82 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Parp8Q3UD82 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Parp8Q3UD82 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Parp8Q3UD82 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Parp8Q3UD82 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Parp8Q3UD82 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Parp8Q3UD82 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Parp8Q3UD82 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Parp8Q3UD82 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Parp8Q3UD82 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Parp8Q3UD82 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Parp8Q3UD82 Kalrn-201ENSMUST00000076810 8940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Parp8Q3UD82 Ophn1-201ENSMUST00000033560 7170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Parp8Q3UD82 Pex26-202ENSMUST00000118234 3778 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Parp8Q3UD82 Gm37600-201ENSMUST00000193764 3292 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Parp8Q3UD82 Olfr541-203ENSMUST00000210357 1642 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Parp8Q3UD82 Atad2-201ENSMUST00000038194 5684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Parp8Q3UD82 Adamts10-201ENSMUST00000087623 4043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Parp8Q3UD82 AC154314.2-201ENSMUST00000223677 3502 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Parp8Q3UD82 Scn8a-208ENSMUST00000200963 5814 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Parp8Q3UD82 P2ry1-201ENSMUST00000029331 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Parp8Q3UD82 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Parp8Q3UD82 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Parp8Q3UD82 AC124397.2-201ENSMUST00000225575 2215 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Parp8Q3UD82 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Parp8Q3UD82 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Parp8Q3UD82 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Parp8Q3UD82 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Parp8Q3UD82 Srebf1-201ENSMUST00000020846 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Parp8Q3UD82 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Parp8Q3UD82 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Parp8Q3UD82 Cxcl12-203ENSMUST00000112871 3132 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Parp8Q3UD82 E030013I19Rik-201ENSMUST00000148089 2754 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Parp8Q3UD82 Gm20671-201ENSMUST00000144673 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Parp8Q3UD82 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Parp8Q3UD82 Lnx1-203ENSMUST00000113531 3098 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Parp8Q3UD82 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Parp8Q3UD82 Pcdhga3-201ENSMUST00000073447 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Parp8Q3UD82 Inpp4a-211ENSMUST00000168546 2964 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Parp8Q3UD82 Olfr482-202ENSMUST00000217304 2612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Parp8Q3UD82 Mtmr10-201ENSMUST00000032736 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Parp8Q3UD82 Cttn-201ENSMUST00000033407 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Parp8Q3UD82 4930488L21Rik-201ENSMUST00000181864 3244 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Parp8Q3UD82 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Parp8Q3UD82 Jam3-201ENSMUST00000034472 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Parp8Q3UD82 4632404M16Rik-201ENSMUST00000197326 2882 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Parp8Q3UD82 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Parp8Q3UD82 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Parp8Q3UD82 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Parp8Q3UD82 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Parp8Q3UD82 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Parp8Q3UD82 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Parp8Q3UD82 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Parp8Q3UD82 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Parp8Q3UD82 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Parp8Q3UD82 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Parp8Q3UD82 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Parp8Q3UD82 Cyp2s1-202ENSMUST00000108395 3161 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Parp8Q3UD82 Gm42372-201ENSMUST00000206129 5067 ntAPPRIS P1 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Parp8Q3UD82 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Parp8Q3UD82 Ica1-204ENSMUST00000115520 1876 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Parp8Q3UD82 Tpst1-202ENSMUST00000118993 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Parp8Q3UD82 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Parp8Q3UD82 Gm17244-201ENSMUST00000192482 3416 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Parp8Q3UD82 Prf1-202ENSMUST00000219375 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Parp8Q3UD82 Hsd3b6-201ENSMUST00000029463 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Parp8Q3UD82 Alox12-201ENSMUST00000000329 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Parp8Q3UD82 Sept9-202ENSMUST00000093907 3616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Parp8Q3UD82 AC122291.1-201ENSMUST00000228937 5748 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Parp8Q3UD82 Zfp654-202ENSMUST00000207826 6261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Parp8Q3UD82 Matn2-201ENSMUST00000022947 3551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Parp8Q3UD82 Gm21103-202ENSMUST00000170923 1761 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Parp8Q3UD82 Spats2l-211ENSMUST00000169772 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Parp8Q3UD82 Tex2-201ENSMUST00000042780 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Parp8Q3UD82 Slc39a14-202ENSMUST00000068044 4926 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Parp8Q3UD82 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Parp8Q3UD82 Atp8a2-202ENSMUST00000131670 1725 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Parp8Q3UD82 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Parp8Q3UD82 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Parp8Q3UD82 Gm42463-201ENSMUST00000198041 4886 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Parp8Q3UD82 Ngfr-201ENSMUST00000000122 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Parp8Q3UD82 Trub2-201ENSMUST00000048044 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Parp8Q3UD82 Vps54-202ENSMUST00000109578 4273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Parp8Q3UD82 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Parp8Q3UD82 Prr12-201ENSMUST00000057293 7023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Parp8Q3UD82 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Parp8Q3UD82 Tspyl4-201ENSMUST00000047935 3879 ntAPPRIS P1 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Parp8Q3UD82 Lipo2-201ENSMUST00000147153 3562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Parp8Q3UD82 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Parp8Q3UD82 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Parp8Q3UD82 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Parp8Q3UD82 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Parp8Q3UD82 1810014B01Rik-202ENSMUST00000218095 1622 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Parp8Q3UD82 Mb21d1-202ENSMUST00000070742 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Parp8Q3UD82 Neu2-206ENSMUST00000166259 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Parp8Q3UD82 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Parp8Q3UD82 Zcchc8-204ENSMUST00000196282 4350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Parp8Q3UD82 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Parp8Q3UD82 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Parp8Q3UD82 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.7 ms