Protein–RNA interactions for Protein: Q3U595

UPF0545 protein C22orf39 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U595 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Q3U595 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Q3U595 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Q3U595 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Q3U595 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Q3U595 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Q3U595 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Q3U595 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Q3U595 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Q3U595 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Q3U595 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Q3U595 Myo16-201ENSMUST00000042103 6725 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Q3U595 Rims2-202ENSMUST00000082054 4800 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Q3U595 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Q3U595 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Q3U595 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Q3U595 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Q3U595 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Q3U595 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Q3U595 Sertad2-201ENSMUST00000093292 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Q3U595 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Q3U595 Zfp597-201ENSMUST00000090522 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Q3U595 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Q3U595 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Q3U595 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Q3U595 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Q3U595 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Q3U595 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Q3U595 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Q3U595 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Q3U595 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Q3U595 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Q3U595 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Q3U595 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Q3U595 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Q3U595 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Q3U595 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Q3U595 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Q3U595 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Q3U595 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Q3U595 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Q3U595 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Q3U595 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Q3U595 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Q3U595 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Q3U595 Klhdc7b-202ENSMUST00000225666 3951 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Q3U595 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Q3U595 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Q3U595 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Q3U595 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Q3U595 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Q3U595 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Q3U595 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Q3U595 Rapgef3-204ENSMUST00000128775 3586 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Q3U595 Ambra1-203ENSMUST00000099712 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Q3U595 Pcdhga3-201ENSMUST00000073447 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Q3U595 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Q3U595 Vsig10l-201ENSMUST00000107977 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Q3U595 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Q3U595 Dsc2-202ENSMUST00000075214 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Q3U595 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Q3U595 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Q3U595 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Q3U595 AC156031.2-201ENSMUST00000213107 3310 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Q3U595 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Q3U595 Fbn2-201ENSMUST00000025497 10480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Q3U595 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Q3U595 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Q3U595 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Q3U595 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Q3U595 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Q3U595 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Q3U595 Sec23a-201ENSMUST00000021375 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Q3U595 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Q3U595 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Q3U595 Otud7b-202ENSMUST00000090785 8101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Q3U595 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Q3U595 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Q3U595 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Q3U595 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Q3U595 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Q3U595 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Q3U595 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Q3U595 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Q3U595 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Q3U595 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Q3U595 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Q3U595 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Q3U595 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Q3U595 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Q3U595 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Q3U595 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Q3U595 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Q3U595 Stk10-201ENSMUST00000102821 5026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Q3U595 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Q3U595 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Q3U595 Robo3-201ENSMUST00000034643 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Q3U595 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Q3U595 Stat5b-202ENSMUST00000107358 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Q3U595 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49 ms